NF-kapa-B inhibitor zeta (IκBζ) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NFKBIZ sa hromosoma 3.[5][6][7]

NFKBIZ
Identifikatori
AliasiNFKBIZ
Vanjski ID-jeviOMIM: 608004 MGI: 1931595 HomoloGene: 12734 GeneCards: NFKBIZ
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 3 (čovjek)
Hrom.Hromosom 3 (čovjek)[1]
Hromosom 3 (čovjek)
Genomska lokacija za NFKBIZ
Genomska lokacija za NFKBIZ
Bend3q12.3Početak101,827,991 bp[1]
Kraj101,861,022 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 16 (miš)
Hrom.Hromosom 16 (miš)[2]
Hromosom 16 (miš)
Genomska lokacija za NFKBIZ
Genomska lokacija za NFKBIZ
Bend16|16 C1.1Početak55,631,738 bp[2]
Kraj55,659,262 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0001104 transcription coregulator activity
Ćelijska komponenta jedro
nuclear speck
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Biološki proces GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
inflammatory response
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
T cell receptor signaling pathway
positive regulation of T-helper 17 cell differentiation
positive regulation of inflammatory response
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_031419
NM_001005474

NM_001159394
NM_001159395
NM_030612

RefSeq (bjelančevina)

NP_001005474
NP_113607

NP_001152866
NP_001152867
NP_085115

Lokacija (UCSC)Chr 3: 101.83 – 101.86 MbChr 16: 55.63 – 55.66 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 718 aminokiselina, а molekulska težina 78.061 Da.[8]

1020304050
MIVDKLLDDSRGGEGLRDAAGGCGLMTSPLNLSYFYGASPPAAAPGACDA
SCSVLGPSAPGSPGSDSSDFSSASSVSSCGAVESRSRGGARAERQPVEPH
MGVGRQQRGPFQGVRVKNSVKELLLHIRSHKQKASGQAVDDFKTQGVNIE
QFRELKNTVSYSGKRKGPDSLSDGPACKRPALLHSQFLTPPQTPTPGESM
EDVHLNEPKQESSADLLQNIINIKNECSPVSLNTVQVSWLNPVVVPQSSP
AEQCQDFHGGQVFSPPQKCQPFQVRGSQQMIDQASLYQYSPQNQHVEQQP
HYTHKPTLEYSPFPIPPQSPAYEPNLFDGPESQFCPNQSLVSLLGDQRES
ENIANPMQTSSSVQQQNDAHLHSFSMMPSSACEAMVGHEMASDSSNTSLP
FSNMGNPMNTTQLGKSLFQWQVEQEESKLANISQDQFLSKDADGDTFLHI
AVAQGRRALSYVLARKMNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLV
NIGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVGSNQFVDLEATNY
DGLTPLHCAVIAHNAVVHELQRNQQPHSPEVQELLLKNKSLVDTIKCLIQ
MGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGN
TALHVAASLQYRLTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGE
QIRRILKGKSIQQRAPPY

Funkcija

uredi

Ovaj gen je član porodice ankirinskihponavcljanja i induciran je lipopolisaharidom (LPS). C-terminalni dio kodiranog proizvoda koji sadrži ankirinska ponavljanja, dijeli veliku sličnost sa porodicom proteina sa slučnošću sekvence I kapa B. Poznato je da potonji imaju ulogu u upalnim odgovorima na LPS njihovom interakcijom sa NF-B proteinima preko domena za ponavljanje ankirina. Studije na miševima pokazuju da je ovaj genski proizvod jedan od jedarnih I kapa B proteina i aktivator proizvodnje IL-6. Za ovaj gen su pronađene dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[9]

Klinički značaj

uredi

NFKBIZ je impliciran kao onkogen u difuznom velikom B-ćelijskom limfomu (DLBCL). Konkretno, genomski lokus koji sadrži ovaj gen se rekurentno umnožava u broju kopija u aktiviranoj B-ćelijskoj (ABC) podgrupi DLBCL.[10] Nedavno je otkriveno da ponavljanje somatskih mutacija koje utjiču na 3-prim neprevedenu regiju NFKBIZ promovira ekspresiju NFKBIZ u ABC DLBCL.[11]

IκBζ potreban je za ekspresiju sekretornog fenotipa povezanog sa starenjem (SASP) CCL2 (MCP1) citokina, koji regrutuje makrofage za uklanjanje ćelija raka.[7]

Pokazalo se da flavonoid apigenin smanjuje ekspresiju gena IκBζ.[12]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000144802 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000035356 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Eto A, Muta T, Yamazaki S, Takeshige K (februar 2003). "Essential roles for NF-kappa B and a Toll/IL-1 receptor domain-specific signal(s) in the induction of I kappa B-zeta". Biochemical and Biophysical Research Communications. 301 (2): 495–501. doi:10.1016/S0006-291X(02)03082-6. PMID 12565889.
  6. ^ Totzke G, Essmann F, Pohlmann S, Lindenblatt C, Jänicke RU, Schulze-Osthoff K (maj 2006). "A novel member of the IkappaB family, human IkappaB-zeta, inhibits transactivation of p65 and its DNA binding". The Journal of Biological Chemistry. 281 (18): 12645–54. doi:10.1074/jbc.M511956200. PMID 16513645.
  7. ^ a b Alexander E, Hildebrand DG, Schulze-Osthoff K, Essmann F (2013). "IκBζ is a regulator of the senescence-associated secretory phenotype in DNA damage- and oncogene-induced senescence". Journal of Cell Science. 126 (Pt 16): 3738–3745. doi:10.1242/jcs.128835. PMID 23781024.
  8. ^ "UniProt, Q9BYH8" (jezik: engleski). Pristupljeno 8. 11. 2021.
  9. ^ "Entrez Gene: NFKBIZ nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, zeta".
  10. ^ Nogai H, Wenzel SS, Hailfinger S, Grau M, Kaergel E, Seitz V, et al. (septembar 2013). "IκB-ζ controls the constitutive NF-κB target gene network and survival of ABC DLBCL". Blood. 122 (13): 2242–50. doi:10.1182/blood-2013-06-508028. PMID 23869088.
  11. ^ Arthur SE, Jiang A, Grande BM, Alcaide M, Cojocaru R, Rushton CK, et al. (oktobar 2018). "Genome-wide discovery of somatic regulatory variants in diffuse large B-cell lymphoma". Nature Communications. 9 (1): 4001. Bibcode:2018NatCo...9.4001A. doi:10.1038/s41467-018-06354-3. PMC 6167379. PMID 30275490.
  12. ^ Lim H, Heo MY, Kim HP (2019). "Flavonoids: Broad Spectrum Agents on Chronic Inflammation". Biomolecules & Therapeutics. 27 (3): 241–253. doi:10.4062/biomolther.2019.034. PMC 6513185. PMID 31006180.

Dopunska literatura

uredi