Protein 3 sa domenom SH3 koji veže bogatstvo glutaminske kiseline jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SH3BGRL3 sa hromosoma 1.[5]

SH3BGRL3
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1SJ6

Identifikatori
AliasiSH3BGRL3
Vanjski ID-jeviOMIM: 615679 MGI: 1920973 HomoloGene: 41824 GeneCards: SH3BGRL3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za SH3BGRL3
Genomska lokacija za SH3BGRL3
Bend1p36.11Početak26,280,086 bp[1]
Kraj26,281,522 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za SH3BGRL3
Genomska lokacija za SH3BGRL3
Bend4|4 D2.3Početak133,854,717 bp[2]
Kraj133,856,100 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija electron transfer activity
protein-disulfide reductase activity
Ćelijska komponenta jedro
Egzosom
citoplazma
nuclear body
Biološki proces cell redox homeostasis
Lanac transporta elektrona
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_031286

NM_080559

RefSeq (bjelančevina)

NP_112576

NP_542126

Lokacija (UCSC)Chr 1: 26.28 – 26.28 MbChr 4: 133.85 – 133.86 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

To je 10,5 kDa protein SH3 koji vezuje protein 3 bogat glutaminskom kiselinom, koji ima izoelektričnu tačku 5,0. SH3 vezujući gen bogat glutaminskom kiselinom (SH3BGR) nalazi se na ljudskom hromosomu 21. Dva homologna gena, SH3BGRL i SH3BGRL3 nalaze se na hromosomskim regijama Xq13.3 i 1p34.3-35 i kodiraju za male proteine slične N-terminalnoj regiji proteina SH3BGR.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 93 aminokiseline, a molekulska težina 10.438 Da.[7]

1020304050
MSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEM
RALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA

Funkcija

uredi

SH3BGRL3 protein pokazuje značajnu sličnost sa glutaredoksinom 1 iz E. coli, a predviđa se da sva tri proteina pripadaju porodici proteina sličnih tioredoksinu. Glutaredoksini (GRX) su sveprisutne oksidoreduktaze, koje katalizuju redukciju mnogih unutarćelijskih proteinskih disulfida i imaju važnu ulogu u mnogim redoks putevima. Međutim, proteinu SH3BGRL3 nedostaje enzimska funkcija glutaredoksina i može imati ulogu regulatora redoks aktivnosti.[8]

Klinički značaj

uredi

Proteini kao što su glutaredoksin i tioredoksin prijavljeni su kao pojačano regulirani kod mnogih karcinoma kao što su rak pluća i pankreasa; uključeni suu povećanu otpornost ćelija raka na slobodne radikale. Malo je disadašnjih dokaza koji direktno povezuju SH3GRPL3 sa preživljavanjem u ćelijama raka,ali nedavno je utvrđeno da je protein povećan u glioblastomu multiforme u poređenju sa normalnim tkivom korteksa na proteomskoj analizi.[9] Studije akutne promijelocitne leukemije nađeno je da su ćelijske linije NB4 također imale povećanje regulacije proteina. Nasuprot tome, razima srodnog proteina SH3BGRL je smanjena u fibroblastima, limfoidnim ćelijama i slezenskim tumorskim ćelijama transformieranim virusnim onkogenom v-Rel .[10] Koekspresija SH3BGRL sa v-Rel u primarnim limfocitima slezene smanjila je broj formiranih kolonija za 76%. Xu et al. prijavili su protein SH3BGRPL3 kao posttranslacijsku modifikaciju 27kDa inhibitornog proteina faktora nekroze tumora alfa (TNF-α), TIP-B1. Ovaj protein je potencijalno uključen u otpornost ćelija na efekat TNF-α koji izaziva apoptoze.[11]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000142669 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028843 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: SH3BGRL3 SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3".
  6. ^ Egeo A, Mazzocco M, Arrigo P, Vidal-Taboada JM, Oliva R, Pirola B, Giglio S, Rasore-Quartino A, Scartezzini P (juni 1998). "Identification and characterization of a new human gene encoding a small protein with high homology to the proline-rich region of the SH3BGR gene". Biochem. Biophys. Res. Commun. 247 (2): 302–6. doi:10.1006/bbrc.1998.8763. PMID 9642120.
  7. ^ "UniProt, Q9H299" (jezik: eng.). Pristupljeno 5. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
  8. ^ Mazzocco M, Maffei M, Egeo A, Vergano A, Arrigo P, Di Lisi R, Ghiotto F, Scartezzini P (maj 2002). "The identification of a novel human homologue of the SH3 binding glutamic acid-rich (SH3BGR) gene establishes a new family of highly conserved small proteins related to Thioredoxin Superfamily". Gene. 291 (1–2): 233–9. doi:10.1016/S0378-1119(02)00602-9. PMID 12095696.
  9. ^ Khalil AA, James P (februar 2007). "Biomarker discovery: a proteomic approach for brain cancer profiling". Cancer Sci. 98 (2): 201–13. doi:10.1111/j.1349-7006.2007.00374.x. PMID 17233837.
  10. ^ Majid SM, Liss AS, You M, Bose HR (februar 2006). "The suppression of SH3BGRL is important for v-Rel-mediated transformation". Oncogene. 25 (5): 756–68. doi:10.1038/sj.onc.1209107. PMID 16186799.
  11. ^ Xu C, Zheng P, Shen S, Xu Y, Wei L, Gao H, Wang S, Zhu C, Tang Y, Wu J, Zhang Q, Shi Y (maj 2005). "NMR structure and regulated expression in APL cell of human SH3BGRL3". FEBS Lett. 579 (13): 2788–94. doi:10.1016/j.febslet.2005.04.011. PMID 15907482.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi