EAF1
Elongaciji-pridruženi faktor 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom EAF1 sa hromosoma 3.[5][6] Dio je porodice proteina EAF.
Aminokiselinska sekvenca uredi
Dužina polipeptidnog lanca je 268 aminokiselina, а molekulska težina 29.042 Da.[7]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MNGTANPLLD | REEHCLRLGE | SFEKRPRASF | HTIRYDFKPA | SIDTSCEGEL | ||||
| QVGKGDEVTI | TLPHIPGSTP | PMTVFKGNKR | PYQKDCVLII | NHDTGEYVLE | ||||
| KLSSSIQVKK | TRAEGSSKIQ | ARMEQQPTRP | PQTSQPPPPP | PPMPFRAPTK | ||||
| PPVGPKTSPL | KDNPSPEPQL | DDIKRELRAE | VDIIEQMSSS | SGSSSSDSES | ||||
| SSGSDDDSSS | SGGEDNGPAS | PPQPSHQQPY | NSRPAVANGT | SRPQGSNQLM | ||||
| NTLRNDLQLS | ESGSDSDD |
Funkcija uredi
Mehanizmi koji upravljaju procesom elongacije tokom sinteze eukariotske iRNK razotkrivaju se nedavnim studijama. Ove studije su dovele do očekivanog otkrića raznolike kolekcije faktora transkripcije koji direktno reguliraju aktivnosti RNK-polimeraze II i neočekivanog otkrića uloge mnogih faktora elongacije u drugim osnovnim procesima, kao što su popravak DNK, rekombinacije itd. Transkripcijski mehanizam i strukturni karakteristike glavnih RNK-polimeraza konzervirani su među vrstama. Geni aktivni tokom elongacije spadaju u različite klase kao što su: domaćinski geni , regulirani ćelijskim ciklusom, geni specifični za razvoj i diferencijaciju itd. Lista gena uključenih u elongaciju u posljednje vrijeme raste i uključuje: –TFIIS, DSIF, NELF, P-Tefb i ostale koji su uključeni u zaustavljanje uzrokovano lijekom ili sekvencom ovisnoog –TFIIF, ELL, elongin, elongator itd., koji su uključeni u povećanje katalitske brzine elongacije promjenom Km i/ili Vmax Pol II –FACT, Paf1 i drugih faktora koji su uključeni u modifikaciju hromatina – proteini za popravak DNK, faktori eksporta i prerade RNK, 19S proteasom i niz drugih faktora kao što su Spt5-Spt5, Paf1 i NELF kompleksi, FCP1P itd.[8].
Elongacija također predstavlja procesnu fazu transkripcije u kojoj se aktivnosti nekoliko faktora prerade iRNK spajaju na transkripciju kroz njihovo vezivanje za RNK-polimerazu (Pol II). Jedan od ključnih događaja koji omogućava ovu interakciju je diferencijalna fosforilacija Pol II CTD. Obrazac fosforilacije CTD menja se tokom transkripcije, a najznačajnije na početku i tokom procesa elongacije. TFIIH-zavisna Ser5 fosforilacija je primećena prvenstveno u promotorskim regijama, dok se fosforilacija Ser2 posredovana sa P-Tefb viđa uglavnom u kodirajućim sekvencama, tokom elongacije. Eksperimentalni dokazi sugeriraju dinamičku povezanost faktora prerade RNK s različito modificiranim oblicima polimeraze tokom ciklusa transkripcije.[9][10][11][12]
- Izvori
- REACTOME: R-HSA-75955
Reference uredi
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000144597 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021890 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Simone F, Polak PE, Kaberlein JJ, Luo RT, Levitan DA, Thirman MJ (juli 2001). "EAF1, a novel ELL-associated factor that is delocalized by expression of the MLL-ELL fusion protein". Blood. 98 (1): 201–9. doi:10.1182/blood.V98.1.201. PMID 11418481.
- ^ "Entrez Gene: EAF1 ELL associated factor 1".
- ^ "UniProt, Q96JC9" (jezik: engleski). Pristupljeno 3. 11. 2021.
- ^ Arndt i Kane, 2003.
- ^ Komarnitsky et al., 2000)
- ^ Komarnitsky et al 2000
- ^ Arndt & Kane 2003
- ^ Shilatifard et al 2003
Dopunska literatura uredi
- Polak PE, Simone F, Kaberlein JJ, Luo RT, Thirman MJ (april 2003). "ELL and EAF1 are Cajal body components that are disrupted in MLL-ELL leukemia". Molecular Biology of the Cell. 14 (4): 1517–28. doi:10.1091/mbc.E02-07-0394. PMC 153119. PMID 12686606.
- Kong SE, Banks CA, Shilatifard A, Conaway JW, Conaway RC (juli 2005). "ELL-associated factors 1 and 2 are positive regulators of RNA polymerase II elongation factor ELL". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (29): 10094–8. doi:10.1073/pnas.0503017102. PMC 1177379. PMID 16006523.
- Xiao W, Jiang F, Wang Z (januar 2006). "ELL binding regulates U19/Eaf2 intracellular localization, stability, and transactivation". The Prostate. 66 (1): 1–12. doi:10.1002/pros.20309. PMID 16114057. S2CID 32749490.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (novembar 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Jiang F, Ai J, Xiao W, Wang Z (august 2007). "FB1, an E2A fusion partner in childhood leukemia, interacts with U19/EAF2 and inhibits its transcriptional activity". Cancer Letters. 253 (2): 265–72. doi:10.1016/j.canlet.2007.02.003. PMC 1989770. PMID 17395368.