FAM105B

FAM105B
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	3ZNV, 3ZNX, 3ZNZ, 4KSJ, 4KSK, 4KSL, 4OYK, 4P0B
Identifikatori
Aliasi	OTULIN
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615712 MGI: 3577015 HomoloGene: 106591 GeneCards: OTULIN
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 5 (čovjek)
Kraj	14,699,850 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 15 (miš)
Kraj	27,630,779 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• cysteine-type peptidase activity; • thiol-dependent deubiquitinase; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • hydrolase activity;
Ćelijska komponenta	• citosol; • LUBAC complex; • citoplazma;
Biološki proces	• immune system process; • Wnt-signalni put; • Proteoliza; • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway; • Angiogeneza; • canonical Wnt signaling pathway; • sprouting angiogenesis; • protein linear deubiquitination; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • Urođeni imunski sistem; • negative regulation of inflammatory response; • regulation of canonical Wnt signaling pathway; • protein ubiquitination;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	90268
	432940
	ENSG00000154124
	ENSMUSG00000046034
	Q96BN8
	Q3UCV8
	NM_138348
	NM_001013792
	NP_612357
	NP_001013814
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Član B porodice proteina sa sličnošću sekvence 105 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM105B.^[5]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 352 aminokiseline, а molekulska težina 40.263 Da.^[6]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MSRGTMPQPE	AWPGASCAET	PAREAAATAR	DGGKAAASGQ	PRPEMQCPAE
HEEDMYRAAD	EIEKEKELLI	HERGASEPRL	SVAPEMDIMD	YCKKEWRGNT
QKATCMKMGY	EEVSQKFTSI	RRVRGDNYCA	LRATLFQAMS	QAVGLPPWLQ
DPELMLLPEK	LISKYNWIKQ	WKLGLKFDGK	NEDLVDKIKE	SLTLLRKKWA
GLAEMRTAEA	RQIACDELFT	NEAEEYSLYE	AVKFLMLNRA	IELYNDKEKG
KEVPFFSVLL	FARDTSNDPG	QLLRNHLNQV	GHTGGLEQVE	MFLLAYAVRH
TIQVYRLSKY	NTEEFITVYP	TDPPKDWPVV	TLIAEDDRHY	NIPVRVCEET
SL

Funkcija

U jednom istraživanju u 2019., se dnađeno je da linearna ubikvitininacija pojavila se kao važna posttranslacijska modifikacija, koja regulira aktivaciju, upalu i ćelijsku smrt NF-κB u imunskim i neimunskim odjeljcima, uključujući kožu. Deubikvitinaza OTULIN-a posebno rastavlja linearne ubikvitinske lance generirane linearnim kompleksom ubikvitina (LUBAC) i neophodna je za sprječavanje smrtnosti embriona i i autoinflamatorne bolesti. Analizirali su izravnu ulogu OTULIN -a u ćelijskoj smrti i otkrili da OTULIN ograničava apoptozu i nekroptozu u keratinocitima. Tokom apoptoze, OTULIN se cijepa pomoću kaspaze-3 u Asp-31 u C-terminalnom fragmentu koji ograničava aktivaciju kaspaza i ćelijsku smrt. Tokom nekroptoze, OTULIN je hiperfosforiliran na Tyr-56, koji modulira dinamiku ubikvitina RIPK1 i podstiče ćelijsku smrt. OTULIN-ovoj fosforilaciji Tyr-56 suprotstavlja se aktivnost dvostruko specifične fosfataze 14 (DUSP14), koju identificiramo kao OTULIN-fosfatazu koja ograničava nekroptozu. Dobijeni podaci pružaju dokaze o dinamičkim posttranslacijskim modifikacijama OTULIN-a i ističu njihovu važnost u ishodu ćelijske smrti.^[7]

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000154124 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046034 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Family with sequence similarity 105, member B". Pristupljeno 19. 11. 2012.
^ "UniProt, Q96BN8" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 10. 2021.
^ Todd Douglas, Maya Saleh (2019) Post-translational Modification of OTULIN Regulates Ubiquitin Dynamics and Cell Death. Cell Rep, 29(11):3652-3663.e5; pmid: 31825842; doi: 10.1016/j.celrep.2019.11.014

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000154124 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046034 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: Family with sequence similarity 105, member B". Pristupljeno 19. 11. 2012.

[UniProt-6] "UniProt, Q96BN8" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 10. 2021.

[7] Todd Douglas, Maya Saleh (2019) Post-translational Modification of OTULIN Regulates Ubiquitin Dynamics and Cell Death. Cell Rep, 29(11):3652-3663.e5; pmid: 31825842; doi: 10.1016/j.celrep.2019.11.014

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]

[7]