Specifični protein za zaustavljanje rasta 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom GAS1.[5][6]

GAS1
Identifikatori
AliasiGAS1
Vanjski ID-jeviOMIM: 139185 MGI: 95655 HomoloGene: 1548 GeneCards: GAS1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za GAS1
Genomska lokacija za GAS1
Bend9q21.33Početak86,944,362 bp[1]
Kraj86,947,506 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za GAS1
Genomska lokacija za GAS1
Bend13 B2|13 31.92 cMPočetak60,322,219 bp[2]
Kraj60,325,179 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta integral component of membrane
anchored component of plasma membrane
ćelijska membrana
anchored component of membrane
membrana
Biološki proces regulation of apoptotic process
regulation of smoothened signaling pathway
ćelijski ciklus
negative regulation of protein processing
cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
cell fate commitment
regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport
developmental growth
negative regulation of mitotic cell cycle
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_002048

NM_008086

RefSeq (bjelančevina)

NP_002039

NP_032112

Lokacija (UCSC)Chr 9: 86.94 – 86.95 MbChr 13: 60.32 – 60.33 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 345 aminokiselina, а molekulska težina 35.693 Da.[7]

1020304050
MVAALLGGGGEARGGTVPGAWLCLMALLQLLGSAPRGSGLAHGRRLICWQ
ALLQCQGEPECSYAYNQYAEACAPVLAQHGGGDAPGAAAAAFPASAASFS
SRWRCPSHCISALIQLNHTRRGPALEDCDCAQDENCKSTKRAIEPCLPRT
SGGGAGGPGAGGVMGCTEARRRCDRDSRCNLALSRYLTYCGKVFNGLRCT
DECRTVIEDMLAMPKAALLNDCVCDGLERPICESVKENMARLCFGAELGN
GPGSSGSDGGLDDYYDEDYDDEQRTGGAGGEQPLDDDDGVPHPPRPGSGA
AASGGRGDLPYGPGRRSSGGGGRLAPRGAWTPLASILLLLLGPLF

Funkcija

uredi

Specifični protein za zaustavljanje rasta 1 ima ulogu u suzbijanju rasta. GAS1 blokira ulazak u S-fazu i sprječava ciklus normalnih i transformiranih ćelija. Gas1 je pretpostavljeni gen supresor tumora.[6]

Otkriće

uredi

Mišićne ćelije, za koje se čini da su zaustavljene u rastu, primijećene su ekspresije gena specifičnog za zaustavljanje rasta-1 (GAS1).[5] U 1988., Gas-1 je prvi put definiran kao jedan od šest gena koji blokiraju transkripcijsku nadreregulaciju NIH3T3 ciklusa od G0 do S-faze.[6] Većina naučnika je dokazala da prekomjerno eksprimirani GAS1 ima funkciju inhibicije rasta i progresije tumora u gliomima. Nadalje, smatralo se da gen GAS1 doprinosi recidivu i predviđanju metastaza u raku debelog crijeva.

Lokacija gena GAS1

uredi

Gen GAS-1 je identificiran kao navodni supresor tumora koji se nalazi na hromosomu 9, sekvenca 9q21.3-22.1 gdje se smatralo da je fragilno mjesto.[8] U 1994., Del Sal G et al. analizirali su 29 metafaza, a tokom eksperimenta uočena su 102 fluorescentna signala. Rezultati su pokazali da stopa ekspresije fluorescentnog signala na hromosomu 9 iznosi 84 (82%).[9] Furthermore, the peak signal density of the fluorescent also observed occurring in the q21.3-22.1 region.[9] Osim toga, neekspresija fluorescentne signalne skupine na bilo kojem drugom hromosomu dodatno pokazuje da se gen Gas1 posebno eksprimira na hromosomu 9q21.3-22.1.[9]

Obilježja GAS1

uredi

Potvrđeno je da zreli gen Gas-1345 čini aminokiselina. Asn117 i aminirani Ser318 dva su posebna položaja koji rezultiraju otkrivanjem jednog N-glikozilacijskog mjesta, odnosno i potencijalnog signalnog peptida.[10]

Struktura gena

uredi

Za Gas1 gen potvrđeno je da je veoma sličan genu GFRα1 (28% sličnosti), dok je Gas1 sastoji samo od dva domena, koji se razlikuju od GFRα1-3 da komponuje tri domena.[11][12] Iako je struktura gena GAS1 slična GFRαs, funkcija GAS1 se uveliko razlikuje od GFRαs budući da gen GAS 1 ima sposobnost vezivanja RET-a nezavisno od liganda.[12][13] S obzirom na sličnost strukture GAS1 i GFRαs, pretpostavljalo se da je GFRα predak proteina GAS1.[13] S obzirom na sekundarnu strukturu, identificirano je da je većina sekundarne strukture sisarskog gena Gas1 uglavnom α-heliksi i da ima dugi nestrukturirani C-terminalni domena.[11]

GAS1 protein rasprostranjen u CNS -u odraslih sisara (centralni nervni sistem). Mozak odraslih miševa opisan je s ekspresijom GAS1 iRNK, a kasnije je odatno potvržen ovaj opis.[14] Western blot analiza je glavni metod koji se koristio u njihovoj praksi i ima značajnu ulogu u uspješnom određivanju distribucije proteina centralnog nervnog sistems (CNS) odraslih.[15] Olfaktorni režanj, caudate-putamen, moždana kora, hipokampus, mesencephalon, medulla oblongata, mali mozak i vratna leđna moždina identificirani su kao specifični dijelovi ekspresije GAS1.[15] Uprkos tome što je obrazac ekspresije u ćelijama astrocita bio ograničeniji, u neuronima je pronađen i GAS1 koji se eksprimira u tom dijelu.

Funkcija

uredi

GAS1 je identificiran kao plejotropni protein sa funkcijom zaustavljanja rasta ćelija i apoptoza. Osim toga, nervni sistem i brojni drugi organi također mogu biti pod velikim uticajem abnormalnog gena Gas1. Razlog ove dvostruke funkcije vjerovatno je uzrokovan sposobnošću interakcije s inhibirane signalne kaskade koju inducira GNDF (Neurotrofni faktor izveden iz glijine ćelijske linije) [14] Osim toga, dokazano je da GAS1 može uveliko uticati na razvojno stanje organa.[16] Tokom razvojne faze GAS1, sugerirano je da razvojni GAS1 ne samo da može inhibirati proliferaciju ćelija, već i kontrolisati ćelijsku smrt, kao i rast malog mozga.[10] Emisija signala proteina GAS 1 povezana je s dva različita tipa proteina transmembranskog receptora, uključujući RET i protein ježevog receptora,[17] GAS1 je stoga određen kao tip višenamjenskog proteina. Ježev signalni put poznat je kao bitan dio tijela koji u velikoj mjeri utiče na tjelesni razvoj i napredovanje raka budući da se sonijski jež može direktno povezati putem GAS1 i dovesti do aktiviranja signalnog puta.[18]

Povezane bolesti

uredi

Hipoplazija bubrega

uredi

Gen GAS1 ima značajnu ulogu u razvoju bubrega. Konzervirani motiv vezivanja DNK, koji se nalazi u promotoru Gas1, direktno se veže pomoću WT1, a zatim se iRNK Gas1 aktivira za transkripciju u NPC.[19] WT1 je potvrđen kao neophodan dio za ekspresiju Gas1 u bubrezima in vivo. Gubitak funkcije GAS1 in vivo rezultira hipoplazijom bubrega sa smanjenom masom nefrona, zbog preranog iscrpljivanja NPC-a.[19] Kod ljudi je fetusni period najvažnija vremenska tačka za indukciju novih nefrona, bez obzira na vrstu sisara, a nakon što je NPCS nestao, ne postoji mogućnost za indukciju novih nefrona.[20]

Mutacija gena

uredi

Gen Gas1 mapiran je metodom hibridizacijom in situ ljudske hromosomske sekvence 9q21.3-q22,[9] a fragilno mjesto gddje se često deletiraju u ljudskim tumorima, posebno akutnoj mijeloidnoj leukemiji i tumorima mjehura.[21] Područje delecije ranog površinskog karcinoma mokraćnog mjehura pokazalo je da se učestala (50%) delecija gena za suzbijanje tumora nalazilo između 9q22 i 9p12-13, područja koje je obuhvatalo položaj gena GAS1 i moglo bi biti početni događaj za bolest raka mjehura.[22] Međutim, studija koju su izveli Simoneau et al. ukazuje da ne postoje mutacije u genu gas1 u 14 primarnih karcinoma mjehura i 10 ćelijskih linija karcinoma mjehura, što znači da mutacija Gas1 nije glavni uzrok izazivanja patogeneze.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000180447 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000052957 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Evdokiou A, Webb GC, Peters GB, Dobrovic A, O'Keefe DS, Forbes IJ, Cowled PA (decembar 1993). "Localization of the human growth arrest-specific gene (GAS1) to chromosome bands 9q21.3-q22, a region frequently deleted in myeloid malignancies". Genomics. 18 (3): 731–3. doi:10.1016/S0888-7543(05)80388-X. PMID 8307588.
  6. ^ a b c "Entrez Gene: GAS1 growth arrest-specific 1".
  7. ^ "UniProt, P54826". Pristupljeno 8. 9. 2021.
  8. ^ Blair IP, Dawkins JL, Nicholson GA (1997). "Fine mapping of the hereditary sensory neuropathy type I locus on chromosome 9q22.1-->q22.3: exclusion of GAS1 and XPA". Cytogenetics and Cell Genetics. 78 (2): 140–4. doi:10.1159/000134649. PMID 9371409.
  9. ^ a b c d Del Sal G, Collavin L, Ruaro ME, Edomi P, Saccone S, Valle GD, Schneider C (mart 1994). "Structure, function, and chromosome mapping of the growth-suppressing human homologue of the murine gas1 gene". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (5): 1848–52. Bibcode:1994PNAS...91.1848D. doi:10.1073/pnas.91.5.1848. PMC 43261. PMID 8127893.
  10. ^ a b Stebel, Marco; Vatta, Paolo; Ruaro, Maria Elisabetta; Del Sal, Giannino; Parton, Robert G.; Schneider, Claudio (11. 9. 2000). "The growth suppressing gas1 product is a GPI-linked protein". FEBS Letters. 481 (2): 152–158. doi:10.1016/s0014-5793(00)02004-4. ISSN 0014-5793. PMID 10996315. S2CID 33219546.
  11. ^ a b Schueler-Furman O, Glick E, Segovia J, Linial M (februar 2006). "Is GAS1 a co-receptor for the GDNF family of ligands?". Trends in Pharmacological Sciences. 27 (2): 72–7. doi:10.1016/j.tips.2005.12.004. PMID 16406089.
  12. ^ a b Cabrera JR, Sanchez-Pulido L, Rojas AM, Valencia A, Mañes S, Naranjo JR, Mellström B (2006). "Gas1 Is Related to the Glial Cell-derived Neurotrophic Factor Family Receptors α and Regulates Ret Signaling". The Journal of Biological Chemistry. 281 (20): 14330–14339. doi:10.1074/jbc.M509572200. hdl:10261/153703. PMID 16551639.
  13. ^ a b Airaksinen MS, Holm L, Hätinen T (2006). "Evolution of the GDNF family ligands and receptors". Brain, Behavior and Evolution (jezik: engleski). 68 (3): 181–90. doi:10.1159/000094087. PMID 16912471. S2CID 44430118.
  14. ^ a b Zarco N, Bautista E, Cuéllar M, Vergara P, Flores-Rodriguez P, Aguilar-Roblero R, Segovia J (oktobar 2013). "Growth arrest specific 1 (GAS1) is abundantly expressed in the adult mouse central nervous system". The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 61 (10): 731–48. doi:10.1369/0022155413498088. PMC 3788624. PMID 23813868.
  15. ^ a b Greška kod citiranja: Nevaljana oznaka <ref>; nije naveden tekst za reference s imenom : 3
  16. ^ Lee, Catherine S.; Fan, Chen-Ming (mart 2001). "Embryonic expression patterns of the mouse and chick Gas1 genes". Mechanisms of Development. 101 (1–2): 293–297. doi:10.1016/s0925-4773(01)00283-0. ISSN 0925-4773. PMID 11231094. S2CID 828060.
  17. ^ Allen BL, Tenzen T, McMahon AP (maj 2007). "The Hedgehog-binding proteins Gas1 and Cdo cooperate to positively regulate Shh signaling during mouse development". Genes & Development. 21 (10): 1244–57. doi:10.1101/gad.1543607. PMC 1865495. PMID 17504941.
  18. ^ Martinelli DC, Fan CM (novembar 2007). "The role of Gas1 in embryonic development and its implications for human disease". Cell Cycle. 6 (21): 2650–5. doi:10.4161/cc.6.21.4877. PMID 17726382.
  19. ^ a b Kann M, Bae E, Lenz MO, Li L, Trannguyen B, Schumacher VA, Taglienti ME, Bordeianou L, Hartwig S, Rinschen MM, Schermer B, Benzing T, Fan CM, Kreidberg JA (april 2015). "WT1 targets Gas1 to maintain nephron progenitor cells by modulating FGF signals". Development. 142 (7): 1254–66. doi:10.1242/dev.119735. PMC 4378252. PMID 25804736.
  20. ^ Greška kod citiranja: Nevaljana oznaka <ref>; nije naveden tekst za reference s imenom : 4
  21. ^ Sreekantaiah C, Baer MR, Preisler HD, Sandberg AA (maj 1989). "Involvement of bands 9q21-q22 in five cases of acute nonlymphocytic leukemia". Cancer Genetics and Cytogenetics. 39 (1): 55–64. doi:10.1016/0165-4608(89)90229-x. PMID 2731148.
  22. ^ Cairns P, Shaw ME, Knowles MA (april 1993). "Initiation of bladder cancer may involve deletion of a tumour-suppressor gene on chromosome 9". Oncogene. 8 (4): 1083–5. PMID 8096074.

Dopunska literatura

uredi