PCR u realnom vremenu
PCR u realnom vremenu ili kvantitativna polimerazna lančana reakcija (eng. Real-Time Polymerase Chain Reaction), skraćeno RTPCR, je laboratorijska tehnika u molekularnoj biologiji koja je bazirana na polimeraznoj lančanoj reakciji (PCR). Primjenjuje se za umnožavanje i simultanu detekciju ili kvantifikaciju culjane molekule DNK. Postupak slijedi opšti princip polimerazne lančane reakcije, a ključno obilježje je karakteristika je da se umnožena DNK otkriva kako reakcija napreduje, u "realnom vremenu". Ovo je novi pristup u odnosu na standardnu PCR, gdje se detektira proizvod reakcije na svom kraju. Dva uobičajena metoda za detekciju proizvoda u kvantitativnom PCR-u su:
- nespecifični fluorescentnom bojom koja je umetnuta u bilo koji od dva polulanca DNK, i
- sekvencno-specifične DNK sonde, sastavljene od oligonukleotida, označenih fluorescentnim reporterom koji dopušta detekciju tek nakon hibridizacije sonde sa svojom komplementarnom sekvencom i kvantificira RNK (iRNK) i nekodirajuću RNK u ćelijama ili tkivu.
Kao minimum informacija za objavljivanje rezultta kvantitativnih RT-PCR eksperimenata (MIQE), zvanično uputstvo je predložilo smjernicu da se skraćenica qPCR koristiti za PCR u realnom vremenu kvantitativno i da se RT-qPCR koristiti za reverznu transkripciju -qPCR.[1] Akronim "RT-PCR" obično označava reverznu transkripciju lančane reakcije polimeraze, a ne real-time PCR, ali svi autori se izgleda ne pridržavaju ove konvencije.[2]
Reference
uredi- ^ http://www.clinchem.org/content/55/4/611.long
- ^ Logan J., Edwards K., Saunders N. (2009): Real-Time PCR: Current technology and applications. Caister Academic Press, ISBN 978-1-904455-39-4.