Sfingozin-1-fosfat fosfataza 1 je enzim jokoji je kod ljudi kodiran genom SGPP1.[5][6]

SGPP1
Identifikatori
AliasiSGPP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 612826 MGI: 2135760 HomoloGene: 101696 GeneCards: SGPP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za SGPP1
Genomska lokacija za SGPP1
Bend14q23.2Početak63,684,216 bp[1]
Kraj63,728,065 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za SGPP1
Genomska lokacija za SGPP1
Bend12|12 C3Početak75,761,023 bp[2]
Kraj75,782,503 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija hydrolase activity
sphingosine-1-phosphate phosphatase activity
dihydrosphingosine-1-phosphate phosphatase activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endoplasmic reticulum membrane
Endoplazmatski retikulum
membrana
ćelijska membrana
jedro
nukleoplazma
Biološki proces intrinsic apoptotic signaling pathway
sphingosine metabolic process
sphingolipid biosynthetic process
extrinsic apoptotic signaling pathway
GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 Defosforilacija
sphinganine-1-phosphate metabolic process
sphingolipid metabolic process
ER to Golgi ceramide transport
regulation of keratinocyte differentiation
regulation of epidermis development
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_030791

NM_030750

RefSeq (bjelančevina)

NP_110418

NP_109675

Lokacija (UCSC)Chr 14: 63.68 – 63.73 MbChr 12: 75.76 – 75.78 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Sfingozin-1-fosfat (S1P) je bioaktivni sfingolipidni metabolit koji regulira različite biološke procese. SGPP1 katalizira razgradnju S1P, putem spašavanja i recikliranja sfingozina u dugolančane keramide (Mandala et al., 2000; Le Stunff et al., 2007). Analizom baza podataka, Le Stunff et al. (2002) mapirali su gen SGPP1 na hromosomu 14, sekvenca 14q22.1.[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 441 aminokiselina, a molekulska težina 49.108 Da.[8].

1020304050
MSLRQRLAQLVGRLQDPQKVARFQRLCGVEAPPRRSADRREDEKAEAPLA
GDPRLRGRQPGAPGGPQPPGSDRNQCPAKPDGGGAPNGVRNGLAAELGPA
SPRRAGALRRNSLTGEEGQLARVSNWPLYCLFCFGTELGNELFYILFFPF
WIWNLDPLVGRRLVVIWVLVMYLGQCTKDIIRWPRPASPPVVKLEVFYNS
EYSMPSTHAMSGTAIPISMVLLTYGRWQYPLIYGLILIPCWCSLVCLSRI
YMGMHSILDIIAGFLYTILILAVFYPFVDLIDNFNQTHKYAPFIIIGLHL
ALGIFSFTLDTWSTSRGDTAEILGSGAGIACGSHVTYNMGLVLDPSLDTL
PLAGPPITVTLFGKAILRILIGMVFVLIIRDVMKKITIPLACKIFNIPCD
DIRKARQHMEVELPYRYITYGMVGFSITFFVPYIFFFIGIS
Simboli

Kloniranje i ekspresija

uredi

Analizom EST baze podataka, koristeći kvaščevu S1P fosfolipazu Lbp1 kao upit, nakon čega slijedi RACE biblioteke cDNK mišjeg mozga, Mandala et al. (2000) klonirani mišji Sgpp1, kojeg su nazvali Spp1. Izvedeni mišji protein od 430 aminokiselina ima 17% identiteta aminokiselina s kvascem Lbp1. Northern blot analizom otkriven je transkript od 3,8 kb u svim ispitivanim tkivima miša, s najvećom ekspresijom u jetri i bubrezima i najmanjom u skeletnim mišićima.[9]

Analizom baza podataka, nakon čega slijedi RACE-PCR ljudske placentne cDNK, Le Stunff et al (2002) klonirali su SGPP1. Izvedeni protein od 441 aminokiseline dijeli 76% identiteta aminokiselina sa mišjim homologom. Transfekcija ćelija HJ293 ili jajnika kineskog hrčka (CHO) SGPP1 rezultirala je značajnim povećanjem aktivnosti SGPP1 u membranskim frakcijama. SGPP1 je bio vrlo specifičan prema dugolančanim sfingoidnim fosfatima i razgrađenim S1P, dihidro-S1P i fito-S1P. Aktivnost SGPP1 bila je neovisna o bilo kojim zahtjevima za kationom, uključujući Mg (2+), a EDTA nije inhibirala, ali jeste Zn (2+).[10]

Funkcija gena

uredi

Mandala et al. (2000) pokazali su da je mišji Sgpp1 imao visoko specifičnu aktivnost dihidro-S1P fosfataze koja je funkcionalno nadopunjavala mutanta Lbp1 kvasca. Prekomjerna ekspresija mišjeg Sgpp1 uzrokovala je ćelijsku smrt u ćelijama NIH3T3.

Le Stunff et al. (2007) pokazali su da ekspresija SGPP1 povećava ugradnju sfingozina u dugolančane keramide u ćelijama HEK293. Koristeći inhibitore keramid-sintaze, pokazali su da je ovaj porast dugolančanog keramida posredovan putem recikliranja sfingozina/spašavanja, a ne de novo sintezom sfingozina. Zaključili su da SGPP1 regulira recikliranje sfingozina u dugolančane keramide, a sfingozin-kinaza-2 (SPHK2) djeluje sa SGPP1 za recikliranje sfingozina u keramid.

Koristeći divlji tip SGPP1 i katalitski neaktivni H208A-mutirani SGPP1, Peter et al. (2008) pokazali su da SGPP1 ima ulogu u regulaciji mišićnog tonusa u otpornim arterijama hrčka i da ovaj učinak zahtijeva aktivnost SGPP1 fosfataze. SGPP1 je modulirao vazokonstrikcijske efekte endogenog S1P. Inhibicija transmembranskog regulatora provodljivosti cistaste fibroze (CFTR) donekle je ublažila učinak SGPP1 na vaskularni tonus. Sugerirali su da CFTR može posredovati transport vanćelijskog S1P do unutarćelijski lokaliziranog SGPP1 radi razgradnje.[11]

Reference

uredi
  1. ^ a b c ENSG00000285281 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000126821, ENSG00000285281 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021054 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Mandala SM, Thornton R, Galve-Roperh I, Poulton S, Peterson C, Olivera A, Bergstrom J, Kurtz MB, Spiegel S (Aug 2000). "Molecular cloning and characterization of a lipid phosphohydrolase that degrades sphingosine-1- phosphate and induces cell death". Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (14): 7859–64. doi:10.1073/pnas.120146897. PMC 16635. PMID 10859351.
  6. ^ "Entrez Gene: SGPP1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1".
  7. ^ Le Stunff, H., Peterson, C., Thornton, R., Milstien, S., Mandala, S. M., Spiegel, S. Characterization of murine sphingosine-1-phosphate phosphohydrolase. J. Biol. Chem. 277: 8920-8927, 2002. PubMed: 11756451
  8. ^ "UniProt, Q9BX95". Pristupljeno 11. 9. 2017.
  9. ^ Mandala, S. M., Thornton, R., Galve-Roperh, I., Poulton, S., Peterson, C., Olivera, A., Bergstrom, J., Kurtz, M. B., Spiegel, S. Molecular cloning and characterization of a lipid phosphohydrolase that degrades sphingosine-1-phosphate and induces cell death. Proc. Nat. Acad. Sci. 97: 7859-7864, 2000. PubMed: 10859351
  10. ^ Le Stunff, H., Giussani, P., Maceyka, M., Lepine, S., Milstien, S., Spiegel, S. Recycling of sphingosine is regulated by the concerted actions of sphingosine-1-phosphate phosphohydrolase 1 and sphingosine kinase 2. J. Biol. Chem. 282: 34372-34380, 2007. PubMed: 17895250
  11. ^ Peter, B. F., Lidington, D., Harada, A., Bolz, H. J., Vogel, L., Heximer, S., Spiegel, S., Pohl, U., Bolz, S.-S. Role of sphingosine-1-phosphate phosphohydrolase 1 in the regulation of resistance artery tone. Circ. Res. 103: 315-324, 2008. PubMed: 18583713

Dopunska literatura

uredi