APOA4

Apolipoprotein A-IV (znan i kao apoA-IV, apoAIV ili apoA4) je plazmatski protein koji je kod ljudi kodiran genom APOA4.[5][6]

APOA4
Identifikatori
AliasiAPOA4
Vanjski ID-jeviOMIM: 107690 MGI: 88051 HomoloGene: 47927 GeneCards: APOA4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za APOA4
Genomska lokacija za APOA4
Bend11q23.3Početak116,820,700 bp[1]
Kraj116,823,304 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za APOA4
Genomska lokacija za APOA4
Bend9 A5.2|9 25.36 cMPočetak46,240,696 bp[2]
Kraj46,243,459 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
PBB GE APOA4 206894 at fs.png
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000482

NM_007468

RefSeq (bjelančevina)

n/a

NP_031494

Lokacija (UCSC)Chr 11: 116.82 – 116.82 MbChr 9: 46.24 – 46.24 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

GenUredi

APOA4 se nalazi na hromosomu 11 u bliskoj vezi sa APOA1 i APOC3. APOA4 sadrži tri egzona odvojena s dva introna i predstavlja polimorfni), iako se većina prijavljenih polimorfnih sekvenci javlja u egzonu 3. Najbolje potvrđeni i proučeni nesinonimni jednonuklrotidni polimorfizmi (SNP9) su supstitucija glutaminhistidin na kodonu 360 i treoninserin zamjena na kodonu 347; polimorfizam sekvence je također identifikovan u 3' UTR trećeg egzona.[7] Uporedna analiza sekvenci gena unutar vrste sugeriše da je gen APOA4 nastao iz APOA1, duplikacijom gena prije približno 270 miliona godina.[8]

Aminokiselinska sekvencaUredi

Dužina polipeptidnog lanca je 396 aminokiselina, a molekulska težina 45 399 Da.[9]

1020304050
MFLKAVVLTLALVAVAGARAEVSADQVATVMWDYFSQLSNNAKEAVEHLQ
KSELTQQLNALFQDKLGEVNTYAGDLQKKLVPFATELHERLAKDSEKLKE
EIGKELEELRARLLPHANEVSQKIGDNLRELQQRLEPYADQLRTQVNTQA
EQLRRQLTPYAQRMERVLRENADSLQASLRPHADELKAKIDQNVEELKGR
LTPYADEFKVKIDQTVEELRRSLAPYAQDTQEKLNHQLEGLTFQMKKNAE
ELKARISASAEELRQRLAPLAEDVRGNLRGNTEGLQKSLAELGGHLDQQV
EEFRRRVEPYGENFNKALVQQMEQLRQKLGPHAGDVEGHLSFLEKDLRDK
VNSFFSTFKEKESQDKTLSLPELEQQQEQQQEQQQEQVQMLAPLES

FunkcijaUredi

Primarni produkt translacije gena APOA4 je preprotein sa 396 ostataka, koji se podvrgava proteolitskoj obradi, kako bi se dobio apo A-IV, zreli O-vezani glikoprotein sa 376 ostataka. Kod većine sisavara, uključujući ljude, sinteza apo A-IV ograničena je na crijeva; međutim, kod miševa i pacova dolazi do sinteze u jetri. Apo A-IV se izlučuje u cirkulaciju na površini novosintetiziranih hilomikronskih čestica. Apsorpcija masti u crijevima dramatično povećava sintezu i lučenje apo A-IV. Iako njegova primarna funkcija u metabolizmu lipida u ljudi nije utvrđena, otkriveno je da apo A-IV:

Nedostatak judskog apo A-IV nije prijavljen.

InterakcijeUredi

Dokazano je da APOA4 stupa u interakciju sa [10]

Interaktivna mapa putaUredi

Šablon:StatinPathway WP430

ReferenceUredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000110244 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032080 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Karathanasis SK, Oettgen P, Haddad IA, Antonarakis SE (November 1986). "Structure, evolution, and polymorphisms of the human apolipoprotein A4 gene (APOA4)". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 83 (22): 8457–61. Bibcode:1986PNAS...83.8457K. doi:10.1073/pnas.83.22.8457. PMC 386949. PMID 3095836.
  6. ^ Elshourbagy NA, Walker DW, Paik YK, Boguski MS, Freeman M, Gordon JI, Taylor JM (June 1987). "Structure and expression of the human apolipoprotein A-IV gene". J. Biol. Chem. 262 (17): 7973–81. PMID 3036793.
  7. ^ a b "Entrez Gene: APOA4 apolipoprotein A-IV".
  8. ^ Luo CC, Li WH, Moore MN, Chan L (February 1986). "Structure and evolution of the apolipoprotein multigene family". J. Mol. Biol. 187 (3): 325–340. doi:10.1016/0022-2836(86)90436-5. PMID 3084795.
  9. ^ "UniProt, P06727". Pristupljeno 2021-08-16. CS1 održavanje: nepreporučeni parametar (link)
  10. ^ Deeg, M A; Bierman E L; Cheung M C (March 2001). "GPI-specific phospholipase D associates with an apoA-I- and apoA-IV-containing complex". J. Lipid Res. United States. 42 (3): 442–51. ISSN 0022-2275. PMID 11254757.

Dopunska literaturaUredi

Vanjski linkoviUredi

Šablon:Lipoproteini