ACSF3
Član 3 porodice acil-CoA sintetaze jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom ACSF3.[5]
| ACSF3 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | ACSF3 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 614245 MGI: 2182591 HomoloGene: 14958 GeneCards: ACSF3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 16: 89.09 – 89.16 Mb | Chr 8: 122.78 – 122.82 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Struktura
Dužina polipeptidnog lanca je 576 aminokiselina, a molekulska težina 64.130 Da.[6]
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLPHVVLTFR | RLGCALASCR | LAPARHRGSG | LLHTAPVARS | DRSAPVFTRA | ||||
| LAFGDRIALV | DQHGRHTYRE | LYSRSLRLSQ | EICRLCGCVG | GDLREERVSF | ||||
| LCANDASYVV | AQWASWMSGG | VAVPLYRKHP | AAQLEYVICD | SQSSVVLASQ | ||||
| EYLELLSPVV | RKLGVPLLPL | TPAIYTGAVE | EPAEVPVPEQ | GWRNKGAMII | ||||
| YTSGTTGRPK | GVLSTHQNIR | AVVTGLVHKW | AWTKDDVILH | VLPLHHVHGV | ||||
| VNALLCPLWV | GATCVMMPEF | SPQQVWEKFL | SSETPRINVF | MAVPTIYTKL | ||||
| MEYYDRHFTQ | PHAQDFLRAV | CEEKIRLMVS | GSAALPLPVL | EKWKNITGHT | ||||
| LLERYGMTEI | GMALSGPLTT | AVRLPGSVGT | PLPGVQVRIV | SENPQREACS | ||||
| YTIHAEGDER | GTKVTPGFEE | KEGELLVRGP | SVFREYWNKP | EETKSAFTLD | ||||
| GWFKTGDTVV | FKDGQYWIRG | RTSVDIIKTG | GYKVSALEVE | WHLLAHPSIT | ||||
| DVAVIGVPDM | TWGQRVTAVV | TLREGHSLSH | RELKEWARNV | LAPYAVPSEL | ||||
| VLVEEIPRNQ | MGKIDKKALI | RHFHPS |
Gen ACSF3 nalazi se na hromosomu 16, a njegova specifična lokacija je 16q24.3. Gen sadrži 17 egzona.[5] ASCL4 kodira protein od 64,1 kDa koji se sastoji od 576 aminokiselina; podaci dobijeni masenom spektrometrijom potvrđuju kodiranje 20 peptida.[7][8]
Funkcija
urediOvaj gen kodira člana porodice acetil-CoA sintetaza, enzima koji aktiviraju masne kiseline katalizirajući stvaranje tioesterske veze između masnih kiselina i koenzima A. Kodirani protein je lokaliziran u mitohondrijama, ima visoku specifičnost za malonat i metilmalonat i posjeduje aktivnost malonil-CoA sintetaze.[5]
Klinički značaj
urediPokazalo se da mutacije ovog gena uzrokuju kombinirani malonski i metilmalonski poremećaj zvani acidurija.[9] Kombinirana malonska i metilmalonska acidurija (CMAMMA) je stanje koje karakteriziraju visoki nivoi malonske i metilmalonske kiseline, jer nedostaci u ovom genu uzrokuju da se ti metaboliti ne razgrađuju. Bolest se obično dijagnosticira genetičkim ispitivanjem ili višim nivoima metilmalonske od malonske kiseline u mokraći, iako su obje povišene. Poremećaj obično ima simptome u ranom djetinjstvu, prvo započinjući visokim nivoom kiseline u krvi (ketoacidoza). Poremećaj se može ispoljavai kao nehotično zatezanje mišića (distonija), slab tonus mišića (hipotonija), zastoj u razvoju, nemogućnost rasta i debljanja očekivanom brzinom (neuspjeh u napredovanju), nizak šećer u krvi (hipoglikemija) i koma. Neka pogođena djeca mogu čak imati i mikrocefaliju. Drugi ljudi sa CMAMMA ne razvijaju znakove i simptome do odrasle dobi. Te osobe obično imaju neurološke probleme, kao što su napadi, gubitak pamćenja, pad sposobnosti razmišljanja ili psihijatrijske bolesti.[5]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176715 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015016 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b c d "Entrez Gene: Acyl-CoA synthetase family member 3". Pristupljeno 30. 12. 2011.
- ^ "UniProt, Q4G176". Pristupljeno 30. 6. 2021.
- ^ ]Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (Oct 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ "Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB).[trajno mrtav link]
- ^ Alfares A, Nunez LD, Al-Thihli K, Mitchell J, Melançon S, Anastasio N, Ha KC, Majewski J, Rosenblatt DS, Braverman N (septembar 2011). "Combined malonic and methylmalonic aciduria: exome sequencing reveals mutations in the ACSF3 gene in patients with a non-classic phenotype". J. Med. Genet. 48 (9): 602–5. doi:10.1136/jmedgenet-2011-100230. PMID 21785126.
Vanjski linkovi
uredi- Lokacija ljudskog genoma ACSF3 i stranica sa detaljima o genu ACSF3 u UCSC Genome Browseru.
Dopunska literatura
uredi- Watkins, P. A.; Maiguel, D.; Jia, Z.; Pevsner, J. (2007). "Evidence for 26 distinct acyl-coenzyme a synthetase genes in the human genome". The Journal of Lipid Research. 48 (12): 2736–2750. doi:10.1194/jlr.M700378-JLR200. PMID 17762044.