MPHOSPH6

MPHOSPH6
Identifikatori
Aliasi	MPHOSPH6
Vanjski ID-jevi	OMIM: 605500 MGI: 1915783 HomoloGene: 38100 GeneCards: MPHOSPH6
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 16 (čovjek)
Kraj	82,170,224 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 8 (miš)
Kraj	118,528,682 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • vezivanje sa RNK;
Ćelijska komponenta	• nuclear exosome (RNase complex); • Jedarce; • Egzosomski kompleks; • jedro; • nukleoplazma; • citoplazma;
Biološki proces	• maturation of 5.8S rRNA; • rRNA processing;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	10200
	68533
	ENSG00000135698
	ENSMUSG00000031843
	Q99547
	Q9D1Q1
	NM_005792
	NM_026758; NM_001357232; NM_001357233
	NP_005783
	NP_081034; NP_001344161; NP_001344162
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

M-fazni fosfoprotein 6 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MPHOSPH6.^[5]^[6]

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 160 aminokiselina, a molekulska težina 19.024 Da.^[7]

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MAAERKTRLS	KNLLRMKFMQ	RGLDSETKKQ	LEEEEKKIIS	EEHWYLDLPE
LKEKESFIIE	EQSFLLCEDL	LYGRMSFRGF	NPEVEKLMLQ	MNAKHKAEEV
EDETVELDVS	DEEMARRYET	LVGTIGKKFA	RKRDHANYEE	DENGDITPIK
AKKMFLKPQD

Kloniranje i ekspresija uredi

Tretiranjem biblioteka za ekspresiju bakterija u citosolu M-faze koji sadrži relevantne kinaze u prisustvu inhibitora fosfataze, nakon čega slijedi imunoskrining s antitijelima MPM2, Matsumoto-Taniura et al. (1996) izolirali su cDNK za brojne MPHOSPH, uključujući MPHOSPH6, koji su nazvali MPP6. Matsumoto-Taniura, N., Pirollet, F., Monroe, R., Gerace, L., Westendorf, J. M. Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning. Molec. Biol. Cell 7: 1455-1469, 1996. PubMed: 8885239</ref> Imunoblotska analiza pokazala je da se kada se osforilizira, u ćelijama M-faze, MPHOSPH6 eksprimira kao protein od 17 kD. Imunofluorescentna mikroskopija lokalizirala je MPHOSPH6 u čitavom jedru, sa umjerenom koncentracijom u jedarcima, u interfazi i u čitavoj ćeliji tokom mitoze.

Inherentno nestabilne iRNK sisara sadrže elemente bogate AU (ARE) u svojim 3-glavnim neprevedenim regijama. U kvascima, degradaciju iRNK od tri do pet primarnih dijelova posreduje egzon, višejedinična čestica. Chen et al. (2001) pročistili su i okarakterizirali ljudski egzosom masenom spektrometrijom i utvrdili da je njegov sastav sličan kvaščevom. Unutar ljudskog egzozoma, utvrdili su sljedeće proteinske podjedinice:^[8]

p7, koja je homologna proteinu kvasca Rrp4, p8, koji je homologan proteinu kvasca Rrp42;
p9, koja je homologna proteinu kvasca Rrp43 (OIP2);
p10, homologna proteinu kvasca Rrp40;
p11, koja je homologna kvaščevom proteinu Mtr3 ;
p12A, homolog kvaščevog proteina Rrp41;
p12B, homologni kvaščevog proteina Rrp46 i
p13, homolog kvaščevog protein Csl4. Također su identificirali dva faktora povezana s egzosomom, p1 i p14, koji nisu homologni niti jednoj komponenti egzozoma kvasca.

Funkcija gena uredi

Koristeći sistem raspadanja RNK bez ćelija, Chen et al. (2001) pokazali su da je egzosom sisara potreban za brzu razgradnju RNK koja sadrži ARE, ali ne i za skraćivanje poli (A). Otkrili su da egzosom sisara ne prepoznaje RNK koje sadrže ARE. Za prepoznavanje ARE potrebni su određeni proteini koji se vežu za ARE i koji mogu stupiti u interakciju s egzosomom i regrutovati ga u nestabilne RNK, čime se pospješuje njihova brza razgradnja.

Reference uredi

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135698 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031843 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (Jan 1997). "Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning". Mol Biol Cell. 7 (9): 1455–69. doi:10.1091/mbc.7.9.1455. PMC 275994. PMID 8885239.
^ "Entrez Gene: MPHOSPH6 M-phase phosphoprotein 6".
^ "UniProt, Q99547". Pristupljeno 8. 7. 2021.
^ Chen, C.-Y., Gherzi, R., Ong, S.-E., Chan, E. L., Raijmakers, R., Pruijn, G. J. M., Stoecklin, G., Moroni, C., Mann, M., Karin, M. AU binding proteins recruit the exosome to degrade ARE-containing mRNAs. Cell 107: 451-464, 2001. PubMed: 11719186

Vanjski linkovi uredi

MPHOSPH6 lokacija ljudskog genoma UCSC Genome Browser.

MPHOSPH6 detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135698 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031843 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid8885239-5] Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (Jan 1997). "Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning". Mol Biol Cell. 7 (9): 1455–69. doi:10.1091/mbc.7.9.1455. PMC 275994. PMID 8885239.

[entrez-6] "Entrez Gene: MPHOSPH6 M-phase phosphoprotein 6".

[UniProt-7] "UniProt, Q99547". Pristupljeno 8. 7. 2021.

[8] Chen, C.-Y., Gherzi, R., Ong, S.-E., Chan, E. L., Raijmakers, R., Pruijn, G. J. M., Stoecklin, G., Moroni, C., Mann, M., Karin, M. AU binding proteins recruit the exosome to degrade ARE-containing mRNAs. Cell 107: 451-464, 2001. PubMed: 11719186

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

[7]

[8]