Wikipedia

MIPEP

Mitohondrijska intermedijarna peptidaza je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MIPEP.[5]

MIPEP
Identifikatori
AliasiMIPEP
Vanjski ID-jeviOMIM: 602241 MGI: 1917728 HomoloGene: 4337 GeneCards: MIPEP
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 13 (čovjek)
Hrom.Hromosom 13 (čovjek)[1]
Hromosom 13 (čovjek)
Genomska lokacija za MIPEP
Genomska lokacija za MIPEP
Bend13q12.12Početak23,730,189 bp[1]
Kraj23,889,400 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za MIPEP
Genomska lokacija za MIPEP
Bend14|14 D1Početak61,022,022 bp[2]
Kraj61,142,927 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• GO:0070122 peptidase activity
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• vezivanje iona metala
• metalloendopeptidase activity
Ćelijska komponenta• mitochondrial matrix
• mitohondrija
Biološki proces• peptide metabolic process
• Proteoliza
• protein processing involved in protein targeting to mitochondrion
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

4285

70478

Ensembl

ENSG00000027001

ENSMUSG00000021993

UniProt

Q99797

A6H611

RefSeq (mRNK)

NM_005932

NM_027436

RefSeq (bjelančevina)

NP_005923

NP_081712

Lokacija (UCSC)Chr 13: 23.73 – 23.89 MbChr 14: 61.02 – 61.14 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj protein je kritična komponenta mehanizma za import ljudskih mitohondrijskih proteina uključenih u proces sazrijevanja jedarno kodiranih mitohondrijskih proteina, s mitohondrijskim translokacijskim peptidima, posebno onih proteina povezanih s OXPHOS-om.[6]

Struktura

uredi

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 713 aminokiselina, a molekulska težina 80.641 Da[7]

1020304050
MLCVGRLGGLGARAAALPPRRAGRGSLEAGIRARRVSTSWSPVGAAFNVK
PQGSRLDLFGERRGLFGVPELSAPEGFHIAQEKALRKTELLVDRACSTPP
GPQTVLIFDELSDSLCRVADLADFVKIAHPEPAFREAAEEACRSIGTMVE
KLNTNVDLYQSLQKLLADKKLVDSLDPETRRVAELFMFDFEISGIHLDKE
KRKRAVDLNVKILDLSSTFLMGTNFPNKIEKHLLPEHIRRNFTSAGDHII
IDGLHAESPDDLVREAAYKIFLYPNAGQLKCLEELLSSRDLLAKLVGYST
FSHRALQGTIAKNPETVMQFLEKLSDKLSERTLKDFEMIRGMKMKLNPQN
SEVMPWDPPYYSGVIRAERYNIEPSLYCPFFSLGACMEGLNILLNRLLGI
SLYAEQPAKGEVWSEDVRKLAVVHESEGLLGYIYCDFFQRADKPHQDCHF
TIRGGRLKEDGDYQLPVVVLMLNLPRSSRSSPTLLTPSMMENLFHEMGHA
MHSMLGRTRYQHVTGTRCPTDFAEVPSILMEYFANDYRVVNQFARHYQTG
QPLPKNMVSRLCESKKVCAAADMQLQVFYATLDQIYHGKHPLRNSTTDIL
KETQEKFYGLPYVPNTAWQLRFSHLVGYGARYYSYLMSRAVASMVWKECF
LQDPFNRAAGERYRREMLAHGGGREPMLMVEGMLQKCPSVDDFVSALVSD
LDLDFETFLMDSE
Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Gen

uredi

Gen MIPEP kodira jednu metaloproteazu koja hidrolizira peptidni fragment od osam aminokiselina u dužini za obradu proteina usmjerenih na mitohondrije.[5] Ljudski gen MIPEP ima 21 egzon i nalazi se na hromozomskoj sekvenci 13q12. Pokazano je da je ljudski gen MIPEP visoko eksprimiran u srcu, skeletnim mišićima i gušterači, tri organska sistema koji se često prijavljuju sa poremećajima OXPHOS-a.

Protein

uredi

Ljudski protein mitohondrijska intermedijarna peptidaza, veličine je 80,6 kDa i sastoji se od 713 aminokiselina. Sadrži mitonhondrije koje ciljaju peptid (aminokiselina 1-35 peptidne sekvence). Zreli protein ima teorijski pI 6,03.[8]

Funkcija

uredi

Djelujući zajedno s općom mitohondrijskom procesnom peptidazom (MPP), MIPEP ima ključnu ulogu u sazrijevanju određene klase jedarno kodiranih proteinskih prekursora, koje karakterizira motiv, XRX (f) (F/L/I) XX (T/S /G) XXXX (f).[9] U početku, peptidaza MPP cijepa prekursore na pozicijama dvije peptidne veze iz R-ostatka, ostavljajući tipski oktapeptid na N-kraju proteina; nakon toga, MIP cijepa oktapeptid, dovršavajući konačno sazrijevanje prerađenog proteina.[10][11] Nedavno istraživanje pokazalo je da mitohondrijska intermedijarna peptidaza može razgraditi transmembranski receptor Notch na svom mjestu S5 i pomoći sazrijevanju notch proteina.[12]

Klinički značaj

uredi

U GWAS (eng. Genome-Wide Association Study) studiji kineske populacije, zabilježena je značajna povezanost između visoke miopije i varijante na sekvenci q12.12 hromosoma 13. Geni MIPEP i C1QTNF9B nalaze se u istom lokusu i izgledaju eksprimirani u mrežnjači i njenom pigmentnom epitelu (RPE) i stoga su vjerojatno povezani s visokom kratkovidnošću.[13] Međutim, funkcionalni dokazi koji povezuju MIPEP s kratkovidnošću tek trebaju biti pruženi.

Bialelne patogene varijante u MIPEP-u prisutne su u ranom dojenačkom uzrastu ili ranom djetinjstvu s hipotonijom (niskim mišićnim tonusom) i rijetkim tipom kardiomiopatije, koja se naziva nekompakcija lijeve komore. Mogu se vidjeti i katarakti. Kod četiri prijavljena pacijenta do sada je kardiomiopatija progresivna i rezultira smrću u prvih nekoliko godina života.[14]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000027001 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021993 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: MIPEP mitochondrial intermediate peptidase".
  6. ^ Chew A, Buck EA, Peretz S, Sirugo G, Rinaldo P, Isaya G (Mar 1997). "Cloning, expression, and chromosomal assignment of the human mitochondrial intermediate peptidase gene (MIPEP)". Genomics. 40 (3): 493–6. doi:10.1006/geno.1996.4586. PMID 9073519.
  7. ^ "UniProt, Q99797". Pristupljeno 11. 9. 2017.
  8. ^ "Uniprot: Q99797 - MIPEP_HUMAN".
  9. ^ Hendrick JP, Hodges PE, Rosenberg LE (Jun 1989). "Survey of amino-terminal proteolytic cleavage sites in mitochondrial precursor proteins: leader peptides cleaved by two matrix proteases share a three-amino acid motif". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 86 (11): 4056–60. doi:10.1073/pnas.86.11.4056. PMC 287387. PMID 2657736.
  10. ^ Isaya G, Kalousek F (1995). "Mitochondrial intermediate peptidase". Methods in Enzymology. 248: 556–67. doi:10.1016/0076-6879(95)48035-8. PMID 7674944.
  11. ^ Isaya G, Sakati WR, Rollins RA, Shen GP, Hanson LC, Ullrich RC, Novotny CP (Aug 1995). "Mammalian mitochondrial intermediate peptidase: structure/function analysis of a new homologue from Schizophyllum commune and relationship to thimet oligopeptidases". Genomics. 28 (3): 450–61. doi:10.1006/geno.1995.1174. PMID 7490080.
  12. ^ Lee SF, Srinivasan B, Sephton CF, Dries DR, Wang B, Yu C, Wang Y, Dewey CM, Shah S, Jiang J, Yu G (Aug 2011). "Gamma-secretase-regulated proteolysis of the Notch receptor by mitochondrial intermediate peptidase". The Journal of Biological Chemistry. 286 (31): 27447–53. doi:10.1074/jbc.M111.243154. PMC 3149338. PMID 21685396.
  13. ^ Shi Y, Qu J, Zhang D, Zhao P, Zhang Q, Tam PO, et al. (Jun 2011). "Genetic variants at 13q12.12 are associated with high myopia in the Han Chinese population". American Journal of Human Genetics. 88 (6): 805–13. doi:10.1016/j.ajhg.2011.04.022. PMC 3113245. PMID 21640322.
  14. ^ Eldomery MK, Akdemir ZC, Vögtle FN, Charng WL, Mulica P, Rosenfeld JA, et al. (2016). "MIPEP recessive variants cause a syndrome of left ventricular non-compaction, hypotonia, and infantile death". Genome Medicine. 8 (1): 106. doi:10.1186/s13073-016-0360-6. PMC 5088683. PMID 27799064.
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=MIPEP&oldid=3511768"