Ras-pridruženi protein 9 sa domenom (RASSF9), znan i kao PAM COOH-terminalni interactorski protein 1 (PCIP1) ili peptidilglicin alpha-amidacijski monooksigenazni COOH-terminalni interaktor (PAMCI) je protein koji je kod ljudi kodiran genom RASSF9.[5]

RASSF9
Identifikatori
AliasiRASSF9
Vanjski ID-jeviOMIM: 610383 MGI: 2384307 HomoloGene: 3976 GeneCards: RASSF9
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za RASSF9
Genomska lokacija za RASSF9
Bend12q21.31Početak85,800,703 bp[1]
Kraj85,836,409 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za RASSF9
Genomska lokacija za RASSF9
Bend10|10 D1Početak102,348,083 bp[2]
Kraj102,385,597 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
transporter activity
Ćelijska komponenta citosol
endozom
trans-Golgi network transport vesicle membrane
Egzosom
reciklirajući endosom
Biološki proces Ciljanje proteina
GO:0072468 Transdukcija signala
endosomal transport
intracellular transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005447

NM_146240

RefSeq (bjelančevina)

NP_005438

NP_666352

Lokacija (UCSC)Chr 12: 85.8 – 85.84 MbChr 10: 102.35 – 102.39 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 435 aminokiselina, a molekulska težina 50.021 Da.[6].

1020304050
MAPFGRNLLKTRHKNRSPTKDMDSEEKEIVVWVCQEEKLVCGLTKRTTSA
DVIQALLEEHEATFGEKRFLLGKPSDYCIIEKWRGSERVLPPLTRILKLW
KAWGDEQPNMQFVLVKADAFLPVPLWRTAEAKLVQNTEKLWELSPANYMK
TLPPDKQKRIVRKTFRKLAKIKQDTVSHDRDNMETLVHLIISQDHTIHQQ
VKRMKELDLEIEKCEAKFHLDRVENDGENYVQDAYLMPSFSEVEQNLDLQ
YEENQTLEDLSESDGIEQLEERLKYYRILIDKLSAEIEKEVKSVCIDINE
DAEGEAASELESSNLESVKCDLEKSMKAGLKIHSHLSGIQKEIKYSDSLL
QMKAKEYELLAKEFNSLHISNKDGCQLKENRAKESEVPSSNGEIPPFTQR
VFSNYTNDTDSDTGISSNHSQDSETTVGDVVLLST
Simboli

Funkcija

uredi

RASSF9 je N-terminalni RASSF član porodice Ras-pridruženog (RalGDS / AF-6) domena porodice (N-terminalnih proteina), član 9 sekvenca 12q21.31,[7][8] jedan od dva nova divlja tipa RASSF9 i RASSF10[8] proteina. Tri proteina koji stupaju u interakciju s fragmentom PAM citosolnog domena, koji sadrži signalizaciju kompleksa RA1 i RA2ras, prekidač I i II.[9] RASSF7, prvi član porodice N-terminaliziranih RASSF potreban je za mitozu.[8] Nedavno je otkriveno da je RASSF9 uključen u regulaciju epidermne homeostaze.[10]

Regulacija

uredi

Mutantska regija koja kodira PAM COOH-terminalni interakcijski protein-1 (P-CIP1) uporediva je s onom ljudske hromosomske pruge 4.1 TF (protein krvne plazme), kao endosomni put za recikliranje[7] na lokacijama mikrotubula, da NOT veže RasGTP.[11] Specifičnost interakcije može biti povezana s lokacijama mikrotubula u sistemu endosomnolizosomsko lokaliziranim unutar centrosoma s transferinom i različitim Ras proteinima ili s tim (N-Ras), ali s druge strane, stupa u interakciju s tri[12] (Ha-Ras, potporodica RasKi-Ras,[13] i Rap[14]) funkcije ostataka,[15] blokiran mutacijom koja utiče na funkciju Ras efektora [16] je kritični proizvod t (6:11) abnormalnosti povezane s nekim ljudskim leukemijama, sa oba (6:11) prekidača I i II[13] regija ras[9] i molekule kvaščevih adenilil-ciklaza, koja nose ove mutacije postaju neaktivibilni Ras in vitro.[17] Ostaci u interakciji s Rasom znatno se razlikuju od ostataka iz RalGDS-RBD [18] preko svojih C-terminalnih Ras-vezujućih domena (RBD)).[19] Utvrđeno je da takvi izdvajači kao afadin/AF-6 i Rin1[17] inhibiraju vezivanje Raf za Ras.[15] Molekula adenilil-ciklaza koje nose ove mutacije postaju onemogućene Ras-om in vitro, sa Ras-pridruženim domenpm-RA,[17] ne vezujući se svi RA domeni RasGTP, što je primarno mjesto koje veže Ras.

Interakcije

uredi
  • PAM P prekidač monooksigenaze amidirajuće Peptidil-glicin alfa (PAM)
  • Protein 7 koji sadrži domen RASSF7 Ras asocijacije (HRAS1-srodni klaster proteina 1)
  • BLOC1S2: Biogeneza lizozomskih srodnih organela kompleksa-1, podjedinica 2 (BLOC podjedinica 2)
  • Prekursor TF serotransferina (transferin) (globulin koji veže beta-1-metal)
  • RAB11A protein povezan s Rasom Rab-11A[20]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198774 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000044921 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 9".
  6. ^ "UniProt, O75901". Pristupljeno 14. 8. 2021.
  7. ^ a b Chen L, Johnson RC, Milgram SL (decembar 1998). "P-CIP1, a novel protein that interacts with the cytosolic domain of peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase, is associated with endosomes". J Biol Chem. 273 (50): 33524–32. doi:10.1074/jbc.273.50.33524. PMID 9837933.
  8. ^ a b c Sherwood V, Manbodh R, Sheppard C, Chalmers AD (april 2008). "RASSF7 is a member of a new family of RAS association domain-containing proteins and is required for completing mitosis". Mol Biol Cell. 19 (4): 1772–82. doi:10.1091/mbc.E07-07-0652. PMC 2291435. PMID 18272789.
  9. ^ a b Bunney TD, Harris R, Gandarillas NL, Josephs MB, Roe SM, Sorli SC, Paterson HF, Rodrigues-Lima F, Esposito D, Ponting CP, Gierschik P, Pearl LH, Driscoll PC, Katan M (februar 2006). "Structural and mechanistic insights into ras association domains of phospholipase C epsilon". Mol Cell. 21 (4): 495–507. doi:10.1016/j.molcel.2006.01.008. PMID 16483931.
  10. ^ Lee, CM; Yang P; Chen LC; Chen CC; Wu SC; Cheng HY; Chang YS (21. 3. 2011). "A Novel Role of RASSF9 in Maintaining Epidermal Homeostasis". PLOS ONE. 6 (3): e17867. doi:10.1371/journal.pone.0017867. PMC 3061870. PMID 21445300.
  11. ^ Wojcik J, Girault JA, Labesse G, Chomilier J, Mornon JP, Callebaut I (maj 1999). "Sequence analysis identifies a ras-associating (RA)-like domain in the N-termini of band 4.1/JEF domains and in the Grb7/10/14 adapter family". Biochem Biophys Res Commun. 259 (1): 113–20. doi:10.1006/bbrc.1999.0727. PMID 10334925.
  12. ^ Huang L, Weng X, Hofer F, Martin GS, Kim SH (august 1997). "Three-dimensional structure of the Ras-interacting domain of RalGDS". Nature Structural & Molecular Biology. 4 (8): 609–15. doi:10.1038/nsb0897-609. PMID 9253406. S2CID 1328881.
  13. ^ a b Kuriyama M, Harada N, Kuroda S, Yamamoto T, Nakafuku M, Iwamatsu A, Yamamoto D, Prasad R, Croce C, Canaani E, Kaibuchi K (januar 1996). "Identification of AF-6 and canoe as putative targets for Ras". J Biol Chem. 271 (2): 607–10. doi:10.1074/jbc.271.2.607. PMID 8557659.
  14. ^ Katagiri K, Imamura M, Kinashi T (septembar 2006). "Spatiotemporal regulation of the kinase Mst1 by binding protein RAPL is critical for lymphocyte polarity and adhesion". Nat Immunol. 7 (9): 919–28. doi:10.1038/ni1374. PMID 16892067. S2CID 12337748.
  15. ^ a b Hofer F, Fields S, Schneider C, Martin GS (novembar 1994). "Activated Ras interacts with the Ral guanine nucleotide dissociation stimulator". Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (23): 11089–93. doi:10.1073/pnas.91.23.11089. PMC 45172. PMID 7972015.
  16. ^ Wang J, Williams RW, Manly KF (2003). " BioGPS: NM_005447,. WebQTL: web-based complex trait analysis". Neuroinformatics. 1 (4): 299–08. doi:10.1385/NI:1:4:299. PMID 15043217. Arhivirano s originala, 10. 8. 2017. Pristupljeno 14. 8. 2021.
  17. ^ a b c Kido M, Shima F, Satoh T, Asato T, Kariya K, Kataoka T (februar 2002). "Critical function of the Ras-associating domain as a primary Ras-binding site for regulation of Saccharomyces cerevisiae adenylyl cyclase". J Biol Chem. 277 (5): 3117–23. doi:10.1074/jbc.M109526200. PMID 11723130.
  18. ^ Kigawa T, Endo M, Ito Y, Shirouzu M, Kikuchi A, Yokoyama S (decembar 1998). "Solution structure of the Ras-binding domain of RGL". FEBS Lett. 441 (3): 413–8. doi:10.1016/S0014-5793(98)01596-8. PMID 9891982. S2CID 23727331.
  19. ^ Esser D, Bauer B, Wolthuis RM, Wittinghofer A, Cool RH, Bayer P (septembar 1998). "Structure determination of the Ras-binding domain of the Ral-specific guanine nucleotide exchange factor Rlf". Biochemistry. 37 (39): 13453–62. doi:10.1021/bi9811664. PMID 9753431.
  20. ^ von Mering C, Jensen LJ, Snel B, Hooper SD, Krupp M, Foglierini M, Jouffre N, Huynen MA, Bork P (decembar 2004). "STRING: known and predicted protein-protein associations, integrated and transferred across organisms". Nucleic Acids Res. 33 (Database issue): D433–D437. doi:10.1093/nar/gki005. PMC 539959. PMID 15608232.[mrtav link]

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi