Podjedinica DGCR8 mikroprocesorskog kompleksa (kritična regija 8 DiGeorgeovog sindroma) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom DGCR8 sa hromosoma 22.[4] Kod drugih životinja, posebno kod običnih modelnih organizama Drosophila melanogaster i Caenorhabditis elegans, protein je poznat kao Pasha (eng. kovanica od partner Drosha).[5] To je obavezna komponenta puta RNK interferencija.

DGCR8
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1X47, 2YT4, 3LE4, 5B16

Identifikatori
AliasiDGCR8
Vanjski ID-jeviOMIM: 609030 MGI: 2151114 HomoloGene: 11223 GeneCards: DGCR8
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 22 (čovjek)
Hrom.Hromosom 22 (čovjek)[1]
Hromosom 22 (čovjek)
Genomska lokacija za DGCR8
Genomska lokacija za DGCR8
Bend22q11.21Početak20,080,232 bp[1]
Kraj20,111,877 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija primary miRNA binding
ribonuclease III activity
double-stranded RNA binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
heme binding
protein homodimerization activity
vezivanje iona metala
vezivanje sa RNK
vezivanje identičnih proteina
Ćelijska komponenta citoplazma
microprocessor complex
Jedarce
jedro
nukleoplazma
GO:0097483, GO:0097481 postsynaptic density
Biološki proces regulation of stem cell proliferation
GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing
RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
RNA phosphodiester bond hydrolysis
GO:0061715 miRNA metabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001190326
NM_022720

NM_033324

RefSeq (bjelančevina)

NP_001177255
NP_073557

NP_201581

Lokacija (UCSC)Chr 22: 20.08 – 20.11 Mbn/a
PubMed pretraga[2][3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 773 aminokiseline, а molekulska težina Da. 86 045[6]

1020304050
METDESPSPLPCGPAGEAVMESRARPFQALPREQSPPPPLQTSSGAEVMD
VGSGGDGQSELPAEDPFNFYGASLLSKGSFSKGRLLIDPNCSGHSPRTAR
HAPAVRKFSPDLKLLKDVKISVSFTESCRSKDRKVLYTGAERDVRAECGL
LLSPVSGDVHACPFGGSVGDGVGIGGESADKKDEENELDQEKRVEYAVLD
ELEDFTDNLELDEEGAGGFTAKAIVQRDRVDEEALNFPYEDDFDNDVDAL
LEEGLCAPKKRRTEEKYGGDSDHPSDGETSVQPMMTKIKTVLKSRGRPPT
EPLPDGWIMTFHNSGVPVYLHRESRVVTWSRPYFLGTGSIRKHDPPLSSI
PCLHYKKMKDNEEREQSSDLTPSGDVSPVKPLSRSAELEFPLDEPDSMGA
DPGPPDEKDPLGAEAAPGALGQVKAKVEVCKDESVDLEEFRSYLEKRFDF
EQVTVKKFRTWAERRQFNREMKRKQAESERPILPANQKLITLSVQDAPTK
KEFVINPNGKSEVCILHEYMQRVLKVRPVYNFFECENPSEPFGASVTIDG
VTYGSGTASSKKLAKNKAARATLEILIPDFVKQTSEEKPKDSEELEYFNH
ISIEDSRVYELTSKAGLLSPYQILHECLKRNHGMGDTSIKFEVVPGKNQK
SEYVMACGKHTVRGWCKNKRVGKQLASQKILQLLHPHVKNWGSLLRMYGR
ESSKMVKQETSDKSVIELQQYAKKNKPNLHILSKLQEEMKRLAEEREETR
KKPKMSIVASAQPGGEPLCTVDV

Funkcija

uredi

Podjedinica DGCR8 je nalazi se u ćelijskom jedru i potrebna je za preradu mikroRNK (miRNA). Veže se za drugu podjedinicu Drosha, enzima RNaza III da bi formirao mikroprocesorski kompleks koji cijepa primarni transkript poznat kao pri-miRNK na karakterističnoj strukturu matična petlja poznatoj kao pre-miRNK, koja se zatim dalje obrađuje u fragmente miRNK pomoću enzima Dicer. DGCR8 sadrži RNK-vezujući domen i smatra se da veže pri-miRNK, kako bi je stabilizirala za obradu pomoću Drosha.[7]

DGCR8 je takođe potreban za neke tipove popravke DNK. Uklanjanje UV-indukovane DNK fotoprodukata, tokom transkripcije ekscizijskog popravka (TC-NER), spojenih nukleotidna što zavisi od JNK fosforilacije DGCR8 na serinu 153.[8] Iako je poznato da DGCR8 funkcionira u biogenezi mikroRNK, ova aktivnost nije potrebna za uklanjanje fotoproizvoda uzrokovanih UV- zračenjem ovisno o DGCR8.[8] Nukleotidni popravak ekscizijom također je potreban za popravak oksidativnog oštećenja DNK zbog na vodik-peroksida (H2O2), a osiromašene ćelije u DGCR8 osjetljive su na H2O2.[8]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128191 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Entrez Gene: DGCR8 DiGeorge syndrome critical region gene 8".
  5. ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (Nov 2004). "Processing of primary microRNAs by the Microprocessor complex". Nature. 432 (7014): 231–5. doi:10.1038/nature03049. PMID 15531879.
  6. ^ "UniProt, Q8WYQ5" (jezik: engleski). Pristupljeno 2. 11. 2021.
  7. ^ Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN (2006). "Characterization of DGCR8/Pasha, the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing". Nucleic Acids Research. 34 (16): 4622–9. doi:10.1093/nar/gkl458. PMC 1636349. PMID 16963499.
  8. ^ a b c Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T (2017). "DGCR8 Mediates Repair of UV-Induced DNA Damage Independently of RNA Processing". Cell Rep. 19 (1): 162–174. doi:10.1016/j.celrep.2017.03.021. PMC 5423785. PMID 28380355.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi