Ektonukleozidna trifosfat-difosfohidrolaza 5 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom ENTPD5.[5][6][7]

ENTPD5
Identifikatori
AliasiENTPD5
Vanjski ID-jeviOMIM: 603162 MGI: 1321385 HomoloGene: 37457 GeneCards: ENTPD5
EC broj3.6.1.42
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za ENTPD5
Genomska lokacija za ENTPD5
Bend14q24.3Početak73,958,010 bp[1]
Kraj74,019,399 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za ENTPD5
Genomska lokacija za ENTPD5
Bend12 D1|12 39.18 cMPočetak84,420,631 bp[2]
Kraj84,455,803 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija guanosine-diphosphatase activity
uridine-diphosphatase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
hydrolase activity
nucleoside-diphosphatase activity
Ćelijska komponenta Endoplazmatski retikulum
extracellular region
Biološki proces 'de novo' posttranslational protein folding
ATP metabolic process
GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation
protein N-linked glycosylation
Ćelijska proliferacija
positive regulation of glycolytic process
regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
nucleobase-containing small molecule catabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001249
NM_001321984
NM_001321985
NM_001321986
NM_001321987

NM_001321988
NM_001330189
NM_001382256
NM_001382257
NM_001382258
NM_001382259
NM_001382260
NM_001382262
NM_001382263

NM_001026214
NM_001286049
NM_001286058
NM_007647

RefSeq (bjelančevina)
NP_001240
NP_001308913
NP_001308914
NP_001308915
NP_001308916

NP_001308917
NP_001317118
NP_001369185
NP_001369186
NP_001369187
NP_001369188
NP_001369189
NP_001369191
NP_001369192

NP_001021385
NP_001272978
NP_001272987
NP_031673

Lokacija (UCSC)Chr 14: 73.96 – 74.02 MbChr 12: 84.42 – 84.46 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Fluorescentnom in situ hibridizacijom i analizom veza, Chadwick et al. (1998) locirali su gen MNTPaze na mišjem hromosomu 12, u regiji koja pokazuje homologiju sinteze sa ljudskim hromozomom 14q. Analizom hibridnih ploča hibridnih i somatskih zračenih ćelija, Chadwick i Frischauf (1998) potvrdili su da se CD39L4 nalazi na ljudskom hromosomu 14, pozicija q24. Zaključili su da je CD39L4 ljudski homolog MNTPaze.[8]

ENTPD5 je sličan nukleotidazama E-tipa (NTPaze)/ekto-ATPaza/apirazama. NTPaze, poput CD39, posreduju katabolizam vanćelijskih nukleotida. ENTPD5 sadrži četiri konzrrvirane regije apiraza, što je karakteristično za NTPaze.[7]

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 428 aminokiselina, a molekulska težina 47.517 Da.[9].

1020304050
MATSWGTVFFMLVVSCVCSAVSHRNQQTWFEGIFLSSMCPINVSASTLYG
IMFDAGSTGTRIHVYTFVQKMPGQLPILEGEVFDSVKPGLSAFVDQPKQG
AETVQGLLEVAKDSIPRSHWKKTPVVLKATAGLRLLPEHKAKALLFEVKE
IFRKSPFLVPKGSVSIMDGSDEGILAWVTVNFLTGQLHGHRQETVGTLDL
GGASTQITFLPQFEKTLEQTPRGYLTSFEMFNSTYKLYTHSYLGFGLKAA
RLATLGALETEGTDGHTFRSACLPRWLEAEWIFGGVKYQYGGNQEGEVGF
EPCYAEVLRVVRGKLHQPEEVQRGSFYAFSYYYDRAVDTDMIDYEKGGIL
KVEDFERKAREVCDNLENFTSGSPFLCMDLSYITALLKDGFGFADSTVLQ
LTKKVNNIETGWALGATFHLLQSLGISH
Simboli

Kloniranje i ekspresija uredi

Nukleozidne trifosfataze (NTPaze) su dvovalentni transmembranski glikoproteini koji zavise od kationa i hidroliziraju vanćelijske nukleozidne tri– i/ili difosfate. NTPaze karakterizira prisustvo četiri motiva poznata kao regije konzervirane apiraze (ACR). Chadwick et al. (1998) identificirali su cDNK koje kodiraju mišju NTPazu, simbolizirajući MNTPazu. Pretražujući EST bazu podataka za sekvence slične onim MNTPaze, Chadwick i Frischauf (1998) identificirali su cDNK koje odgovaraju dvama ljudskim genimaa, CD39L2 i CD39L4. Kodirajuće regije mišjeg i ljudskog gena CD39L4 dijele 88% identiteta nukleotidne sekvence. Predviđeni protein CD39L4 od 428 aminokiselina sadrži sva četiri ACR-a, jedan N-terminalni transmembranski segment i veliki vanćelijski C-terminalni domen. Northern blot analiza otkrila je da je CD39L4 eksprimiran kao iRNK od 4,8 kb u svim testiranim tkivima. Nekoliko manjih traka takođe je primijećeno u tkivima sa najjačom ekspresijom CD39L4.[10]

Fang et al (2010) pokazali su da je Entpd5 označen fluorescencijom lokaliziran markerom endoplazmatskog retikuluma (ER) u mišjim embrionskim fibroblastima(MEF).

Funkcija gena uredi

PCR analizom cDNK biblioteka, Mulero et al. (1999) otkrili su CD39L4 samo u makrofagima. Funkcionalnom i Western blot analizom utvrđeno je da je aktivnost ADPaze i nukleotid-difosfataze izlučenog proteina od 51 kD pojačana prisustvom dvovalentnih kationa. Liječenje glikozidazom ili tunikamicinom (Mulero et al., 2000) smanjilo je veličinu proteina na predviđenih 46 kD i smanjilo količinu sekrecije; za razliku od CD39L3, međutim, nije umanjio enzimsku aktivnost.[11][12] Fang et al. (2010) pokazali su da in vitro translatirani ENTPD5 hidrolizira UDP i GDP, ali ne i druge nukleotide. Delecija Ptena u MEF rezultira aktivacijom puta PI3 kinaze / Akt, koji promovira rast i preživljavanje ćelija, uz istovremeno povećanje translacije proteina. Pokazali su da su ekspresija Entpd5 i hidroliza ATP značajno povišeni u Pten –/– MEF. Masenom spektrometrijskom analizom identificirani su ENTPD5, UMP/CMP kinaza-1 (CMPK1) i adenilat-kinaza-1 (AK1) kao komponente ciklusa hidrolize ATP u HeLa ćelijama. Unutar ovog ciklusa, ENTPD5 je pružio kritične UMP ili GMP kofaktore za hidrolizu ATP u AMP i nedostatak bilo kojeg od tri enzima koji su ugrozili hidrolizu ATP. Nokdaun Entpd5 u Pten –/– MEF povećao je ekspresiju markera ER stresa, smanjio N-glikozilaciju proteina i smanjio proizvodnju laktata. Western blot, imunohistokemijske i analize mikromreža pokazale su da je regulacija ENTPD5 korelirala s aktivacijom AKT-a u ljudskim ćelijskim linijama karcinoma prostate i primarnim uzorcima tumora prostate. Nokdaun ENTPD5 u LNCaP ćelijaa kamrcinoma prostate smanjio je rast tumora kod golih miševa. Zaključili su da ENTPD5 ima kritičnu ulogu u N-glikozilaciji i doprinosi Warburgovom efektu, tj. povišenoj proizvodnji laktata u aerobnim uvjetima, u ćelijama tumora.[13]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187097 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021236 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Chadwick BP, Frischauf AM (Oct 1997). "Cloning and mapping of a human and mouse gene with homology to ecto-ATPase genes". Mamm Genome. 8 (9): 668–72. doi:10.1007/s003359900534. PMID 9271669.
  6. ^ Chadwick BP, Frischauf AM (Oct 1998). "The CD39-like gene family: identification of three new human members (CD39L2, CD39L3, and CD39L4), their murine homologues, and a member of the gene family from Drosophila melanogaster". Genomics. 50 (3): 357–67. doi:10.1006/geno.1998.5317. PMID 9676430.
  7. ^ a b "Entrez Gene: ENTPD5 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5".
  8. ^ Chadwick, B. P., Frischauf, A.-M. The CD39-like gene family: identification of three new human members (CD39L2, CD39L3, and CD39L4), their murine homologues, and a member of the gene family from Drosophila melanogaster. Genomics 50: 357-367, 1998. PubMed: 9676430
  9. ^ "UniProt, O75356". Pristupljeno 24. 7. 2021.
  10. ^ Chadwick, B. P., Williamson, J., Sheer, D., Frischauf, A.-M. cDNA cloning and chromosomal mapping of a mouse gene with homology to NTPases. Mammalian Genome 9: 162-164, 1998. PubMed: 9457681
  11. ^ Mulero, J. J., Yeung, G., Nelken, S. T., Bright, J. M., McGowan, D. W., Ford, J. E. Biochemical characterization of CD39L4. Biochemistry 39: 12924-12928, 2000. PubMed: 11041857
  12. ^ Mulero, J. J., Yeung, G., Nelken, S. T., Ford, J. E. CD39-L4 is a secreted human apyrase, specific for the hydrolysis of nucleoside diphosphates. J. Biol. Chem. 274: 20064-20067, 1999. PubMed: 10400613
  13. ^ Fang, M., Shen, Z., Huang, S., Zhao, L., Chen, S., Mak, T. W., Wang, X. The ER UDPase ENTPD5 promotes protein N-glycosylation, the Warburg effect, and proliferation in the PTEN pathway. Cell 143: 711-724, 2010. PubMed: 21074248

Dopunska literatura uredi