SERAC1
Protein 1 sa serinskim aktivnim mjestom ili protein SERAC1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SERAC1.[5][6][7] Protein kodiran ovim genom je protein za remodeliranje fosfatidilglicerola, koji se nalazi na spoju mitohondrija i endoplazmatskog retikuluma, gdje posreduje u razmjeni fosfolipida. Kodirani protein ima važnu ulogu u funkciji mitohondrija i prometu unutarćelijskog holesterola. Defekti ovog gena su uzrok 3-metilglutakonske acidurije sa gluhoćom, encefalopatijom i Leighovim sindromom (MEGDEL). Za ovaj gen su pronađene dvije varijante transkripta, jedna koja protein-kodirajuća, a druga nekodirajuća.[5]
| SERAC1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | SERAC1 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 614725 MGI: 2447813 HomoloGene: 41900 GeneCards: SERAC1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 6: 158.11 – 158.17 Mb | Chr 17: 6.09 – 6.13 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Aminokiselinska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 654 aminokiseline, а molekulska težina 74.147 Da.[8]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSLAAYCVIC | CRRIGTSTSP | PKSGTHWRDI | RNIIKFTGSL | ILGGSLFLTY | ||||
| EVLALKKAVT | LDTQVVEREK | MKSYIYVHTV | SLDKGENHGI | AWQARKELHK | ||||
| AVRKVLATSA | KILRNPFADP | FSTVDIEDHE | CAVWLLLRKS | KSDDKTTRLE | ||||
| AVREMSETHH | WHDYQYRIIA | QACDPKTLIG | LARSEESDLR | FFLLPPPLPS | ||||
| LKEDSSTEEE | LRQLLASLPQ | TELDECIQYF | TSLALSESSQ | SLAAQKGGLW | ||||
| CFGGNGLPYA | ESFGEVPSAT | VEMFCLEAIV | KHSEISTHCD | KIEANGGLQL | ||||
| LQRLYRLHKD | CPKVQRNIMR | VIGNMALNEH | LHSSIVRSGW | VSIMAEAMKS | ||||
| PHIMESSHAA | RILANLDRET | VQEKYQDGVY | VLHPQYRTSQ | PIKADVLFIH | ||||
| GLMGAAFKTW | RQQDSEQAVI | EKPMEDEDRY | TTCWPKTWLA | KDCPALRIIS | ||||
| VEYDTSLSDW | RARCPMERKS | IAFRSNELLR | KLRAAGVGDR | PVVWISHSMG | ||||
| GLLVKKMLLE | ASTKPEMSTV | INNTRGIIFY | SVPHHGSRLA | EYSVNIRYLL | ||||
| FPSLEVKELS | KDSPALKTLQ | DDFLEFAKDK | NFQVLNFVET | LPTYIGSMIK | ||||
| LHVVPVESAD | LGIGDLIPVD | VNHLNICKPK | KKDAFLYQRT | LQFIREALAK | ||||
| DLEN |
Struktura
urediGen SERAC1 nalazi se na q kraku hromosoma 6, na poziciji 25.3 i obuhvata 58.776 parova baza.Greška kod citiranja: Nevaljana oznaka <ref>;
nevaljani nazivi, npr. možda ih je previše[9] Struktura kodiranog proteina sadrži C-terminalni serin-lipaza/esteraza domen koja sadrži konsenzusni lipazni motiv GxSxG i N-terminalnu signalnu sekvencu.[10]
Funkcija
urediGen SERAC1 kodira protein neophodan za remodeliranje fosfatidilglicerola. Fosfatidilglicerolsako remodeliranje je proces promjene ili preoblikovanja određenog fosfolipida zvanog fosfatidilglicerol. Fosfatidilglicerol pomaže u stvaranju kardiolipina, važnog sastojka koji okružuje unutražšnju mitohondrijsku membranu. Kardiolipin je odgovoran za pretvaranje energije stečene hranom u oblik koji se može koristiti za ćelije i potreban je za pravilnu funkciju mitohondrija. Zbog kardiolipina, proces remodeliranja fosfatidilglicerola bitan je za mitohondrijsku funkciju i unutarćelijski promet holesterola.[6][7][11]
Osim toga, SERAC1 je uključen u promet holesterola, masnih, voštanih tvari unutar ćelija. Holesterol je komponenta ćelijske strukture i proizvodi hormone i probavne kiseline. Protein može biti uključen i u transakcijsku-acilacijsku reakciju za proizvodnju fosfatidilglicerola-36: 1 i bis (monoacilglicerol) fosfatnog biosintetskog puta.[6][7][11]
Klinički značaj
urediMutacije u genu SERAC1 povezane su s oštećenjem mitohondrijske funkcije i unutarćelijskim prometom holesterola.[10] Takve mutacije uglavnom povezane su s Leighovim sindromom i 3-metilglutakonskom acidurijom s gluhoćom, encefalopatijom i Leighovim sindromom, poznatim kao MEGDEL-ski sindrom.[12]
Sindrom MEGDEL
uredi"SERAC1" mutacije su u velikoj mjeri povezane s MGDEL sindromom. MGDEL-sindrom (3-metilglutakonska acidurija s gluhoćom, encefalopatijom i Leigh-ovim sindromom) je autosomno recesivni poremećaj koji karakterizira kasni psihomotorni razvoj ili psihomotorna regresija u djetinjstvu, senzorinervna gluhoća, spazam ili distonija i povećano izlučivanje 3-metilglutakonske kiseline. Snimanje mozga prikazuje cerebrumsku i cerebelumsku atrofija, kao i lezije u baznim ganglijama koje podsjećaju na Leigh ov sindrom. Laboratorijske studije pokazuju povećane serumske laktate i alanin, defekte mitohondrijske oksidativne fosforilacije , abnormalne mitohondrije, abnormalane profile fosfatidilglicerola i kardiolipina u fibroblastima i abnormalno nakupljanje neesterifikovanog holesterola unutar ćelija.[6][7]
"SERAC1" mutacije gena koje uzrokuju ovo stanje smanjuju količinu proteina SERAC1 koji se proizvodi ili dovode do proizvodnje proteina sa malo ili bez funkcije. Kao rezultat toga, poremećeno je remodeliranje fosfatidilglicerola, što vjerovatno mijenja sastav kardiolipina. Istraživanja nagađaju da abnormalni kardiolipin utiče na funkciju mitohondrija, smanjujući proizvodnju ćelijske energije i dovodeći do neuroloških i problema sa sluhom, karakterističnih za MEGDEL sindrom. Nije jasno kako mutacije gena SERAC1 dovode do abnormalnog oslobađanja 3-metilglutakonske kiseline u mokraći.[5][11]
Mutacija A c.202C >T u ovom genu nađena je kod pacijenata koji pate od 3-metilglutakonske acidurije i sličnih simptoma.[13] Utvrđeno je da dva pacijenta s homozigotnom G> C transverzijom u genu SERAC1 pokazuju simptome MEGDEL sindroma sa gluhoćom, encefalopatijom i Leighovim sindromom.[10] Drugi pacijent sa homozigotnom delecijom 4 bp (1167delTCAG) pokazao je simptome ponavljajućih infekcija, neuspjeh u napredovanju, mentalnu invalidnost, spazme i vsanpiramidne simptome.[14]
Leighov sindrom
urediLeighov sindrom je progresivni neurodegenerativni poremećaj s ranim početkom koji karakterizira prisutnost žarišnih, bilateralnih lezija u jednom ili više područja centralnog nervnog sistema uključujući moždano stablo, talamus, bane ganglije, mali mozak i kičmenu moždinu. Kliničke značajke ovise o tome koja su područja središnjeg nervnog sistema zahvaćena i uključuju potkožni početak psihomotorne retardacije, hipotoniju, ataksiju, slabost mišića, gubitak vida, abnormalnosti pokreta očiju , napade i disfagiju.[15]
Interakcije
urediPokazano je da SERAC1 ima interakcije protein-protein sa sljedećim.[6][16]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000122335 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015659 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b c "Entrez Gene: Serine active site containing 1". Pristupljeno 24. 7. 2012.
- ^ a b c d e "Protein SERAC1". Pristupljeno 27. 8. 2018.Šablon:CC-notice
- ^ a b c d "UniProt: the universal protein knowledgebase". Nucleic Acids Research. 45 (D1): D158–D169. januar 2017. doi:10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ "UniProt, Q96JX3" (jezik: engleski). Pristupljeno 10. 10. 2021.
- ^ "Protein SERAC1". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Arhivirano s originala, 28. 8. 2018. Pristupljeno 10. 10. 2021.
- ^ a b c Wortmann SB, Vaz FM, Gardeitchik T, Vissers LE, Renkema GH, Schuurs-Hoeijmakers JH, Kulik W, Lammens M, Christin C, Kluijtmans LA, Rodenburg RJ, Nijtmans LG, Grünewald A, Klein C, Gerhold JM, Kozicz T, van Hasselt PM, Harakalova M, Kloosterman W, Barić I, Pronicka E, Ucar SK, Naess K, Singhal KK, Krumina Z, Gilissen C, van Bokhoven H, Veltman JA, Smeitink JA, Lefeber DJ, Spelbrink JN, Wevers RA, Morava E, de Brouwer AP (juni 2012). "Mutations in the phospholipid remodeling gene SERAC1 impair mitochondrial function and intracellular cholesterol trafficking and cause dystonia and deafness". Nature Genetics. 44 (7): 797–802. doi:10.1038/ng.2325. PMID 22683713. S2CID 2447771.
- ^ a b c "SERAC1". Genetics Home Reference. NCBI.
Ovaj članak sadrži tekst iz ovog izvora, koji je u javnom vlasništvu.
- ^ Lumish HS, Yang Y, Xia F, Wilson A, Chung WK (2014). "The Expanding MEGDEL Phenotype: Optic Nerve Atrophy, Microcephaly, and Myoclonic Epilepsy in a Child with SERAC1 Mutations". JIMD Reports. 16: 75–9. doi:10.1007/8904_2014_322. ISBN 978-3-662-44586-0. PMC 4221303. PMID 24997715.
- ^ Tort F, García-Silva MT, Ferrer-Cortès X, Navarro-Sastre A, Garcia-Villoria J, Coll MJ, Vidal E, Jiménez-Almazán J, Dopazo J, Briones P, Elpeleg O, Ribes A (2013). "Exome sequencing identifies a new mutation in SERAC1 in a patient with 3-methylglutaconic aciduria". Molecular Genetics and Metabolism. 110 (1–2): 73–7. doi:10.1016/j.ymgme.2013.04.021. PMID 23707711.
- ^ Wortmann S, Rodenburg RJ, Huizing M, Loupatty FJ, de Koning T, Kluijtmans LA, Engelke U, Wevers R, Smeitink JA, Morava E (maj 2006). "Association of 3-methylglutaconic aciduria with sensori-neural deafness, encephalopathy, and Leigh-like syndrome (MEGDEL association) in four patients with a disorder of the oxidative phosphorylation". Molecular Genetics and Metabolism. 88 (1): 47–52. doi:10.1016/j.ymgme.2006.01.013. PMID 16527507.
- ^ "Leigh syndrome". www.uniprot.org (jezik: engleski).
- ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I, Sasarman F, Weraarpachai W, Shoubridge EA, Warscheid B, Rehling P (decembar 2012). "MITRAC links mitochondrial protein translocation to respiratory-chain assembly and translational regulation". Cell. 151 (7): 1528–41. doi:10.1016/j.cell.2012.11.053. PMID 23260140.
Vanjski linkovi
uredi
Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.