FPGT
Fukoza-1-fosfat guanililtransferaza jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom FPGT sa hromosoma 1.[5][6]
| FPGT | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | FPGT | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 603609 MGI: 1922790 HomoloGene: 2847 GeneCards: FPGT | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 1: 74.2 – 74.23 Mb | Chr 3: 154.79 – 154.8 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Amiokiselininska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 594 aminokiseline, a molekulska težina 66.599 Da.[7]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAAARDPPEV | SLREATQRKL | RRFSELRGKL | VARGEFWDIV | AITAADEKQE | ||||
| LAYNQQLSEK | LKRKELPLGV | QYHVFVDPAG | AKIGNGGSTL | CALQCLEKLY | ||||
| GDKWNSFTIL | LIHSGGYSQR | LPNASALGKI | FTALPLGNPI | YQMLELKLAM | ||||
| YIDFPLNMNP | GILVTCADDI | ELYSIGEFEF | IRFDKPGFTA | LAHPSSLTIG | ||||
| TTHGVFVLDP | FDDLKHRDLE | YRSCHRFLHK | PSIEKMYQFN | AVCRPGNFCQ | ||||
| QDFAGGDIAD | LKLDSDYVYT | DSLFYMDHKS | AKMLLAFYEK | IGTLSCEIDA | ||||
| YGDFLQALGP | GATVEYTRNT | SNVIKEESEL | VEMRQRIFHL | LKGTSLNVVV | ||||
| LNNSKFYHIG | TTEEYLFYFT | SDNSLKSELG | LQSITFSIFP | DIPECSGKTS | ||||
| CIIQSILDSR | CSVAPGSVVE | YSRLGPDVSV | GENCIISGSY | ILTKAALPAH | ||||
| SFVCSLSLKM | NRCLKYATMA | FGVQDNLKKS | VKTLSDIKLL | QFFGVCFLSC | ||||
| LDVWNLKVTE | ELFSGNKTCL | SLWTARIFPV | CSSLSDSVIT | SLKMLNAVKN | ||||
| KSAFSLNSYK | LLSIEEMLIY | KDVEDMITYR | EQIFLEISLK | SSLM |
Funkcija
urediL-fukoza je ključni šećer u glikoproteinima i drugim složenim ugljikohidratima jer može biti uključena u mnoge funkcionalne uloge ovih makromolekula, kao što je prepoznavanje ćelija-ćelija. Donor fukozila za ove fukozilovane oligosaharide je GDP-beta-L-fukoza.
Postoje dva alternativna puta za biosintezu GDP-fukoze; glavni put pretvara GDP-alfa-D-manozu u GDP-beta-L-fukozu. Protein kodiran ovim genom učestvuje u alternativnom putu koji je prisutan u određenim tkivima sisara, kao što su u jetri i bubrezima, a čini se da funkcioniše kao spasonosni put za ponovno korištenje L-fukoze koja proizlazi iz prometa glikoproteina i glikolipida.
Ovaj put uključuje fosforilaciju L-fukoze. kako bi se formirao beta-L-fukoza-1-fosfat, a zatim kondenzacijama beta-L-fukoza-1-fosfata sa GTP-om fukoza-1-fosfat gvanililtransferaze za formiranje GDP-beta-L-fukoze.[6]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000254685 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053870 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Pastuszak I, Ketchum C, Hermanson G, Sjoberg EJ, Drake R, Elbein AD (Dec 1998). "GDP-L-fucose pyrophosphorylase. Purification, cDNA cloning, and properties of the enzyme". J Biol Chem. 273 (46): 30165–74. doi:10.1074/jbc.273.46.30165. PMID 9804772.
- ^ a b "Entrez Gene: FPGT fucose-1-phosphate guanylyltransferase".
- ^ "UniProt, O14772" (jezik: eng.). Pristupljeno 27. 11. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
Dopunska literatura
uredi- Quirk S, Seley-Radtke KL (2006). "Purification, crystallization and preliminary X-ray characterization of the human GTP fucose pyrophosphorylase". Acta Crystallographica Section F. 62 (Pt 4): 392–4. doi:10.1107/S1744309106008529. PMC 2222559. PMID 16582493.
- Quirk S, Seley KL (2005). "Identification of catalytic amino acids in the human GTP fucose pyrophosphorylase active site". Biochemistry. 44 (39): 13172–8. doi:10.1021/bi051288d. PMID 16185085.
- Quirk S, Seley KL (2005). "Substrate discrimination by the human GTP fucose pyrophosphorylase". Biochemistry. 44 (32): 10854–63. doi:10.1021/bi0503605. PMID 16086588.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.