Tkivni faktor, također zvani trombocitni tkivni faktor, faktor III, u CD142, je protein kodiran genom F3, prisutan u subendotelnom tkivu i leukocitima. Njegova uloga u procesu zgrušavanja je pokretanje stvaranja trombina iz zimogenskog protrombina. Tromboplastin definira kaskadu koja vodi do aktivacije faktora X—puta tkivnog faktora. Čineći to, zamijenio je prethodno imenovani vanjski put, kako bi se eliminirala dvosmislenost.

F3
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1AHW, 1BOY, 1DAN, 1FAK, 1J9C, 1JPS, 1O5D, 1TFH, 1UJ3, 1W0Y, 1W2K, 1WQV, 1WSS, 1WTG, 1WUN, 1WV7, 1Z6J, 2A2Q, 2AEI, 2AER, 2B7D, 2B8O, 2C4F, 2CEF, 2CEH, 2CEZ, 2CFJ, 2EC9, 2F9B, 2FIR, 2FLB, 2HFT, 2PUQ, 2ZP0, 2ZWL, 2ZZU, 3ELA, 3TH2, 3TH3, 3TH4, 4IBL, 4M7L, 4Z6A, 4ZMA, 4YLQ, 2FLR

Identifikatori
AliasiF3
Vanjski ID-jeviOMIM: 134390 MGI: 88381 HomoloGene: 1511 GeneCards: F3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za F3
Genomska lokacija za F3
Bend1p21.3Početak94,529,173 bp[1]
Kraj94,541,759 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 3 (miš)
Hrom.Hromosom 3 (miš)[2]
Hromosom 3 (miš)
Genomska lokacija za F3
Genomska lokacija za F3
Bend3 G1|3 52.94 cMPočetak121,517,186 bp[2]
Kraj121,528,697 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0016518 cytokine receptor activity
phospholipid binding
serine-type endopeptidase activity
protease binding
Ćelijska komponenta membrana
GO:0005578 Vanćelijski matriks
intrinsic component of external side of plasma membrane
ćelijska membrana
extracellular region
Egzosom
cell surface
Vanćelijsko
serine-type peptidase complex
integral component of membrane
collagen-containing extracellular matrix
Biološki proces Hemostaza
positive regulation of protein kinase B signaling
positive regulation of endothelial cell proliferation
cytokine-mediated signaling pathway
positive regulation of cell migration
activation of blood coagulation via clotting cascade
positive regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
positive regulation of angiogenesis
blood coagulation, extrinsic pathway
activation of plasma proteins involved in acute inflammatory response
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
positive regulation of positive chemotaxis
Koagulacija (krv)
protein processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001993
NM_001178096

NM_010171

RefSeq (bjelančevina)

NP_001171567
NP_001984

NP_034301

Lokacija (UCSC)Chr 1: 94.53 – 94.54 MbChr 3: 121.52 – 121.53 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Funkcija

uredi

Gen F3 kodira faktor koagulacije III, koji je glikoprotein ćelijske površine. Ovaj faktor omogućava ćelijama da započnu kaskade koagulacije krvi, i funkcioniše kao receptor visokog afiniteta za faktor zgrušavanja VII. Rezultirajući kompleks pruža katalitski događaj koji je odgovoran za pokretanje kaskada koagulacijskih proteaza specifičnom ograničenom proteolizom. Za razliku od ostalih kofaktora ovih proteaznih kaskada, koji cirkulišu kao nefunkcionalni prekursori, ovaj faktor je moćan inicijator koji je potpuno funkcionalan kada se eksprimira na površini ćelija. Postoje tri različita domena ovog faktora: vanćelijski, transmembranski i citoplazmatski. Ovaj protein je jedini u putu koagulacije kod kojeg urođeni nedostatak nije opisan.[5] Pored tkivnog faktora vezanog na membranu, pronađen je i rastvorljivi oblik tkivnog faktora koji je rezultat alternativno prerađenog transkripata iRNK tkivnog faktora , u kojem nedostaje egzon 5, a egzon 4 je spojen direktno na egzon 6.[6][7]

Koagulacija

uredi
 
Koagulacijska kaskada

TF je receptor ćelijske površine za serin-proteazni faktor VIIa.

Najpoznatija funkcija tkivnog faktora je njegova uloga u koagulaciji krvi. Kompleks TF sa faktorom VIIa katalizira konverziju neaktivne proteaze faktora X u aktivnu proteazu faktora Xa.

Zajedno sa faktorom VIIa, tkivni faktor formira ekstrinzični put koagulacije. Ovo je suprotno unutrašnjem (amplifikacijskom) putu, koji uključuje i aktivirani faktor IX i faktor VIII. Oba puta dovode do aktivacije faktora X (uobičajeni put), koji se kombinuje sa aktiviranim faktorom V u prisustvu kalcija i fosfolipida za proizvodnju trombina (aktivnost tromboplastina ).

Citokinska signalizacija

uredi

TF je srodan poridici proteina poznatoj kao porodica citokinskih receptora klase II. Članove ove porodice receptora aktiviraju citokini. Citokini su mali proteini koji mogu uticati na ponašanje bijelih krvnih ćelija. Također je utvrđeno da vezivanje VIIa za TF pokreće signalne procese unutar ćelije. Signalna funkcija TF/VIIa ima ulogu u angiogenezi i apoptozama. Proupalni i proangiogeni odgovori aktiviraju se cijepanjem posredovanim TF/VIIa receptorom 2 aktiviranim proteazom (PAR2).[8] EphB2 i EphA2 iz porodice receptora Eph tirozin-kinaza (RTK) također se mogu otcijepiti pomoću TF/VIIa.[9]

Struktura

uredi

Tkivni faktor pripada natporodici citokinskih receptora i sastoji se od tri domena:<:[10]

  1. vanćelijski domen, koji se sastoji od dva fibronektinskog modula tipa III čija se hidrofobna jezgra spajaju u interfejsu domen-domen. Ovo služi kao (vjerovatno kruti) šablon za faktor VIIa vezivanje;
  2. transmembranski domen;
  3. citosolni domen dužine 21 aminokiseline unutar ćelije koji je uključen u signalnu funkciju TF.

Imajte na umu da se jedan od domena faktora VIIa, GLA-domen, vezuje u prisustvu kalcija za negativno naelektrisane fosfolipide, i ovo vezivanje u velikoj meri pojačava vezivanje faktora VIIa za tkivni faktor.

Tkivna distribucija

uredi

Neke ćelije oslobađaju TF kao odgovor na oštećenje krvnih sudova (vidi sljedeći paragraf), a neke samo kao odgovor na upalne medijatore (endotelne ćelije/makrofage).

TF se eksprimira u ćelijama koje normalno nisu izložene krvotoku koji teče, kao što su subendotelne ćelije (npr. ćelije glatkih mišića i ćelije koje okružuju krvne sudove (npr. fibroblasti). Ovo se može promijeniti kada je krvni sud oštećen, naprimjer, fizičkom ozljedom ili rupturom aterosklerotskog plaka. Izlaganje ćelija koje eksprimiraju TF tokom povrede omogućava formiranje kompleksa TF sa faktorom VII. Faktor VII i TF formiraju ekvimolarni kompleks u prisustvu iona kalcija, što dovodi do aktivacije faktora VII na površini membrane.

Unutrašnja površina krvnog suda sastoji se od endotelnih ćelija. Endotelne ćelije ne eksprimiraju TF, osim kada su izložene upalnim molekulama kao što je faktor nekroze tumora-alfa (TNF-alfa). Drugi tip ćelija koji eksprimira TF na površini ćelije u upalnim stanjima je monocit (bijela krvna zrnca).

Tromboplastin

uredi

Historijski gledano, tromboplastin je bio laboratorijski reagens, obično izveden iz placentnih izvora, koji se koristio za ispitivanje protrombinskog vremena (PT-vrijeme). Tromboplastin, sam po sebi, može aktivirati vanjski put koagulacije. Kada se manipuliše u laboratoriji, mogao bi se stvoriti derivat nazvan parcijalni tromboplastin, koji se koristio za mjerenje unutrašnjeg puta. Ovaj test se naziva aPTT, ili aktivirano parcijalno tromboplastinsko vrijeme. Tek mnogo kasnije su identifikovane potkomponente tromboplastina i parcijalnog tromboplastina. Tromboplastin sadrži fosfolipide kao i tkivni faktor, koji su oboje potrebni za aktivaciju vanjskog puta, dok parcijalni tromboplastin ne sadrži tkivni faktor. Tkivni faktor nije potreban da bi se aktivirao unutrašnji put.

Interakcije

uredi

Pokazalo se da tkivni faktor reaguje sa faktorom VII.[11][12]

Dodatne slike

uredi

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000117525 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028128 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: F3 coagulation factor III (thromboplastin, tissue factor)".
  6. ^ Guo W, Wang H, Zhao W, Zhu J, Ju B, Wang X (januar 2001). "Effect of all-trans retinoic acid and arsenic trioxide on tissue factor expression in acute promyelocytic leukemia cells". Chinese Medical Journal. 114 (1): 30–4. PMID 11779431.
  7. ^ Bogdanov VY, Balasubramanian V, Hathcock J, Vele O, Lieb M, Nemerson Y (april 2003). "Alternatively spliced human tissue factor: a circulating, soluble, thrombogenic protein". Nature Medicine. 9 (4): 458–62. doi:10.1038/nm841. PMID 12652293. S2CID 13173744.
  8. ^ Ruf W, Disse J, Carneiro-Lobo TC, Yokota N, Schaffner F (juli 2011). "Tissue factor and cell signalling in cancer progression and thrombosis". Journal of Thrombosis and Haemostasis. 9 Suppl 1 (Suppl 1): 306–15. doi:10.1111/j.1538-7836.2011.04318.x. PMC 3151023. PMID 21781267.
  9. ^ Eriksson O, Ramström M, Hörnaeus K, Bergquist J, Mokhtari D, Siegbahn A (novembar 2014). "The Eph tyrosine kinase receptors EphB2 and EphA2 are novel proteolytic substrates of tissue factor/coagulation factor VIIa". The Journal of Biological Chemistry. 289 (47): 32379–91. doi:10.1074/jbc.M114.599332. PMC 4239594. PMID 25281742.
  10. ^ Muller YA, Ultsch MH, de Vos AM (februar 1996). "The crystal structure of the extracellular domain of human tissue factor refined to 1.7 A resolution". Journal of Molecular Biology. 256 (1): 144–59. doi:10.1006/jmbi.1996.0073. PMID 8609606.
  11. ^ Carlsson K, Freskgård PO, Persson E, Carlsson U, Svensson M (juni 2003). "Probing the interface between factor Xa and tissue factor in the quaternary complex tissue factor-factor VIIa-factor Xa-tissue factor pathway inhibitor". European Journal of Biochemistry. 270 (12): 2576–82. doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03625.x. PMID 12787023.
  12. ^ Zhang E, St Charles R, Tulinsky A (februar 1999). "Structure of extracellular tissue factor complexed with factor VIIa inhibited with a BPTI mutant". Journal of Molecular Biology. 285 (5): 2089–104. doi:10.1006/jmbi.1998.2452. PMID 9925787.

Dopunska literatuta

uredi

Vanjski linkovi

uredi
  • OMIM: 134390
  • PDB Molecule of the Month Tissue factor—March 2006
  • PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Tissue factor

Šablon:PDB galerija