EAF1
Elongaciji-pridruženi faktor 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom EAF1 sa hromosoma 3.[5][6] Dio je porodice proteina EAF.
Aminokiselinska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 268 aminokiselina, а molekulska težina 29.042 Da.[7]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MNGTANPLLD | REEHCLRLGE | SFEKRPRASF | HTIRYDFKPA | SIDTSCEGEL | ||||
| QVGKGDEVTI | TLPHIPGSTP | PMTVFKGNKR | PYQKDCVLII | NHDTGEYVLE | ||||
| KLSSSIQVKK | TRAEGSSKIQ | ARMEQQPTRP | PQTSQPPPPP | PPMPFRAPTK | ||||
| PPVGPKTSPL | KDNPSPEPQL | DDIKRELRAE | VDIIEQMSSS | SGSSSSDSES | ||||
| SSGSDDDSSS | SGGEDNGPAS | PPQPSHQQPY | NSRPAVANGT | SRPQGSNQLM | ||||
| NTLRNDLQLS | ESGSDSDD |
Funkcija
urediMehanizmi koji upravljaju procesom elongacije tokom sinteze eukariotske iRNK razotkrivaju se nedavnim studijama. Ove studije su dovele do očekivanog otkrića raznolike kolekcije faktora transkripcije koji direktno reguliraju aktivnosti RNK-polimeraze II i neočekivanog otkrića uloge mnogih faktora elongacije u drugim osnovnim procesima, kao što su popravak DNK, rekombinacije itd. Transkripcijski mehanizam i strukturni karakteristike glavnih RNK-polimeraza konzervirani su među vrstama. Geni aktivni tokom elongacije spadaju u različite klase kao što su: domaćinski geni , regulirani ćelijskim ciklusom, geni specifični za razvoj i diferencijaciju itd. Lista gena uključenih u elongaciju u posljednje vrijeme raste i uključuje: –TFIIS, DSIF, NELF, P-Tefb i ostale koji su uključeni u zaustavljanje uzrokovano lijekom ili sekvencom ovisnoog –TFIIF, ELL, elongin, elongator itd., koji su uključeni u povećanje katalitske brzine elongacije promjenom Km i/ili Vmax Pol II –FACT, Paf1 i drugih faktora koji su uključeni u modifikaciju hromatina – proteini za popravak DNK, faktori eksporta i prerade RNK, 19S proteasom i niz drugih faktora kao što su Spt5-Spt5, Paf1 i NELF kompleksi, FCP1P itd.[8].
Elongacija također predstavlja procesnu fazu transkripcije u kojoj se aktivnosti nekoliko faktora prerade iRNK spajaju na transkripciju kroz njihovo vezivanje za RNK-polimerazu (Pol II). Jedan od ključnih događaja koji omogućava ovu interakciju je diferencijalna fosforilacija Pol II CTD. Obrazac fosforilacije CTD menja se tokom transkripcije, a najznačajnije na početku i tokom procesa elongacije. TFIIH-zavisna Ser5 fosforilacija je primećena prvenstveno u promotorskim regijama, dok se fosforilacija Ser2 posredovana sa P-Tefb viđa uglavnom u kodirajućim sekvencama, tokom elongacije. Eksperimentalni dokazi sugeriraju dinamičku povezanost faktora prerade RNK s različito modificiranim oblicima polimeraze tokom ciklusa transkripcije.[9][10][11][12]
- Izvori
- REACTOME: R-HSA-75955
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000144597 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021890 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Simone F, Polak PE, Kaberlein JJ, Luo RT, Levitan DA, Thirman MJ (juli 2001). "EAF1, a novel ELL-associated factor that is delocalized by expression of the MLL-ELL fusion protein". Blood. 98 (1): 201–9. doi:10.1182/blood.V98.1.201. PMID 11418481.
- ^ "Entrez Gene: EAF1 ELL associated factor 1".
- ^ "UniProt, Q96JC9" (jezik: engleski). Pristupljeno 3. 11. 2021.
- ^ Arndt i Kane, 2003.
- ^ Komarnitsky et al., 2000)
- ^ Komarnitsky et al 2000
- ^ Arndt & Kane 2003
- ^ Shilatifard et al 2003
Dopunska literatura
uredi- Polak PE, Simone F, Kaberlein JJ, Luo RT, Thirman MJ (april 2003). "ELL and EAF1 are Cajal body components that are disrupted in MLL-ELL leukemia". Molecular Biology of the Cell. 14 (4): 1517–28. doi:10.1091/mbc.E02-07-0394. PMC 153119. PMID 12686606.
- Kong SE, Banks CA, Shilatifard A, Conaway JW, Conaway RC (juli 2005). "ELL-associated factors 1 and 2 are positive regulators of RNA polymerase II elongation factor ELL". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (29): 10094–8. doi:10.1073/pnas.0503017102. PMC 1177379. PMID 16006523.
- Xiao W, Jiang F, Wang Z (januar 2006). "ELL binding regulates U19/Eaf2 intracellular localization, stability, and transactivation". The Prostate. 66 (1): 1–12. doi:10.1002/pros.20309. PMID 16114057. S2CID 32749490.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (novembar 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Jiang F, Ai J, Xiao W, Wang Z (august 2007). "FB1, an E2A fusion partner in childhood leukemia, interacts with U19/EAF2 and inhibits its transcriptional activity". Cancer Letters. 253 (2): 265–72. doi:10.1016/j.canlet.2007.02.003. PMC 1989770. PMID 17395368.