SLC25A20
Karnitin-acilkarnitin translokaza jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom CACT sa hromosoma 3. Odgovoran je za pasivni transport karnitinskog kompleksa i karnitin-masne kiseline, kroz unutrašnju mitohondrijsku membranu kao dio karnitinskog šatl sistema.
Aminokiselinska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 301 aminokiselina, а molekulska težina 32.944 Da.[5]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MADQPKPISP | LKNLLAGGFG | GVCLVFVGHP | LDTVKVRLQT | QPPSLPGQPP | ||||
| MYSGTFDCFR | KTLFREGITG | LYRGMAAPII | GVTPMFAVCF | FGFGLGKKLQ | ||||
| QKHPEDVLSY | PQLFAAGMLS | GVFTTGIMTP | GERIKCLLQI | QASSGESKYT | ||||
| GTLDCAKKLY | QEFGIRGIYK | GTVLTLMRDV | PASGMYFMTY | EWLKNIFTPE | ||||
| GKRVSELSAP | RILVAGGIAG | IFNWAVAIPP | DVLKSRFQTA | PPGKYPNGFR | ||||
| DVLRELIRDE | GVTSLYKGFN | AVMIRAFPAN | AACFLGFEVA | MKFLNWATPN | ||||
| L |
Funkcija
urediMasni acil-karnitin može difundirati iz citosola preko porozne vanjske mitohondrijske membrane u intermembranski prostor, ali mora koristiti CACT da pređe neporoznu unutrašnju mitohondrijsku membranu i dođe do mitohondrijalnog matriksa. CACT je kotransporter, koji vraća jednu molekulu karnitina iz matriksa u međumembranski prostor, dok jedna molekula masnog acil-karnitina odlazi u matriks.[6]
Klinički značaj
urediPoremećaj je povezan sa nedostatkom karnitin-acilkarnitin translokaze. Ovaj poremećaj remeti karnitinski šatl sistem od kretanja masnih kiselina kroz mitohondrijsku membranu, što dovodi do smanjenja katabolizma masnih kiselina. Rezultat je nakupljanje masnih kiselina u mišićima i jetri, smanjena tolerancija na dugotrajno vježbanje, nemogućnost posta duže od nekoliko sati, slabost i gubitak mišića, te jak kiselkasti miris u dahu (zbog katabolizma proteina).
Modelni organizmi
urediu proučavanju funkcije SLC25A20 korištenI su Modelni organizmi. Uslovna nokaut-mišja linija pod nazivom Slc25a20tm1a(EUCOMM)Wtsi generirana je na Institutu Wellcome Trust Sanger.[7] Mužjaci i ženke uključeni su u standardizovani fenotipski pregled[8] za određivanje efekata delecija .[9][10][11][12] Urađeni su dodatni pregledi: Dubinskom imunološkom fenotipizacijom [13]
| Svojstvo | Fenotip |
|---|---|
| Svi podaci raspoloživi.[8][13] | |
| Leukociti periferne krvi 6 sedmica | Normalan |
| Insulin | Normalan |
| Hematologija 6 sedmica | Normalan |
| Vijabilnost homozigota na P14 | Nenormalan |
| Studija recesivne letalnosti | Normalan |
| Tjelesna težina | Normalan |
| Neurološka procjena | Normalan |
| Snaga stiska | Normalan |
| Dismorfologija | Normalan |
| Indirektna kalorimetrija | Nenormalan |
| Test tolerancije glukoze | Normalan |
| Slušni odgovor moždanog stabla | Normalan |
| DEXA | Normalan |
| Radiografija | Normalan |
| Morfologija oka | Normalan |
| Klinička hemija | Normalan |
| Hematologija 16 sedmica | Normalan |
| Leukociti periferne krvi 16 sedmica | Normalan |
| Težina srca | Normalan |
| Salmonella infekcija | Normalan |
| Funkcija citotoksičnih T-ćelija | Normalan |
| Imunofenotipizacija slezene | Normalan |
| Imunofenotipizacija mezenternog limfnog čvora | Normalan |
| Imunofenotipizacija koštane srži | Normalan |
| Kompozicija epidermne imunosti | Normalan |
| Izazov gripe | Normalan |
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000178537 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032602 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "UniProt, O43772" (jezik: engleski). Pristupljeno 5. 11. 2021.
- ^ "Principles of biochemistry, 2nd edition, edited by Albert Lehninger, David Nelson, and Michael Cox, Worth Publishers, Inc., New York, 1992, 1012 pp, $67.95". Molecular Reproduction and Development. 37 (4): 477. april 1994. doi:10.1002/mrd.1080370421. ISSN 1040-452X.
- ^ Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: high throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ a b "International Mouse Phenotyping Consortium".
- ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (Jun 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (Jun 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (Jan 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Mouse Genetics Project, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (2013). "Genome-wide generation and systematic phenotyping of knockout mice reveals new roles for many genes". Cell. 154 (2): 452–64. doi:10.1016/j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.
- ^ a b "Infection and Immunity Immunophenotyping (3i) Consortium".[trajno mrtav link]