Cistein peptidaza

(Preusmjereno sa Cistein proteaza)

Cisteinske proteaze – poznate i kao tiolske proteaze – su enzimi koji degradiraju proteine. Ove proteaze imaju zajedničke katalitske mehanizme koji uključuju nukleofilni cisteinski tiol u katalitskoj trijadi ili dijadi.

Cisteinska peptidaza
Papain enzyme.png
Kristalna struktura cistein peptidaze papainskog kompleksa sa kovalentnim inhibitorom E-64.
Identifikatori
SimbolPeptidase_C1
PfamPF00112
Pfam klanCL0125
InterProIPR000668
SMARTSM00645
PROSITEPDOC00126
MEROPSC1
SCOP21aec / SCOPe / SUPFAM
OPM superporodica420
OPM protein1m6d
Dostupne proteinske strukture:
Pfam  strukture / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumsažetak strukture

Csteinske proteazw su općenito nalaze u voću, uključujući papaju, ananas smokvu i kivi. Proporcija proteaza je veća u nezrelom voću. Ustvari, poznato je nekoliko porodica čiji predstavnici sadrže cistein proteaze.[1] Cisteinske proteaze se upotrebljavaju kao ingradijenti – sastojci za učvršćivanje mesa.[2]

[3][4][5][6]

KlasifikacijaUredi

MEROPS sistem klasifikacije proteaza uračunava 14 proteinskih superfamilija plus nekoliko neoznačenih (do 2013.), a svaka sadrži mnogo familija. Svaka superporodica ima katalitsku trijadu ili dijadu u različitim proteinskim naborima i tako ukazuju na konvergentnu evoluciju katalitskog mehanizma.

Za proteinske superfamilije, P = superfamilija sadrži mješavinu nukleofila familija klase, C = čista cisteinska proteazna superfamilija. U svakoj superfamiliji, proteinske familije su označene kafrakterističnim nukleofilom (C = cistein proteaze).

Familije cistein proteaza

Supefamilija Familija Primjeri
CA C1, C2, C6, C10, C12, C16, C19, C28, C31, C32, C33, C39, C47, C51, C54, C58, C64,

C65, C66, C67, C70, C71, C76, C78, C83, C85, C86, C87, C93, C96, C98, C101

Papain (Carica papaya),[7] bromelain (Ananas comosus), katepsin K (metilj)[8] i kalpain (Homo sapiens)[9]
CD C11, C13, C14, C25, C50, C80, C84 Kaspaza-1 (Rattus norvegicus) i separaza (Saccharomyces cerevisiae)
CE C5, C48, C55, C57, C63, C79 Adenain (ljudski adenovirus tip 2)
CF C15 Piroglutamil-peptidaza I (Bacillus amyloliquefaciens)
CL C60, C82 Sortaza A (Staphylococcus aureus)
CM C18 Hepatitis C virus peptidaza 2 (Hepatitis C virus)
CN C9 Sindbis virus-tipe nsP2 peptidaza (sindbis virus)
CO C40 Dipeptidil-peptidaza VI (Lysinibacillus sphaericus)
CP C97 DeSI-1 peptidaza (Mus musculus)
PA C3, C4, C24, C30, C37, C62, C74, C99 TEV proteaza (Etch virus duhana)
PB C44, C45, C59, C69, C89, C95 Prekursor amidofosphoribosiltransferaze (Homo sapiens)
PC C26, C56 Gama-glutamil hidrolaza (Rattus norvegicus)
PD C46 Ježni rotein (Drosophila melanogaster)
PE P1 DmpA aminopeptidaza (Ochrobactrum anthropi)
Neoznačeni C7, C8, C21, C23, C27, C36, C42, C53, C75

Također pogledajteUredi

ReferenceUredi

  1. ^ Domsalla A, Melzig MF (juni 2008). "Occurrence and properties of proteases in plant latices". Planta Med. 74 (7): 699–711. doi:10.1055/s-2008-1074530. PMID 18496785.
  2. ^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.
  3. ^ Ibrulj S., Haverić S., Haverić A. (2008): Citogenetičke metode – Primjena u medicini . Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo,ISBN 978-9958-9344-5-2.
  4. ^ Hadžiselimović R., Pojskić N. (2005): Uvod u humanu imunogenetiku. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-3-4.
  5. ^ Sofradžija A., Šoljan D., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 1, Svjetlost, Sarajevo
  6. ^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.
  7. ^ Mitchel, R. E.; Chaiken, I. M.; Smith, E. L. (1970). "The complete amino acid sequence of papain. Additions and corrections". The Journal of Biological Chemistry. 245 (14): 3485–92. PMID 5470818.
  8. ^ Sierocka, I; Kozlowski, L. P.; Bujnicki, J. M.; Jarmolowski, A; Szweykowska-Kulinska, Z (2014). "Female-specific gene expression in dioecious liverwort Pellia endiviifolia is developmentally regulated and connected to archegonia production". BMC Plant Biology. 14: 168. doi:10.1186/1471-2229-14-168. PMC 4074843. PMID 24939387.
  9. ^ Sorimachi, H; Ohmi, S; Emori, Y; Kawasaki, H; Saido, T. C.; Ohno, S; Minami, Y; Suzuki, K (1990). "A novel member of the calcium-dependent cysteine protease family". Biological chemistry Hoppe-Seyler. 371 Suppl: 171–6. PMID 2400579.

Vanjski linkoviUredi