IVD (gen)

U enzimologiji, izovaleril-CoA dehidrogenaza (EC 1.3.8.4) je enzim koji katalizira hemijsku reakciju:

IVD (gen)
Identifikatori
Aliasi
Vanjski ID-jevi	GeneCards: [1]
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	n/a	n/a
Ensembl	n/a	n/a
UniProt	n a	n/a
RefSeq (mRNK)	n/a	n/a
RefSeq (bjelančevina)	n/a	n/a
Lokacija (UCSC)	n/a	n/a
PubMed pretraga	n/a	n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Izovaleril-CoA dehidrogenaza
Isovaleryl-CoA dehydrogenase tetramer, Human}
Identifikatori
EC broj	1.3.8.4
CAS broj	37274-61-6
Baze podataka
IntEnz	IntEnz pregled
BRENDA	BRENDA unos
ExPASy	NiceZyme pregled
KEGG	KEGG unos
MetaCyc	metabolički put
PRIAM	profil
PDB strukture	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
Ontologija gena	AmiGO / QuickGO
Pretraga PMC članci PubMed članci NCBI proteini

3-metilbutanoil-CoA + akceptor $\rightleftharpoons$ 3-metilbut-2-enoil-CoA + reducirani akceptor

Dakle, dva supstrata ovog enzima su 3-metilbutanoil-CoA i akceptor, dok su njegova dva proizvoda 3-metilbut-2-enoil-CoA i reducirani akceptor.

Ovaj enzim pripada porodici oksidoreduktaza, posebno onima koji djeluju na doorsku CH-CH skupinu s drugim akceptorima. sistematsko ime ove enzimske klase je 3-metilbutanoil-CoA: akceptorska oksidoreduktaza. Ostala uobičajena imena uključuju izovaleril-koenzim A dehidrogenaza, izovaleroil-koenzim A dehidrogenaza i 3-metilbutanoil-CoA: akceptorska oksidoreduktaza. Ovaj enzim sudjeluje u razgradnji valina, leucina i izoleucina. Koristi jedan kofaktor, flavin-adenin dinukleotid (FAD).

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 423 aminokiseline, a molekulska težina 46.319 Da.

10		20		30		40		50
MATATRLLGW		RVASWRLRPP		LAGFVSQRAH		SLLPVDDAIN		GLSEEQRQLR
QTMAKFLQEH		LAPKAQEIDR		SNEFKNLREF		WKQLGNLGVL		GITAPVQYGG
SGLGYLEHVL		VMEEISRASG		AVGLSYGAHS		NLCINQLVRN		GNEAQKEKYL
PKLISGEYIG		ALAMSEPNAG		SDVVSMKLKA		EKKGNHYILN		GNKFWITNGP
DADVLIVYAK		TDLAAVPASR		GITAFIVEKG		MPGFSTSKKL		DKLGMRGSNT
CELIFEDCKI		PAANILGHEN		KGVYVLMSGL		DLERLVLAGG		PLGLMQAVLD
HTIPYLHVRE		AFGQKIGHFQ		LMQGKMADMY		TRLMACRQYV		YNVAKACDEG
HCTAKDCAGV		ILYSAECATQ		VALDGIQCFG		GNGYINDFPM		GRFLRDAKLY
EIGAGTSEVR		RLVIGRAFNA		DFH

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Strukturne studije

Krajem 2007. godine, samo je jedna struktura riješena za ovu klasu enzima, sa PDB pristupnim kodom 1IVH 1IVH. Kreirala ga je grupa u kojoj su bili K.A.Tiffany, D.L.Roberts, M.Wang, R.Paschke, A.-W.A.Mohsen, J.Vockley i J.J.P.Kim. Struktura je objavljena 20. maja 1998. Doe. "PDBsum entry: 1ivh". Pristupljeno 25. 11. 2019.

Reference

• BACHHAWAT BK, ROBINSON WG, COON MJ (1956). "Enzymatic carboxylation of beta-hydroxyisovaleryl coenzyme A". J. Biol. Chem. 219 (2): 539–50. PMID 13319276.
• Ikeda Y, Tanaka K (1983). "Purification and characterization of isovaleryl coenzyme A dehydrogenase from rat liver mitochondria". J. Biol. Chem. 258 (2): 1077–85. PMID 6401713.
• Tanaka K, Budd MA, Efron ML, Isselbacher KJ (1966). "Isovaleric acidemia: a new genetic defect of leucine metabolism". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 56 (1): 236–42. Bibcode:1966PNAS...56..236T. doi:10.1073/pnas.56.1.236. PMC 285701. PMID 5229850.