CTRL
Himotripsinolika proteaza CTRL-1 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom CTRL.[5][6] Larsen et al (1993) identificirali su gen CTRL1 na hromosomskoj poziciji 16q22.1.[7]
| CTRL | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | CTRL | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 118888 MGI: 88558 HomoloGene: 37549 GeneCards: CTRL | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 16: 67.93 – 67.93 Mb | Chr 8: 106.66 – 106.66 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 264 aminokiseline, a molekulska težina 28.002 Da.[8].
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLLLSLTLSL | VLLGSSWGCG | IPAIKPALSF | SQRIVNGENA | VLGSWPWQVS | ||||
| LQDSSGFHFC | GGSLISQSWV | VTAAHCNVSP | GRHFVVLGEY | DRSSNAEPLQ | ||||
| VLSVSRAITH | PSWNSTTMNN | DVTLLKLASP | AQYTTRISPV | CLASSNEALT | ||||
| EGLTCVTTGW | GRLSGVGNVT | PAHLQQVALP | LVTVNQCRQY | WGSSITDSMI | ||||
| CAGGAGASSC | QGDSGGPLVC | QKGNTWVLIG | IVSWGTKNCN | VRAPAVYTRV | ||||
| SKFSTWINQV | IAYN |
Kloniranje i ekspresija
urediVođeni identifikacijom ostrva CpG u kozmidnoj inserciji od 40 kb, Larsen et al. (1993) identificirali su skup od pet nepovezanih ljudskih gena na 16q22.1. Jedan od njih nalazio se između gena koji kodira navodnu podjedinicu proteasomskog kompleksa (MECL1) i gena proteinske serin-kinaze . Sekvenca proteina je upoređena sa sekvencama proteina u SWISSPROT bazi podataka i identificirana kao sekvenca proteazazama sličnim himotripsinu (CTRL). Reseland et al. (1997) klonirali su cDNK koje kodiraju serin-proteazu nalik himotripsinu, a koju su nazvali CTRL1, iz biblioteke cDNK ljudske gušterače. Otvoreni okvir čitanja kodira proenzim od 264 aminokiseline koji sadrži navodnu vodeću sekvencu od 18 aminokiselina. Sekvenca je 54% identična onoj kod ljudskog hemotripsina B. Northern blot analiza pokazala je da se gen specifično eksprimira u gušterači. Specifičnost supstrata zrelog enzima razlikovala se od specifičnosti himotripsina B. Enzim CTRL1 bio je aktivan u širokom rasponu pH. Zbog svoje ekspresije u gušterači i prisustva u crijevnoj tečnosti nakon stimulacije sekrecije gušterače, smatrali su vrlo vjerojatnim da je CTRL1 probavni enzim.[9]
Struktura gena
urediLarsen et al. (1993) utvrdili su da CTRL gen ima sedam egzona, pokriva oko 2 kb i transkribira se u istom smjeru kao LCAT i MECL1 gen za proteasom, odakle je odmah nizvodno.
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000141086 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031896 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Larsen F, Solheim J, Kristensen T, Kolsto AB, Prydz H (Feb 1994). "A tight cluster of five unrelated human genes on chromosome 16q22.1". Hum Mol Genet. 2 (10): 1589–95. doi:10.1093/hmg/2.10.1589. PMID 8268911.
- ^ "Entrez Gene: CTRL chymotrypsin-like".
- ^ Larsen, F., Solheim, J., Kristensen, T., Kolsto, A.-B., Prydz, H. A tight cluster of five unrelated human genes on chromosome 16q22.1. Hum. Molec. Genet. 2: 1589-1595, 1993. PubMed: 8268911.
- ^ "UniProt, P40313" (jezik: англ.). Pristupljeno 4. 7. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
- ^ Reseland, J. E., Larsen, F., Solheim, J., Eriksen, J. A., Hanssen, L. E., Prydz, H. A novel human chymotrypsin-like digestive enzyme. J. Biol. Chem. 272: 8099-8104, 1997. PubMed: 9065485
Dopunska literatura
uredi- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Heidtmann HH, Travis J (1994). "A novel chymotrypsin-like serine proteinase from human lung". Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 374 (9): 871–5. doi:10.1515/bchm3.1993.374.7-12.871. PMID 8267879.
- Mastroianni N, De Fusco M, Zollo M, et al. (1996). "Molecular cloning, expression pattern, and chromosomal localization of the human Na-Cl thiazide-sensitive cotransporter (SLC12A3)". Genomics. 35 (3): 486–93. doi:10.1006/geno.1996.0388. PMID 8812482.
- Reseland JE, Larsen F, Solheim J, et al. (1997). "A novel human chymotrypsin-like digestive enzyme". J. Biol. Chem. 272 (12): 8099–104. doi:10.1074/jbc.272.12.8099. PMID 9065485.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Lee M, Calabresi L, Chiesa G, et al. (2002). "Mast cell chymase degrades apoE and apoA-II in apoA-I-knockout mouse plasma and reduces its ability to promote cellular cholesterol efflux". Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 22 (9): 1475–81. doi:10.1161/01.ATV.0000029782.84357.68. PMID 12231569. S2CID 12259302.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Vanjski linkovi
uredi- Lokacija ljudskog genoma CTRL i stranica sa detaljima o genu CTRL u UCSC Genome Browseru.