Alfa 1-antihimotripsin

Alfa 1-antihimotripsin
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	1AS4, 1QMN, 2ACH, 3CAA, 3DLW, 4CAA
Identifikatori
Aliasi	SERPINA3
Vanjski ID-jevi	OMIM: 107280 MGI: 98377 HomoloGene: 111129 GeneCards: SERPINA3
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 14 (čovjek)
Kraj	94,624,055 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 12 (miš)
Kraj	104,312,403 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• peptidase inhibitor activity; • vezivanje sa DNK; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • serine-type endopeptidase inhibitor activity;
Ćelijska komponenta	• blood microparticle; • Egzosom; • intracellular anatomical structure; • jedro; • platelet alpha granule lumen; • extracellular region; • Vanćelijsko; • secretory granule lumen; • azurophil granule lumen; • collagen-containing extracellular matrix;
Biološki proces	• regulation of lipid metabolic process; • negative regulation of peptidase activity; • inflammatory response; • maintenance of gastrointestinal epithelium; • acute-phase response; • platelet degranulation; • negative regulation of endopeptidase activity; • neutrophil degranulation;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	12
	20714
	ENSG00000196136
	ENSMUSG00000058207
	P01011
	P07759
	NM_001085
	NM_011458
	NP_001076
	NP_035588
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Alfa 1-antihimotripsin (simbol α₁AC,^[5] A1AC ili a1ACT) jest alfa globulinski glikoprotein, natporodice serpina, koji je kod ljudi kodiran genom SERPINA3 sa hromosoma 14.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 423 aminokiseline, a molekulska težina 47.651 Da.

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MERMLPLLAL	GLLAAGFCPA	VLCHPNSPLD	EENLTQENQD	RGTHVDLGLA
SANVDFAFSL	YKQLVLKAPD	KNVIFSPLSI	STALAFLSLG	AHNTTLTEIL
KGLKFNLTET	SEAEIHQSFQ	HLLRTLNQSS	DELQLSMGNA	MFVKEQLSLL
DRFTEDAKRL	YGSEAFATDF	QDSAAAKKLI	NDYVKNGTRG	KITDLIKDLD
SQTMMVLVNY	IFFKAKWEMP	FDPQDTHQSR	FYLSKKKWVM	VPMMSLHHLT
IPYFRDEELS	CTVVELKYTG	NASALFILPD	QDKMEEVEAM	LLPETLKRWR
DSLEFREIGE	LYLPKFSISR	DYNLNDILLQ	LGIEEAFTSK	ADLSGITGAR
NLAVSQVVHK	AVLDVFEEGT	EASAATAVKI	TLLSALVETR	TIVRFNRPFL
MIIVPTDTQN	IFFMSKVTNP	KQA

Funkcija

Alfa 1-antihimotripsin inhibira aktivnost određenih enzima zvanih proteaze, kao što je katepsin G koji se nalazi u neutrofilima i himazama pronađenim u mastocitima, cijepanjem u drugačiji oblik ili konformaciju. Ova aktivnost štiti neka tkiva, kao što je donji respiratorni trakt, od oštećenja uzrokovanih proteolitskim enzimima.^[6]

Ovaj protein se proizvodi u jetri i predstavlja protein akutne faze koji se indukuje tokom upala.

Klinički značaj

Nedostatak ovog proteina je povezan sa bolešću jetre. Identifikovane su mutacije kod pacijenata sa Parkinsonovom bolešću i hroničnom opstruktivnom bolešću pluća.^[7]

Alfa 1-antihimotripsin je također povezan sa patogenezom Alzheimerove bolesti jer pojačava stvaranje amiloidnih fibrila u ovoj bolesti.^[6]

Interakcije

Pokazalo se da alfa 1-antihimotripsin reaguje sa DNAJC1.^[8]

Također pogledajte

Alfa-1 antitripsin

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196136 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000058207 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Logan, Carolynn M.; Rice, M. Katherine (1987). Logan's Medical and Scientific Abbreviations. Philadelphia: J. B. Lippincott Company. str. 3. ISBN 0-397-54589-4.
^ ^a ^b Kalsheker N (1996). "Alpha 1-antichymotrypsin". Int. J. Biochem. Cell Biol. 28 (9): 961–4. doi:10.1016/1357-2725(96)00032-5. PMID 8930118. S2CID 11230631.
^ "Entrez Gene: SERPINA3 serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 3".
^ Kroczynska B, Evangelista CM, Samant SS, Elguindi EC, Blond SY (mart 2004). "The SANT2 domain of the murine tumor cell DnaJ-like protein 1 human homologue interacts with alpha1-antichymotrypsin and kinetically interferes with its serpin inhibitory activity". J. Biol. Chem. 279 (12): 11432–43. doi:10.1074/jbc.M310903200. PMC 1553221. PMID 14668352.

Dopunska literatura

Janciauskiene S, Wright HT (1999). "Inflammation, antichymotrypsin, and lipid metabolism: autogenic etiology of Alzheimer's disease". BioEssays. 20 (12): 1039–46. doi:10.1002/(SICI)1521-1878(199812)20:12<1039::AID-BIES10>3.0.CO;2-Z. PMID 10048303.
Kalsheker N, Morley S, Morgan K (2002). "Gene regulation of the serine proteinase inhibitors alpha1-antitrypsin and alpha1-antichymotrypsin". Biochem. Soc. Trans. 30 (2): 93–8. doi:10.1042/BST0300093. PMID 12023832.

External links

MEROPS online baza podataka za peptidaze i njihove inhibitore: I04.002^{[mrtav link]}
Alpha 1-antichymotrypsin na US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
Lokacija ljudskog genoma SERPINA3 i stranica sa detaljima o genu SERPINA3 u UCSC Genome Browseru.
P01011

Šablon:Serpini Šablon:Alfa globulini

N-vezana proteinska glikozilacija (N-glikozilacija N glikana) na Asn ostatku (Asn-x-Ser/Thr motivi) u glikoproteinima

Glikoproteini su složene bjelančevine koje, uz proteinsku komponentu, sadrže i oligosaharidne lance (glikane). Šećerna komponenta se kovalentno veže za bočne polipeptidne lance. Ta veza se ostvaruje tokom kotranslacijskih ili posttranslacijskih modifikacija. Ovaj proces se označava terminom glikozilacija, kroz koju često prolaze izlučevinski ekstracelularni proteini. Vanjski segmenti proteina čiji su segmenti u ekstracelularnom prostoru su također glikozirani.

N-glikolizacija i O-glikolizacija

Postoje dva tipa glikolizacije:

U N-glizaciji, dodavanje šećera se može desiti na amidnom azotu bočnog lanca asparagina.
U O-glikolizaciji, dodavanje šećera se dešava na hidroksil kisiku na bočnom lancu hidroksilizina, hidroksiprolina, serina ili treonina.

Monosaharidi

Osam uobičajenih šećera u glikoproteinima

Monosaharidi koji se obično nalaze u eukariotskim glikoproteinima:^[1]

Glavni šećeri u glikoproteinima čovjeka^[2]
Šećer	Tip	Skraćenica
β-D-Glukoza	Heksoza	Glc
β-D-Galaktoza	Heksoza	Gal
β-D-Manoza	Heksoza	Man
α-L-Fukoza	Deoksiheksoza	Fuc
N-Acetilgalaktozamin	Aminoheksoza	GalNAc
N-Acetilglukozamin	Aminoheksoza	GlcNAc
N-Acetilneuraminska kiselina	Aminononulosonska kiselina (Sijalinska kiselina)	NeuNAc
Ksiloza	Pentoza	Xyl

Šećerna grupa ili grupe pomažu savijanje ili održavanje stabilnosti proteina.

Glikoproteini su široko rasprostranjeni u žjezdanim tkivima životinja koja sintetiziraju sekrete i ekskrete.^[3] Osobito značajne integracijske membranski komponente, koje učestvuju u međućelijskim interakcijama. Formiraju se i u citosolu, ali su njihove funkcije i način formiraja, kao i moguće modifikacije manje poznati. Komponente su mnogih tkivnih antigen]a ((krvnih grupa, npr.)

Reference

^ Murray R. K., Granner D. K., Rodwell V. W. (2006): Harper's Illustrated Biochemistry 27th Ed. McGraw–Hill, New York.
^ Glycan classification Arhivirano 27. 10. 2012. na Wayback Machine SIGMA
^ Sofradžija A., Šoljan D., Hadžiselimović R. (1996): Biologija 1, Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-686-8.

Također pogledajte

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196136 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000058207 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[loganabbrev-5] Logan, Carolynn M.; Rice, M. Katherine (1987). Logan's Medical and Scientific Abbreviations. Philadelphia: J. B. Lippincott Company. str. 3. ISBN 0-397-54589-4.

[kalsheker-6] Kalsheker N (1996). "Alpha 1-antichymotrypsin". Int. J. Biochem. Cell Biol. 28 (9): 961–4. doi:10.1016/1357-2725(96)00032-5. PMID 8930118. S2CID 11230631.

[7] "Entrez Gene: SERPINA3 serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 3".

[pmid14668352-8] Kroczynska B, Evangelista CM, Samant SS, Elguindi EC, Blond SY (mart 2004). "The SANT2 domain of the murine tumor cell DnaJ-like protein 1 human homologue interacts with alpha1-antichymotrypsin and kinetically interferes with its serpin inhibitory activity". J. Biol. Chem. 279 (12): 11432–43. doi:10.1074/jbc.M310903200. PMC 1553221. PMID 14668352.

[Murray-9] Murray R. K., Granner D. K., Rodwell V. W. (2006): Harper's Illustrated Biochemistry 27th Ed. McGraw–Hill, New York.

[10] Glycan classification Arhivirano 27. 10. 2012. na Wayback Machine SIGMA

[11] Sofradžija A., Šoljan D., Hadžiselimović R. (1996): Biologija 1, Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-686-8.

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]

[7]

[8]

[1]

[2]

[3]