ULK4
UNC51-kinazoliki protein 4 jest protein /enzim koji je kod ljudi kodiran genom ULK4 sa hromosoma 3.[5]
| ULK4 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | ULK4 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 617010 MGI: 1921622 HomoloGene: 41205 GeneCards: ULK4 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 3: 41.25 – 41.96 Mb | Chr 9: 120.78 – 121.11 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
U jednoj studiji iz 2021., polazi se od konstatacije da je glioblastom je najmaligniji tumor mozga među odraslima. Uprkos multimodalnom liječenju, ostaje neizlječiv, uglavnom zbog svoje ekstenzivne heterogenosti i infiltracije u moždanom parenhimu. Nedavni dokazi ukazuju na disregulaciju ekspresije proteina promijelocitne leukemije (PML) u primarnim uzorcima glioblastoma. PML je na različite načine uključen u biologiju raka. U mozgu, PML učestvuje u fiziološkoj migraciji neuralnih progenitornih ćelija, za koje se pretpostavlja da služe kao ćelije porekla glioblastoma. Uloga PML-a u progresiji glioblastoma je nedavno privukla pažnju zbog njegovih kontroverznih efekata na ukupnu evoluciju glioblastoma. U svom radu proučavali su ulogu PML-a u patofiziološkim promjenama glioblastoma, koristeći U87MG ćelijsku liniju. Genetički su modificirali ćelije da uslovno prekomerno eksprimiraju PMLizoformu IV i fokusirali se na njegovu dvostruku ulogu u rastu tumora i invazivnom kapacitetu. Nadalje, ciljali su na medijator djelovanja PML-a, izmjenjivač Zeste-homologa 2 (EZH2), preko inhibitornog lijeka DZNeP. Predstavili su kombinovani in vitro-in silico pristup, koji koristi 2D i 3D kulture i računske algoritme koji predviđaju rak, kako bi se razlikovali i interpretirali uočeni biološki rezultati. Ukupni nalazi pokazuju da PML reguliše rast i invaziju putem različitih ćelijskih mehanizama.
Konkretno, prekomjerna ekspresija PML-a potiskuje ćelijsku proliferaciju, dok održava invazivni kapacitet ćelija glioblastoma U87MG i, nakon inhibicije PML-EZH2 puta, invazija se drastično eliminira. In silico simulacije sugeriraju da osnovni mehanizam fiziologije glioblastoma vođenog PML-om regulira invaziju, diferencijalnom modulacijom adhezivnog i difuznog kapaciteta ćelija od ćelije do ćelije. Dalje razjašnjavanje uloge PML-a u biologiji glioblastoma moglo bi postaviti PML kao potencijalni molekulski biomarker progresije tumora i njegovog posredovanog puta kao terapeutsku metu, s ciljem inhibicije rasta ćelija i potencijalno klonske evolucije u pogledu njihovog proliferativnog i/ili invazivnog fenotipa unutar heterogene tumorske mase.[6]
Aminokiselinska sekvenca uredi
Dužina polipeptidnog lanca je 1.275 aminokiselina, a molekulska težina 142.442 Da.[5]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MENFILYEEI | GRGSKTVVYK | GRRKGTINFV | AILCTDKCKR | PEITNWVRLT | ||||
| REIKHKNIVT | FHEWYETSNH | LWLVVELCTG | GSLKTVIAQD | ENLPEDVVRE | ||||
| FGIDLISGLH | HLHKLGILFC | DISPRKILLE | GPGTLKFSNF | CLAKVEGENL | ||||
| EEFFALVAAE | EGGGDNGENV | LKKSMKSRVK | GSPVYTAPEV | VRGADFSISS | ||||
| DLWSLGCLLY | EMFSGKPPFF | SESISELTEK | ILCEDPLPPI | PKDSSRPKAS | ||||
| SDFINLLDGL | LQRDPQKRLT | WTRLLQHSFW | KKAFAGADQE | SSVEDLSLSR | ||||
| NTMECSGPQD | SKELLQNSQS | RQAKGHKSGQ | PLGHSFRLEN | PTEFRPKSTL | ||||
| EGQLNESMFL | LSSRPTPRTS | TAVEVSPGED | MTHCSPQKTS | PLTKITSGHL | ||||
| SQQDLESQMR | ELIYTDSDLV | VTPIIDNPKI | MKQPPVKFDA | KILHLPTYSV | ||||
| DKLLFLKDQD | WNDFLQQVCS | QIDSTEKSMG | ASRAKLNLLC | YLCVVAGHQE | ||||
| VATRLLHSPL | FQLLIQHLRI | APNWDIRAKV | AHVIGLLASH | TAELQENTPV | ||||
| VEAIVLLTEL | IRENFRNSKL | KQCLLPTLGE | LIYLVATQEE | KKKNPRECWA | ||||
| VPLAAYTVLM | RCLREGEERV | VNHMAAKIIE | NVCTTFSAQS | QGFITGEIGP | ||||
| ILWYLFRHST | ADSLRITAVS | ALCRITRHSP | TAFQNVIEKV | GLNSVINSLA | ||||
| SAICKVQQYM | LTLFAAMLSC | GIHLQRLIQE | KGFVSTIIRL | LDSPSTCIRA | ||||
| KAFLVLLYIL | IYNREMLLLS | CQARLVMYIE | RDSRKTTPGK | EQQSGNEYLS | ||||
| KCLDLLICHI | VQELPRILGD | ILNSLANVSG | RKHPSTVQVK | QLKLCLPLMP | ||||
| VVLHLVTSQV | FRPQVVTEEF | LFSYGTILSH | IKSVDSGETN | IDGAIGLTAS | ||||
| EEFIKITLSA | FEAIIQYPIL | LKDYRSTVVD | YILPPLVSLV | QSQNVEWRLF | ||||
| SLRLLSETTS | LLVNQEFGDG | KEKASVDSDS | NLLALIRDVL | LPQYEHILLE | ||||
| PDPVPAYALK | LLVAMTEHNP | TFTRLVEESK | LIPLIFEVTL | EHQESILGNT | ||||
| MQSVIALLSN | LVACKDSNME | LLYEQGLVSH | ICNLLTETAT | LCLDVDNKNN | ||||
| NEMAAPLLFS | LLDILHSMLT | YTSGIVRLAL | QAQKSGSGED | PQAAEDLLLL | ||||
| NRPLTDLISL | LIPLLPNEDP | EIFDVSSKCL | SILVQLYGGE | NPDSLSPENV | ||||
| EIFAHLLTSK | EDPKEQKLLL | RILRRMITSN | EKHLESLKNA | GSLLRALERL | ||||
| APGSGSFADS | AVAPLALEIL | QAVGH |
Funkcija uredi
Ovaj gen kodira protein koji se koristi za funkciju transferaza, kinaza i serin/treonin proteín kinaza. Ima mjesto vezanja sa adenozin-trifosfatnim nukleotidima.
Fenotipovi za ULK4 gen uredi
- MGI mutantni fenotipovi za ULK4
- zaključeno iz dva alela
- fenotip nervnog sistema
- fenotip rasta/veličine/regije tijela
- ćelijskI fenotip
- fenotip kardiovaskularnog sistema
- ponašanje/neurološki fenotip
- fenotip imunskog sistema
- fenotip respiratornog sistema
- smrtnost/starenje
- fenotip endokrinih/egzokrinih žlijezda
- fenotip digestivnog/alimentarnog trakta
- slušni/vestibulumski/ušni fenotip
- fenotip skeleta
- kraniofacijalni fenotip
- Povećana infekcija virusom vakcinije (VACV).
- nema efekta
- smanjena održivost
- obilje shRNK <= 25%
- povećana ekspresija NF-kappaB reportera
- smanjena migracija ćelija
- povećana osjetljivost na ionizirajuće zračenje
- povećan sadržaj G1 DNK
- povećana vitalnost ćelija nakon pRB stimulacije
- zgusnuti cis- i medijalni Golgijev aparat
- smanjena infekcija virusom Sindbis (SINV).
Uočeno je i povećano kašnjenje mitoze (prometafaza ili problemi s poravnanjem metafaze, MAP), mnogo mikronukleusa (grozdovi), dinamička jedra (šuplja, presavijena ili mala nepravilna), smanjena vitalnost (ćelijska smrt).
Vanjski linkovi uredi
Reference uredi
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168038 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040936 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b "UniProt, Q96C45" (jezik: engleski). Pristupljeno 18. 9. 2017.
- ^ Maria Tampakaki, Mariam-Eleni Oraiopoulou, Eleftheria Tzamali, Giorgos Tzedakis, Takis Makatounakis, Giannis Zacharakis, Joseph Papamatheakis, Vangelis Sakkalis (2021): PML Differentially Regulates Growth and Invasion in Brain Cancer. Int J Mol Sci, 22(12):6289; pmid: 34208139; pmcid: pmc8230868; doi: 10.3390/ijms22126289