GSKIP

Interaktivni protein GSK3B je protein koji je kod ljudi kodiran genom GSKIP. Chou et al. objavili su da se GSKIP gen nalazi na poziciji 14q32.2 hromosoma 14. Izvijestili su da gen GSKIP sadrži tri egzona. Prvi egzon je nekodirajući

GSKIP
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1SGO
Identifikatori
Aliasi	GSKIP
Vanjski ID-jevi	OMIM: 616605 MGI: 1914037 HomoloGene: 9522 GeneCards: GSKIP
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 14 (čovjek) Bend 14q32.2 Početak 96,363,452 bp Kraj 96,387,288 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 12 (miš) Bend 12|12 E Početak 105,651,088 bp Kraj 105,669,282 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • protein kinase inhibitor activity • beta-catenin binding • protein kinase A regulatory subunit binding • protein kinase A binding • protein kinase binding Ćelijska komponenta • citoplazma • jedro Biološki proces • negative regulation of protein kinase activity • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of Wnt signaling pathway Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	51527	66787
Ensembl	ENSG00000100744	ENSMUSG00000044715
UniProt	Q9P0R6	Q8BGR8
RefSeq (mRNK)	NM_016472 NM_001271904 NM_001271905 NM_001271906	NM_178613
RefSeq (bjelančevina)	NP_001258833 NP_001258834 NP_001258835 NP_057556	NP_848728
Lokacija (UCSC)	Chr 14: 96.36 – 96.39 Mb	Chr 12: 105.65 – 105.67 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Glikogen-sintazna kinaza-3 (vidi GS3KB) je serin/treonin kinaza koja fosforilira glikogen sintazu (GYS1) i regulira metabolizam glikogena. Također ima glavnu ulogu u regulaciji sudbine ćelija, diferencijaciji i proliferaciji preko Wnt signalnog putA . GSKIP je negativni regulator aktivnosti GS3K kinaze u signalnom putu Wnt, ali ne i u metabolizmu glikogena (Chou et al., 2006).

Kloniranje i ekspresija

Korištenjem GSK3B u 2-hibridnom skriningu kvasca u biblioteci cDNK ljudskih sjemenika, Chou et al. (2006) klonirali su GSKIP. Izvedeni protein od 139 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od 15,6 kD. GSKIP ima N– i C-terminalne domene koje su visoko konzervirani, posebno kod kičmenjaka. Konačnih 25 aminokiselina konzerviranog C-terminalnog domena slično je domenu aksina u interakciji sa GSK3B (AXIN1). Northern blot analizom otkrivena je varijabilna ekspresija GSKIP transkripta od 2,1 kb u svim ispitivanim tkivima odraslih i fetusa, s najvećom ekspresijom u srcu, posteljici, jetri i skeletnim mišićima odraslih. GSKIP označen fluorescencijom pretežno je eksprimiran u citosolu transficiranih HeLa ćelija.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 139 aminokiselina, a molekulska težina 15.648 Da..

10		20		30		40		50
METDCNPMEL		SSMSGFEEGS		ELNGFEGTDM		KDMRLEAEAV		VNDVLFAVNN
MFVSKSLRCA		DDVAYINVET		KERNRYCLEL		TEAGLKVVGY		AFDQVDDHLQ
TPYHETVYSL		LDTLSPAYRE		AFGNALLQRL		EALKRDGQS

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Funkcija

Ovaj gen kodira protein koji je uključen kao negativni regulator GSK3-beta u WNT signalnom putu. Kodirani protein može imati ulogu u signalnom putu retinoijsne kiseline, reguliranjem funkcionalnih interakcija između GSK3-beta, beta-katenina i ciklina D1, te regulira beta-katenin/N-kadherinski bazen. Kodirani protein sadrži GSK3-beta interakcijski domen (GID) u svom C-terminalu, koji je sličan GID-u za aksin. Protein također sadrži evolucijski konzerviranu RII vezujuću domenu, što olakšava vezivanje sa protein kinazom-A i GSK3-beta, omogućavajući mu ulogu A-kinaznog sidrenog proteina. Uočene su Alternativno prerađene varijante transkripta za ovaj gen.

Korištenjem proteinskog panela i analize imunoprecipitacije kotransficiranih ćelija HEK293, Chou et al. (2006) utvrdili su da je GSKIP vezao GSK3B i in vitro i in vivo. GSKIP je također vezao GSK3A. C-terminalnih 25 aminokiselina GSKIP bile su minimalna jedinica potrebna za vezivanje za GSK3B. Kinetička analiza otkrila je snažan afinitet vezivanja između GSKIP-peptida i GSK3B.

Mutageneza usmjerena na lokaciju otkrila je da su ser109 i thr113, neposredno uzvodno od GSK3B-vezujuće regije GSKIP-a, glavni ciljevi GSK3B fosforilacije. Analize kinaze in vitro pokazale su da GSKIP pune dužine i GS-CIP peptid sa 25 aminokiselina GSKIP inhibiraju kinaznu aktivnost GSK3B protiv aksina i beta-katenina (CTNNB1). Oba funkcioniraju u Wnt signalnom putu, ali nisu inhibirali GSK3B-zavisnu fosforilaciju glikogen sintaze. Western blot analiza pokazala je da je GSKIP uzrokovao nuklearnu akumulaciju beta-katenina, a ispitivanja gena reportera otkrila su da GSKIP inhibira Wnt-zavisnu transkripciju. Zaključili su da GSKIP ima ulogu u negativnoj regulaciji Wnt signalizacije, moguće putem preklapanja mjesta vezivanja.

Dopunska literatura

• Chou HY, Howng SL, Cheng TS, Hsiao YL, Lieu AS, Loh JK, Hwang SL, Lin CC, Hsu CM, Wang C, Lee CI, Lu PJ, Chou CK, Huang CY, Hong YR (2006). "GSKIP is homologous to the Axin GSK3beta interaction domain and functions as a negative regulator of GSK3beta". Biochemistry. 45 (38): 11379–89. doi:10.1021/bi061147r. PMID 16981698.
• Tang XN, Lo CW, Chuang YC, Chen CT, Sun YC, Hong YR, Yang CN (2011). "Prediction of the binding mode between GSK3β and a peptide derived from GSKIP using molecular dynamics simulation". Biopolymers. 95 (7): 461–71. doi:10.1002/bip.21603. PMID 21328310.