Homolog kornihonskog proteina je protein koji je kod ljudi kodiran genom CNIH.[5][6]

CNIH
Identifikatori
AliasiCNIH1
Vanjski ID-jeviOMIM: 611287 MGI: 1277202 HomoloGene: 4219 GeneCards: CNIH1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za CNIH
Genomska lokacija za CNIH
Bend14q22.2Početak54,423,561 bp[1]
Kraj54,441,391 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za CNIH
Genomska lokacija za CNIH
Bend14|14 C1Početak47,013,024 bp[2]
Kraj47,025,868 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005776
NM_001009551

NM_009919
NM_001355011

RefSeq (bjelančevina)

NP_005767

NP_034049
NP_001341940

Lokacija (UCSC)Chr 14: 54.42 – 54.44 MbChr 14: 47.01 – 47.03 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Scott (2007) je locorao gen CNIH na poziciji 14q22.2 hromosoma 14, na osnovu popravnanja sekvence CNIH (GenBank AC099790) sa genomskom sekvencom (36.2).[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 144 aminokiseline, a molekulska težina 16.699 Da.[8]

1020304050
MAFTFAAFCYMLALLLTAALIFFAIWHIIAFDELKTDYKNPIDQCNTLNP
LVLPEYLIHAFFCVMFLCAAEWLTLGLNMPLLAYHIWRYMSRPVMSGPGL
YDPTTIMNADILAYCQKEGWCKLAFYLLAFFYYLYGMIYVLVSS
Simboli

Kloniranje i ekspresija

uredi

U potrazi za genima induciranim tokom rane faze aktivacije T-ćelija, Utku et al. (1999) identificirali su ljudski homolog Drosophila cornichon (cni). Diferencijalnim prikazom RT-PCR proizvoda dobili su fragment koji je korišten za identifikaciju kompletne cDNK CNIH-a, koju su označili kao TGAM77. CNIH kodira izvedeni protein od 134 aminokiseline sa 63% homologije sa proteinom vinske mušice. Northern blot analizom otkriven je 1,4-kb CNIH transkript na visokim nivoima u srcu, jetri, skeletnim mišićima, gušterači, kori i srži nadbubrežnih žlijezda, štitnjači, sjemenicima, slezeni, slijepom crijevu, limfocitima periferne krvi i koštanoj srži, te na niskim nivoima u mozgu, posteljici, plućima, bubrezima, jajnicima, tankom crijevu, želucu, limfnim čvorovima, timusu i fetusnoj jetri.

Castro et al. (2007) klonirali su ljudski CNIH pune dužine i otkrili da kodira izvedeni protein od 144 aminokiseline. Poput homologa drozofile i kvasca, sadrži tri transmembranska domena (TMD). Prva predviđena petlja između TMD1 i TMD2 ima tri konzervirana kiselinska ostatka i predviđa se da će se sučdeliti s lumenom endoplazmatskog retikuluma. Predviđa se da će segment između TMD2 i TMD3 biti u citosolu.

Funkcija gena

uredi

Northern blot i RT-PCR analizom, Utku et al. (1999) potvrdili su regulaciju CNIH tokom aktivacije T-ćelija.[9]

Bokel et al. (2006) pokazali su da je Drosophila cornichon član konzervirane porodice proteina koja uključuje Erv14p, protein kvaščeve membrane potreban za aksijalno pupanje koji je dio ranog sekretornog puta i javlja se u vezikulama proteinskog sloja II (COPII). Kod Drosophila, cni je potreban za transport TGF-alfa faktora rasta gurken (Grk) do površine oocita i najvjerojatnije regrutuje Grk u vezikule COPII.[10]

Castro et al. (2007) pokazali su da je ljudski CNIH nadopunio gubitak Erv14p u kvascu. Eksperimenti imunofluorescencije pokazali su da su ljudski proteini i proteini Drosophila primarno lokalizirani u endoplazmatskom retikulumu, gdje se povezuju sa nezrelim (tj. neglikoziliranim) proteinima povezanim s TGF-alfa. TGF-alfa proteini se prvo sintetišu kao transmembranski proteini tipa I sa venćelijskim EGF domenskom jezgrom koje je potrebno za vezivanje i aktivaciju receptora. Da bi se dobio topljivi oblik u sekretornom Golgijevom putu uklanja se ektodomen, nakon transporta iz ER. Prekomjerna ekspresija CNIH uzrokovala je zadržavanje TGF-alfa proteina u ER. Zaključili su da je protein kornihon potreban za selektivni transport i sazrijevanje TGF-alfa proteina.[11]

Schwenk et al. (2009), proteasomskom analizom, demonstrirali su da se većina AMPA receptora u mozgu pacova spaja sa dva člana porodice kornihonskih transmembranskih proteina, umjesto sa transmembranskim regulatornim proteinima AMPA receptora (TARP). Sklapanje homologa kornihona 2 (CNIH2; 611288) i CNIH3 utiče na AMPA receptore na dva načina: kornihoni povećavaju površinsku ekspresiju AMPA receptora i mijenjaju prolazak kanala, značajno usporavajući kinetiku deaktivacije i desenzibilizacije. Zaključili su da su njihovi rezultati pokazali da su kornihoni suštinske pomoćne podjedinice nativnih AMPA receptora i pružaju molekulske odrednice za glutamatergijsku neurotransmisiju u centralnom nervnom sistemu.[12]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100528 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015759 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Utku N, Bulwin GC, Beinke S, Heinemann T, Beato F, Randall J, Schnieders B, Sandhoff K, Volk HD, Milford E, Gullans SR (maj 1999). "The human homolog of Drosophila cornichon protein is differentially expressed in alloactivated T-cells". Biochim Biophys Acta. 1449 (3): 203–10. doi:10.1016/S0167-4889(99)00026-9. PMID 10209299.
  6. ^ "Entrez Gene: CNIH cornichon homolog (Drosophila)".
  7. ^ Scott, A. F. Personal Communication. Baltimore, Md. 7/18/2007.
  8. ^ "UniProt, O95406". Pristupljeno 22. 7. 2021.
  9. ^ Utku, N., Bulwin, G.-C., Beinke, S., Heinemann, T., Beato, F., Randall, J., Schnieders, B., Sandhoff, K., Volk, H.-D., Milford, E., Gullans, S. R. The human homolog of Drosophila cornichon protein is differentially expressed in alloactivated T-cells. Biochim. Biophys. Acta 1449: 203-210, 1999. PubMed: 10209299
  10. ^ Bokel, C., Dass, S., Wilsch-Brauninger, M., Roth, S. Drosophila cornichon acts as cargo receptor for ER export of the TGF-alpha-like growth factor gurken. Development 133: 459-470, 2006. PubMed: 16396907
  11. ^ Castro, C. P., Piscopo, D., Nakagawa, T., Derynck, R. Cornichon regulates transport and secretion of TGF-alpha-related proteins in metazoan cells. J. Cell Sci. 120: 2454-2466, 2007. PubMed: 17607000
  12. ^ Schwenk, J., Harmel, N., Zolles, G., Bildl, W., Kulik, A., Heimrich, B., Chisaka, O., Jonas, P., Schulte, U., Fakler, B., Klocker, N. Functional proteomics identify cornichon proteins as auxiliary subunits of AMPA receptors. Science 323: 1313-1319, 2009. PubMed: 19265014

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi
  • CNIH lokacija ljudskog genoma UCSC Genome Browser.

CNIH human gene details in the UCSC Genome Browser.