Naponski ovisna podjedinica 3 kalcijevog kanala alfa2/delta jest protein koji je kod ljudi kodiran genom CACNA2D3 sa hromosoma 3, lokus 3p21.1.[5]

CACNA2D3
Identifikatori
AliasiCACNA2D3
Vanjski ID-jeviOMIM: 606399 MGI: 1338890 HomoloGene: 74929 GeneCards: CACNA2D3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 3 (čovjek)
Hrom.Hromosom 3 (čovjek)[1]
Hromosom 3 (čovjek)
Genomska lokacija za CACNA2D3
Genomska lokacija za CACNA2D3
Bend3p21.1-p14.3Početak54,122,547 bp[1]
Kraj55,074,557 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za CACNA2D3
Genomska lokacija za CACNA2D3
Bend14|14 A3Početak28,626,900 bp[2]
Kraj29,443,821 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija metal ion binding
voltage-gated ion channel activity
calcium channel activity
voltage-gated calcium channel activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
Ćelijska membrana
membrana
Naponom kontrolirani kalcijev kanal
Biološki proces regulation of ion transmembrane transport
ion transport
calcium ion transport
calcium ion transmembrane transport
cardiac conduction
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_018398

NM_009785

RefSeq (bjelančevina)

NP_060868

NP_033915

Lokacija (UCSC)Chr 3: 54.12 – 55.07 MbChr 14: 28.63 – 29.44 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.091 aminokiselina, а molekulska težina 123.011 Da.[6]

1020304050
MAGPGSPRRASRGASALLAAALLYAALGDVVRSEQQIPLSVVKLWASAFG
GEIKSIAAKYSGSQLLQKKYKEYEKDVAIEEIDGLQLVKKLAKNMEEMFH
KKSEAVRRLVEAAEEAHLKHEFDADLQYEYFNAVLINERDKDGNFLELGK
EFILAPNDHFNNLPVNISLSDVQVPTNMYNKDPAIVNGVYWSESLNKVFV
DNFDRDPSLIWQYFGSAKGFFRQYPGIKWEPDENGVIAFDCRNRKWYIQA
ATSPKDVVILVDVSGSMKGLRLTIAKQTVSSILDTLGDDDFFNIIAYNEE
LHYVEPCLNGTLVQADRTNKEHFREHLDKLFAKGIGMLDIALNEAFNILS
DFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDTIFAKYNWPDRKVRIFTYLIGRE
AAFADNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVIDQEHDV
VWTEAYIDSTLPQAQKLTDDQGPVLMTTVAMPVFSKQNETRSKGILLGVV
GTDVPVKELLKTIPKYKLGIHGYAFAITNNGYILTHPELRLLYEEGKKRR
KPNYSSVDLSEVEWEDRDDVLRNAMVNRKTGKFSMEVKKTVDKGKRVLVM
TNDYYYTDIKGTPFSLGVALSRGHGKYFFRGNVTIEEGLHDLEHPDVSLA
DEWSYCNTDLHPEHRHLSQLEAIKLYLKGKEPLLQCDKELIQEVLFDAVV
SAPIEAYWTSLALNKSENSDKGVEVAFLGTRTGLSRINLFVGAEQLTNQD
FLKAGDKENIFNADHFPLWYRRAAEQIPGSFVYSIPFSTGPVNKSNVVTA
STSIQLLDERKSPVVAAVGIQMKLEFFQRKFWTASRQCASLDGKCSISCD
DETVNCYLIDNNGFILVSEDYTQTGDFFGEIEGAVMNKLLTMGSFKRITL
YDYQAMCRANKESSDGAHGLLDPYNAFLSAVKWIMTELVLFLVEFNLCSW
WHSDMTAKAQKLKQTLEPCDTEYPAFVSERTIKETTGNIACEDCSKSFVI
QQIPSSNLFMVVVDSSCLCESVAPITMAPIEIRYNESLKCERLKAQKIRR
RPESCHGFHPEENARECGGAPSLQAQTVLLLLPLLLMLFSR

Funkcija uredi

Ovaj gen kodira člana porodice alfa-2/delta podjedinica, proteina u kompleksu kalcijski kanal zavisnom od napona. Kalcijski kanali posreduju u dotoku iona kalcija u ćeliju nakon polarizacije membrane i sastoje se od kompleksa alfa-1, alfa-2/delta, beta i gama podjedinica u omjeru 1:1:1:1. Postoje različite verzije svake od ovih podjedinica, ili eksprimirane iz sličnih gena ili rezultat alternativne prerade. Istraživanja na vrlo sličnom proteinu kod kunića sugeriraju da se opisani protein cijepa na alfa-2 i delta podjedinicu. Uočene su alternativne transkripcijske varijante transkripta ovog gena, ali nisu detaljno okarakterisane.

Klinički značaj uredi

Brojne studije prijavile su povezanost između metilacija gena CACNA2D3 i kancera.

Rak dojke uredi

Utišavanje transkripcije gena CACNA2D3 ovisno o metilaciji može doprinijeti metastatskom fenotipu karcinom dojke. Analiza metilacije u CACNA2D3 CpG otoka može imati potencijal kao biomarker za rizik od razvoja metastatske bolesti.[7]

Rak želuca uredi

Gubitak ekspresije gena CACNA2D3 preko aberantne hipermetilacije promotora može doprinijeti karcinogenezi želuca, a metilacija CACNA2D3 je koristan prognostički marker za pacijente s uznapredovalim rakom želuca.[8] Fizičko vježbanje korelirano je sa nižom učestalošću metilacija CACNA2D3-a.[9]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000157445 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021991 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Calcium channel, voltage-dependent, alpha 2/delta subunit 3".
  6. ^ "UniProt, Q8IZS8" (jezik: engleski). Pristupljeno 2. 11. 2021.
  7. ^ Palmieri C, Rudraraju B, Monteverde M, Lattanzio L, Gojis O, Brizio R, Garrone O, Merlano M, Syed N, Lo Nigro C, Crook T (2012). "Methylation of the calcium channel regulatory subunit α2δ-3 (CACNA2D3) predicts site-specific relapse in oestrogen receptor-positive primary breast carcinomas". Br. J. Cancer. 107 (2): 375–81. doi:10.1038/bjc.2012.231. PMC 3394973. PMID 22644305.
  8. ^ Wanajo A, Sasaki A, Nagasaki H, Shimada S, Otsubo T, Owaki S, Shimizu Y, Eishi Y, Kojima K, Nakajima Y, Kawano T, Yuasa Y, Akiyama Y (2008). "Methylation of the calcium channel-related gene, CACNA2D3, is frequent and a poor prognostic factor in gastric cancer". Gastroenterology. 135 (2): 580–90. doi:10.1053/j.gastro.2008.05.041. PMID 18588891.
  9. ^ Yuasa Y, Nagasaki H, Akiyama Y, Hashimoto Y, Takizawa T, Kojima K, Kawano T, Sugihara K, Imai K, Nakachi K (2009). "DNA methylation status is inversely correlated with green tea intake and physical activity in gastric cancer patients". Int. J. Cancer. 124 (11): 2677–82. doi:10.1002/ijc.24231. PMID 19170207. S2CID 46627170.

Dopunska literatura uredi

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.

Vanjski linkovi uredi