FIBCD1

Fibrinogen 1 sa domenom C (FIBCD1) je protein koji je kod ljudi kodiran genom FIBCD1 sa hromosoma 9, sekvenca 9q34.1, u neposrednoj blizini gena koji kodiraju L- i M-fikolin. Smatra se da FIBCD1 ima ulogu i u odbrani domaćina i u homeostazi crijeva.

FIBCD1
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 4M7F, 4M7H
Identifikatori
Aliasi	FIBCD1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 613357 MGI: 2138953 HomoloGene: 122246 GeneCards: FIBCD1
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 2 (miš) Bend 2|2 B Početak 31,703,302 bp Kraj 31,736,017 bp
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	84929	98970
Ensembl	n/a	ENSMUSG00000026841
UniProt	Q8N539	A2AV25
RefSeq (mRNK)	NM_032843 NM_001145106	NM_178887
RefSeq (bjelančevina)	NP_001138578 NP_116232	NP_849218
Lokacija (UCSC)	n/a	Chr 2: 31.7 – 31.74 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 461 aminokiselina, a molekulska težina 50.744 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MVNDRWKTMG		GAAQLEDRPR		DKPQRPSCGY		VLCTVLLALA		VLLAVAVTGA
VLFLNHAHAP		GTAPPPVVST		GAASANSALV		TVERADSSHL		SILIDPRCPD
LTDSFARLES		AQASVLQALT		EHQAQPRLVG		DQEQELLDTL		ADQLPRLLAR
ASELQTECMG		LRKGHGTLGQ		GLSALQSEQG		RLIQLLSESQ		GHMAHLVNSV
SDILDALQRD		RGLGRPRNKA		DLQRAPARGT		RPRGCATGSR		PRDCLDVLLS
GQQDDGVYSV		FPTHYPAGFQ		VYCDMRTDGG		GWTVFQRRED		GSVNFFRGWD
AYRDGFGRLT		GEHWLGLKRI		HALTTQAAYE		LHVDLEDFEN		GTAYARYGSF
GVGLFSVDPE		EDGYPLTVAD		YSGTAGDSLL		KHSGMRFTTK		DRDSDHSENN
CAAFYRGAWW		YRNCHTSNLN		GQYLRGAHAS		YADGVEWSSW		TGWQYSLKFS
EMKIRPVRED		R

Struktura

FIBCD1 tvori homo-tetramere u plazmamembrani, pri čemu se svaki proteinski lanac sastoji od kratkog citoplazmatskog repa, trans-membranske spirale i ektodomena koji sadrži regiju upredene zavojnice, polikacijsku regiju i C-terminalni fibrinogen-domen za prepoznavanje, poznat i kao FReD. (Shrive, et al., 2014)

Funkcija

FIBCD1 je transmembranski endocitni tip II receptors koji se apikalno eksprimira na enterocitima i na epitelnim ćelijama dišnih puteva (Schlosser et al. , 2009). Smatra se da posreduje u endocitozi vezanih liganada koji se nakon razgradnje oslobađaju u okolinu, a FIBCD1 se reciklira u plazmamembrani.

Homologija između FIBCD1 i članova fikolina, koji su široko okarakterizirane molekule za prepoznavanje obrazaca koji imaju ulogu u imunskom odgovoru, ukazuje da FIBCD1 može imati ulogu u odbrani domaćina. Dva potencijalna mjesta fosforilacija u citoplazmatskom dijelu FIBCD1 sugeriraju da FIBCD1 može biti i signalni protein (Schlosser et al., 2009).

Reference

{{reflist|refs=

Dopunska literatura

• Schlosser A, Thomsen T, Moeller JB, Nielsen O, Tornøe I, Mollenhauer J, Moestrup SK, Holmskov U (2009). "Characterization of FIBCD1 as an acetyl group-binding receptor that binds chitin". J. Immunol. 183 (6): 3800–9. doi:10.4049/jimmunol.0901526. PMID 19710473.