Wikipedia

ASPM

Nenormalni vretenoliki mikrocefaliji-pridruženi protein, znan i kao nenormalni homolog vretenskog proteina ili Asp homolog, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa hromosoma 1, sekvenca q31 (1q31).[5][6] "ASPM" gen sadrži 28 egzona i kodira protein dug 3.477 aminokiselina.[6] ASPM protein je konzercviran među vrstama uključujući ljude, miša, rod Drosophila i C. elegans.[6] Defektni oblici ASPM gena povezani su sa autosomno recesivnom primarnom mikrocefalijom.[5][7]

ASPM
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

5LB7

Identifikatori
AliasiASPM
Vanjski ID-jeviOMIM: 605481 MGI: 1334448 HomoloGene: 7650 GeneCards: ASPM
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za ASPM
Genomska lokacija za ASPM
Bend1q31.3Početak197,084,121 bp[1]
Kraj197,146,694 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za ASPM
Genomska lokacija za ASPM
Bend1|1 FPočetak139,382,510 bp[2]
Kraj139,421,829 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• calmodulin binding
• protein kinase binding
• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta• citoplazma
• mitotic spindle pole
• spindle pole
• meiotic spindle
• Diobeno vreteno
• midbody
• Mikrotubula
• citoskelet
• jedro
• microtubule minus-end
• centrosom
• apical plasma membrane
Biološki proces• positive regulation of neuroblast proliferation
• maintenance of centrosome location
• male gonad development
• negative regulation of neuron differentiation
• forebrain neuroblast division
• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
• regulation of meiotic cell cycle
• neuron migration
• Ovogeneza
• neuronal stem cell population maintenance
• Ćelijska dioba
• brain development
• GO:0043146 spindle organization
• developmental growth
• Spermatogeneza
• negative regulation of asymmetric cell division
• cerebral cortex development
• ćelijski ciklus
• spindle localization
• meiotic spindle assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

259266

12316

Ensembl

ENSG00000066279

ENSMUSG00000033952

UniProt

Q8IZT6

Q8CJ27

RefSeq (mRNK)

NM_018136
NM_001206846

NM_009791

RefSeq (bjelančevina)

NP_001193775
NP_060606

NP_033921

Lokacija (UCSC)Chr 1: 197.08 – 197.15 MbChr 1: 139.38 – 139.42 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 3.477 aminokiselina, a molekulska težina 409.800 Da.[8]

1020304050
MANRRVGRGCWEVSPTERRPPAGLRGPAAEEEASSPPVLSLSHFCRSPFL
CFGDVLLGASRTLSLALDNPNEEVAEVKISHFPAADLGFSVSQRCFVLQP
KEKIVISVNWTPLKEGRVREIMTFLVNDVLKHQAILLGNAEEQKKKKRSL
WDTIKKKKISASTSHNRRVSNIQNVNKTFSVSQKVDRVRSPLQACENLAM
NEGGPPTENNSLILEENKIPISPISPAFNECHGATCLPLSVRRSTTYSSL
HASENRELLNVHSANVSKVSFNEKAVTETSFNSVNVNGQRGENSKLSLTP
NCSSTLNITQSQIHFLSPDSFVNNSHGANNELELVTCLSSDMFMKDNSQP
VHLESTIAHEIYQKILSPDSFIKDNYGLNQDLESESVNPILSPNQFLKDN
MAYMCTSQQTCKVPLSNENSQVPQSPEDWRKSEVSPRIPECQGSKSPKAI
FEELVEMKSNYYSFIKQNNPKFSAVQDISSHSHNKQPKRRPILSATVTKR
KATCTRENQTEINKPKAKRCLNSAVGEHEKVINNQKEKEDFHSYLPIIDP
ILSKSKSYKNEVTPSSTTASVARKRKSDGSMEDANVRVAITEHTEVREIK
RIHFSPSEPKTSAVKKTKNVTTPISKRISNREKLNLKKKTDLSIFRTPIS
KTNKRTKPIIAVAQSSLTFIKPLKTDIPRHPMPFAAKNMFYDERWKEKQE
QGFTWWLNFILTPDDFTVKTNISEVNAATLLLGIENQHKISVPRAPTKEE
MSLRAYTARCRLNRLRRAACRLFTSEKMVKAIKKLEIEIEARRLIVRKDR
HLWKDVGERQKVLNWLLSYNPLWLRIGLETTYGELISLEDNSDVTGLAMF
ILNRLLWNPDIAAEYRHPTVPHLYRDGHEEALSKFTLKKLLLLVCFLDYA
KISRLIDHDPCLFCKDAEFKASKEILLAFSRDFLSGEGDLSRHLGLLGLP
VNHVQTPFDEFDFAVTNLAVDLQCGVRLVRTMELLTQNWDLSKKLRIPAI
SRLQKMHNVDIVLQVLKSRGIELSDEHGNTILSKDIVDRHREKTLRLLWK
IAFAFQVDISLNLDQLKEEIAFLKHTKSIKKTISLLSCHSDDLINKKKGK
RDSGSFEQYSENIKLLMDWVNAVCAFYNKKVENFTVSFSDGRVLCYLIHH
YHPCYVPFDAICQRTTQTVECTQTGSVVLNSSSESDDSSLDMSLKAFDHE
NTSELYKELLENEKKNFHLVRSAVRDLGGIPAMINHSDMSNTIPDEKVVI
TYLSFLCARLLDLRKEIRAARLIQTTWRKYKLKTDLKRHQEREKAARIIQ
LAVINFLAKQRLRKRVNAALVIQKYWRRVLAQRKLLMLKKEKLEKVQNKA
ASLIQGYWRRYSTRQRFLKLKYYSIILQSRIRMIIAVTSYKRYLWATVTI
QRHWRAYLRRKQDQQRYEMLKSSTLIIQSMFRKWKQRKMQSQVKATVILQ
RAFREWHLRKQAKEENSAIIIQSWYRMHKELRKYIYIRSCVVIIQKRFRC
FQAQKLYKRRKESILTIQKYYKAYLKGKIERTNYLQKRAAAIQLQAAFRR
LKAHNLCRQIRAACVIQSYWRMRQDRVRFLNLKKTIIKFQAHVRKHQQRQ
KYKKMKKAAVIIQTHFRAYIFAMKVLASYQKTRSAVIVLQSAYRGMQARK
MYIHILTSVIKIQSYYRAYVSKKEFLSLKNATIKLQSTVKMKQTRKQYLH
LRAAALFIQQCYRSKKIAAQKREEYMQMRESCIKLQAFVRGYLVRKQMRL
QRKAVISLQSYFRMRKARQYYLKMYKAIIVIQNYYHAYKAQVNQRKNFLQ
VKKAATCLQAAYRGYKVRQLIKQQSIAALKIQSAFRGYNKRVKYQSVLQS
IIKIQRWYRAYKTLHDTRTHFLKTKAAVISLQSAYRGWKVRKQIRREHQA
ALKIQSAFRMAKAQKQFRLFKTAALVIQQNFRAWTAGRKQCMEYIELRHA
VLVLQSMWKGKTLRRQLQRQHKCAIIIQSYYRMHVQQKKWKIMKKAALLI
QKYYRAYSIGREQNHLYLKTKAAVVTLQSAYRGMKVRKRIKDCNKAAVTI
QSKYRAYKTKKKYATYRASAIIIQRWYRGIKITNHQHKEYLNLKKTAIKI
QSVYRGIRVRRHIQHMHRAATFIKAMFKMHQSRISYHTMRKAAIVIQVRC
RAYYQGKMQREKYLTILKAVKVLQASFRGVRVRRTLRKMQTAATLIQSNY
RRYRQQTYFNKLKKITKTVQQRYWAMKERNIQFQRYNKLRHSVIYIQAIF
RGKKARRHLKMMHIAATLIQRRFRTLMMRRRFLSLKKTAILIQRKYRAHL
CTKHHLQFLQVQNAVIKIQSSYRRWMIRKRMREMHRAATFIQSTFRMHRL
HMRYQALKQASVVIQQQYQANRAAKLQRQHYLRQRHSAVILQAAFRGMKT
RRHLKSMHSSATLIQSRFRSLLVRRRFISLKKATIFVQRKYRATICAKHK
LYQFLHLRKAAITIQSSYRRLMVKKKLQEMQRAAVLIQATFRMYRTYITF
QTWKHASILIQQHYRTYRAAKLQRENYIRQWHSAVVIQAAYKGMKARQLL
REKHKASIVIQSTYRMYRQYCFYQKLQWATKIIQEKYRANKKKQKVFQHN
ELKKETCVQAGFQDMNIKKQIQEQHQAAIIIQKHCKAFKIRKHYLHLRAT
VVSIQRRYRKLTAVRTQAVICIQSYYRGFKVRKDIQNMHRAATLIQSFYR
MHRAKVDYETKKTAIVVIQNYYRLYVRVKTERKNFLAVQKSVRTIQAAFR
GMKVRQKLKNVSEEKMAAIVNQSALCCYRSKTQYEAVQSEGVMIQEWYKA
SGLACSQEAEYHSQSRAAVTIQKAFCRMVTRKLETQKCAALRIQFFLQMA
VYRRRFVQQKRAAITLQHYFRTWQTRKQFLLYRKAAVVLQNHYRAFLSAK
HQRQVYLQIRSSVIIIQARSKGFIQKRKFQEIKNSTIKIQAMWRRYRAKK
YLCKVKAACKIQAWYRCWRAHKEYLAILKAVKIIQGCFYTKLERTRFLNV
RASAIIIQRKWRAILPAKIAHEHFLMIKRHRAACLIQAHYRGYKGRQVFL
RQKSAALIIQKYIRAREAGKHERIKYIEFKKSTVILQALVRGWLVRKRFL
EQRAKIRLLHFTAAAYYHLNAVRIQRAYKLYLAVKNANKQVNSVICIQRW
FRARLQEKRFIQKYHSIKKIEHEGQECLSQRNRAASVIQKAVRHFLLRKK
QEKFTSGIIKIQALWRGYSWRKKNDCTKIKAIRLSLQVVNREIREENKLY
KRTALALHYLLTYKHLSAILEALKHLEVVTRLSPLCCENMAQSGAISKIF
VLIRSCNRSIPCMEVIRYAVQVLLNVSKYEKTTSAVYDVENCIDILLELL
QIYREKPGNKVADKGGSIFTKTCCLLAILLKTTNRASDVRSRSKVVDRIY
SLYKLTAHKHKMNTERILYKQKKNSSISIPFIPETPVRTRIVSRLKPDWV
LRRDNMEEITNPLQAIQMVMDTLGIPY

Funkcija

uredi

"ASPM" je akronim za "Abnormal Spindle-like, Microcephaly-associated" (=nenormalni vretenoliki mikrocefaliji pridruženi protein), što odražava da je ortolog za gen abnormalnog vretena (asp) Drosophila melanogaster. iEksprimirani proteinski proizvod asp gena je neophodan za normalnu funkciju vretenskog aparata u embrionskim neuroblastima i regulaciju neurogeneze.[6][9]

Novi alel ASPM nastao je negdje u posljednjih 14.000 godina (srednja procjena 5.800 godina), tokom holocena, zahvativši veći dio evropske i bliskoistočne populacije. Iako je novi alel očigledno koristan, njegovo djelovanje nije poznato.

Evolucija

uredi

Novi alel ima učestalost od oko 50% u populacijama Bliskog istoka i Evrope, rjeđi je u istočnoj Aziji, a ima nisku učestalost među populacijama subsaharske Afrike.[10] > Također ima neobično visoku učestalost među ljudima Papua Nove Gvineje, sa 59,4%.[11]

Procijenjena srednja starost alela ASPM od prije 5.800 godina u gruboj je korelaciji sa razvojem pisanog jezika, širenjem poljoprivrede i razvojem gradova.[12] Za sada postoje dva alela ovog gena: stariji (prije 5.800 godina) i noviji (nakon toga). Oko 10% ljudi ima dvije kopije novog alela ASPM, dok oko 50% ima dvije kopije starog. Ostalih 40% ima po jednu kopiju svakog od njih. Od onih sa kopijom novog alela, 50% njih je sa identičnom kopijom.[13][14] Alel utiče na genotip u velikom (62 kbp) regionu, takozvano selekcijsko ćišćenje, koji signalizira brzo širenje mutacije (kao što je novi ASPM) kroz populaciju; ovo ukazuje da je mutacija na neki način korisna za pojedinca.[11][15]

• Testiranje IQ-a onih sa i bez novog ASPM alela nije pokazalo razliku u prosječnom IQ-u, ne pružajući nikakve dokaze koji podržavaju ideju da gen povećava inteligenciju.[15][16][17] Međutim, statistička analiza pokazala je da se stariji oblici gena češće nalaze u populacijama koje govore tonski jezik kao kineski ili mnoge podsaharske afričke jezike.[18] Ostali geni povezani s razvojem mozga bili su pod selektivnim pritiskom u različitim populacijama. Gen DAB1, uključen u organizovanje ćelijskih slojeva u moždanoj kori, pokazuje dokaze selektivnog zamaha/čišćenja u Kineza. Gen SV2B, koji kodira protein sinapsnih vezikula, također ima dokaze selektivnog čišćenja kod Afroamerikanaca.[19][20]

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000066279 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033952 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Pattison L, Crow YJ, Deeble VJ, Jackson AP, Jafri H, Rashid Y, Roberts E, Woods CG (decembar 2000). "A fifth locus for primary autosomal recessive microcephaly maps to chromosome 1q31". American Journal of Human Genetics. 67 (6): 1578–80. doi:10.1086/316910. PMC 1287934. PMID 11078481.
  6. ^ a b c d Bond J, Roberts E, Mochida GH, Hampshire DJ, Scott S, Askham JM, Springell K, Mahadevan M, Crow YJ, Markham AF, Walsh CA, Woods CG (oktobar 2002). "ASPM is a major determinant of cerebral cortical size". Nature Genetics. 32 (2): 316–20. doi:10.1038/ng995. PMID 12355089. S2CID 14855140.
  7. ^ Kaindl AM, Passemard S, Kumar P, Kraemer N, Issa L, Zwirner A, Gerard B, Verloes A, Mani S, Gressens P (mart 2010). "Many roads lead to primary autosomal recessive microcephaly". Progress in Neurobiology. 90 (3): 363–83. doi:10.1016/j.pneurobio.2009.11.002. PMID 19931588. S2CID 35631370.
  8. ^ "UniProt, Q8IZT6" (jezik: en.). Pristupljeno 7. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
  9. ^ Kouprina N, Pavlicek A, Collins NK, Nakano M, Noskov VN, Ohzeki J, Mochida GH, Risinger JI, Goldsmith P, Gunsior M, Solomon G, Gersch W, Kim JH, Barrett JC, Walsh CA, Jurka J, Masumoto H, Larionov V (august 2005). "The microcephaly ASPM gene is expressed in proliferating tissues and encodes for a mitotic spindle protein". Human Molecular Genetics. 14 (15): 2155–65. doi:10.1093/hmg/ddi220. PMID 15972725.
  10. ^ Evans PD, Gilbert SL, Mekel-Bobrov N, Vallender EJ, Anderson JR, Vaez-Azizi LM, Tishkoff SA, Hudson RR, Lahn BT (septembar 2005). "Microcephalin, a gene regulating brain size, continues to evolve adaptively in humans". Science. 309 (5741): 1717–1720. Bibcode:2005Sci...309.1717E. doi:10.1126/science.1113722. PMID 16151009. S2CID 85864492. Sažetak – New York Times: Researchers Say Human Brain Is Still Evolving.
  11. ^ a b Mekel-Bobrov N, Gilbert SL, Evans PD, Vallender EJ, Anderson JR, Hudson RR, Tishkoff SA, Lahn BT (septembar 2005). "Ongoing adaptive evolution of ASPM, a brain size determinant in Homo sapiens". Science. 309 (5741): 1720–1722. Bibcode:2005Sci...309.1720M. doi:10.1126/science.1116815. PMID 16151010. S2CID 30403575.
  12. ^ Prema dokumentarnoj seriji Discovery Channel/Channel 4 iz 2006. Šta nas čini ljudima?
  13. ^ Inman M (2005). "Human brains enjoy ongoing evolution". New Scientist.
  14. ^ Evans PD, Gilbert SL, Mekel-Bobrov N, Vallender EJ, Anderson JR, Vaez-Azizi LM, Tishkoff SA, Hudson RR, Lahn BT (septembar 2005). "Microcephalin, a gene regulating brain size, continues to evolve adaptively in humans". Science. 309 (5741): 1717–20. Bibcode:2005Sci...309.1717E. doi:10.1126/science.1113722. PMID 16151009. S2CID 85864492.
  15. ^ a b Currat M, Excoffier L, Maddison W, Otto SP, Ray N, Whitlock MC, Yeaman S (juli 2006). "Comment on 'Ongoing adaptive evolution of ASPM, a brain size determinant in Homo sapiens' and 'Microcephalin, a gene regulating brain size, continues to evolve adaptively in humans'". Science. 313 (5784): 172, author reply 172. doi:10.1126/science.1122712. PMID 16840683.
  16. ^ Woods RP, Freimer NB, De Young JA, Fears SC, Sicotte NL, Service SK, Valentino DJ, Toga AW, Mazziotta JC (juni 2006). "Normal variants of Microcephalin and ASPM do not account for brain size variability". Human Molecular Genetics. 15 (12): 2025–2029. doi:10.1093/hmg/ddl126. PMID 16687438.
  17. ^ Mekel-Bobrov N, Posthuma D, Gilbert SL, Lind P, Gosso MF, Luciano M, Harris SE, Bates TC, Polderman TJ, Whalley LJ, Fox H, Starr JM, Evans PD, Montgomery GW, Fernandes C, Heutink P, Martin NG, Boomsma DI, Deary IJ, Wright MJ, de Geus EJ, Lahn BT (mart 2007). "The ongoing adaptive evolution of ASPM and Microcephalin is not explained by increased intelligence". Human Molecular Genetics. 16 (6): 600–608. doi:10.1093/hmg/ddl487. PMID 17220170.
  18. ^ Dediu D, Ladd DR (juni 2007). "Linguistic tone is related to the population frequency of the adaptive haplogroups of two brain size genes, ASPM and Microcephalin". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (26): 10944–10949. Bibcode:2007PNAS..10410944D. doi:10.1073/pnas.0610848104. PMC 1904158. PMID 17537923. Sažetak – New Scientist: Genes may help people learn Chinese.
  19. ^ Williamson SH, Hubisz MJ, Clark AG, Payseur BA, Bustamante CD, Nielsen R (juni 2007). "Localizing recent adaptive evolution in the human genome". PLOS Genetics. 3 (6): e90. doi:10.1371/journal.pgen.0030090. PMC 1885279. PMID 17542651.
  20. ^ Wade N (26. 6. 2007). "Humans Have Spread Globally, and Evolved Locally". New York Times. Pristupljeno 1. 8. 2009.

Vanjski linkovi

uredi
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=ASPM&oldid=3647437"