IBD8

Protein 8 upalne bolesti crijeva
Protein 8 upalne bolesti crijeva
Identifikatori
Simbol	IBD8
OMIM	606668
Ostali podaci
Lokus	Hrom. 16 Start: 16:0 –Kraj: 36,800.000 bp p16p; Start: 16:0 –Kraj: 36,800.000 bp{{{lokus_dopunski_podaci}}}

Protein 8 upalne bolesti crijeva je protein koji je kod ljudi kodiran genom IBD8

Mapiranje

Veza IBD-a sa širokim regionima hromosoma 16 utvrđena je analizom više populacija. Gen NOD2/CARD15, smješten na poziciji 16q12, lokusu mutacija koje uzrokuju IBD1. Hampe et al. (2002) istraživali su mogućnost da NOD2 nije jedini IBD gen smješten na ovom hromosomu. U studiji povezanosti velike gustoće, primijećena je trostruka vršna konfiguracija krivulje povezanosti s vršnim lod rezultatima 2,7, 3,2 i 3,1 na proksimalnoj sekvenci 16p, proksimalnoj 16q i središnjoj 16q. Daljnja ispitivanja potvrdila su važnost NOD2 lokusa kod IBD-a i pružila dokaze da je lokus osjetljivosti na IBD na proksimalnim 16p. Lokus je ovdje označen IBD8.^[1] Među velikom grupom italijanskih porodica s KVČ, Annese et al. (2003) otkrili su da je 37 porodica s ulceroznim kolitisom, koje nisu imale poznate alele osjetljivosti gena CARD15, pokazalo povezanost s markerom D16S408 (lod skor veći od 2,5), koji je približno 12 cM udaljen od CARD15. Autori su sugerirali da u regiji IBD1 može postojati gen za podložnost ulceroznom kolitisu različit od CARD15.^[2] Imielinski et al. (2009) izveli su genomsko istraživanje asocijacije rano nastalog IBD-a na 3.426 pacijenata i 11.963 genetički podudarnih kontrola i pronašli značajnu povezanost (kombinovani p = 2,41 x 10⁻⁹ za IBD i 2,87 x 10⁻⁹ za CD) na rs8049439 na hromosdomu 16p11, u bloku neravnoteže veze koji sadrži više gena, uključujući IL27 (608273), SULT1A1 (171150) i SULT1A2 (601292). Utvrđeno je da je ekspresija IL27 u debelom crijevu značajno niža kod pacijenata sa CD-om s ranim početkom, nego kod kontrola (p<0,05); ekspresija SULT1A1 i SULT1A2 u debelom crijevu bila je značajno niža i kod CD-a s ranim početkom i kod UC (p<0,0001, odnosno p<0,05 i p<0,001 za oba gena).^[3]

Molekulska genetika

U studiji kontrole slučaja u kojoj je uključeno 155 porodičnih i 280 sporadičnih bolesnika s IBD-om, Paavola et al. (2001) nisu pronašli značajnu korelaciju između funkcionalne varijante položaja gena kandidata, mutacije receptora za interleukin-4 (IL4R; 147781) na hromosomu 16p i fenotipova IBD.^[4]

Rasprostranjenost

Taksonomska loza: Eukaryota > Metazoa > Chordata > Craniata > Vertebrata > Euteleostomi > Mammalia > Eutheria > Euarchontoglires > Primates > Haplorrhini – Catarrhini > Hominidae > Homo

Napomena: Za opći opis i raspravu o genetičkoj heterogenosti upalnih bolesti crijeva (IBD), uključujući Crohnovu bolest (CD) i ulcerozni kolitis (UC), pogledajtei IBD1 (OMIM:266600).

Reference

^ Hampe, J., Frenzel, H., Mirza, M. M., Croucher, P. J. P., Cuthbert, A., Mascheretti, S., Huse, K., Platzer, M., Bridger, S., Meyer, B., Nurnberg, P., Stokkers, P., Krawczak, M., Mathew, C. G., Curran, M., Schreiber, S. Evidence for a NOD2-independent susceptibility locus for inflammatory bowel disease on chromosome 16p. Proc. Nat. Acad. Sci. 99: 321-326, 2002. [PubMed]: 11752413
^ Annese, V., Latiano, A., Palmieri, O., Li, H.-H., Forabosco, P., Ferraris, A., Andriulli, A., Vecchi, M., Ardizzone, S., Cottone, M., Dallapiccola, B., Rappaport, E., Fortina, P., Devoto, M. Linkage of ulcerative colitis to the pericentromeric region of chromosome 16 in Italian inflammatory bowel disease families is independent of the presence of common CARD15 mutations. J. Med. Genet. 40: 837-841, 2003. [PubMed]: 14627676
^ Imielinski, M., Baldassano, R. N., Griffiths, A., Russell, R. K., Annese, V., Dubinsky, M., Kugathasan, S., Bradfield, J. P., Walters, T. D., Sleiman, P., Kim, C. E., Muise, A., and 39 others. Common variants at five new loci associated with early-onset inflammatory bowel disease. Nature Genet. 41: 1335-1340, 2009. PubMed: 19915574
^ Paavola, P., Helio, T., Kiuru, M., Halme, L., Turunen, U., Terwilliger, J., Karvonen, A.-L., Julkunen, R., Niemala, S., Nurmi, H., Farkkila, M., Kontula, K. Genetic analysis in Finnish families with inflammatory bowel disease supports linkage to chromosome 3p21. Europ. J. Hum. Genet. 9: 328-334, 2001. PubMed: 11378820

Vanjski linkovi

[1] Hampe, J., Frenzel, H., Mirza, M. M., Croucher, P. J. P., Cuthbert, A., Mascheretti, S., Huse, K., Platzer, M., Bridger, S., Meyer, B., Nurnberg, P., Stokkers, P., Krawczak, M., Mathew, C. G., Curran, M., Schreiber, S. Evidence for a NOD2-independent susceptibility locus for inflammatory bowel disease on chromosome 16p. Proc. Nat. Acad. Sci. 99: 321-326, 2002. [PubMed]: 11752413

[2] Annese, V., Latiano, A., Palmieri, O., Li, H.-H., Forabosco, P., Ferraris, A., Andriulli, A., Vecchi, M., Ardizzone, S., Cottone, M., Dallapiccola, B., Rappaport, E., Fortina, P., Devoto, M. Linkage of ulcerative colitis to the pericentromeric region of chromosome 16 in Italian inflammatory bowel disease families is independent of the presence of common CARD15 mutations. J. Med. Genet. 40: 837-841, 2003. [PubMed]: 14627676

[3] Imielinski, M., Baldassano, R. N., Griffiths, A., Russell, R. K., Annese, V., Dubinsky, M., Kugathasan, S., Bradfield, J. P., Walters, T. D., Sleiman, P., Kim, C. E., Muise, A., and 39 others. Common variants at five new loci associated with early-onset inflammatory bowel disease. Nature Genet. 41: 1335-1340, 2009. PubMed: 19915574

[4] Paavola, P., Helio, T., Kiuru, M., Halme, L., Turunen, U., Terwilliger, J., Karvonen, A.-L., Julkunen, R., Niemala, S., Nurmi, H., Farkkila, M., Kontula, K. Genetic analysis in Finnish families with inflammatory bowel disease supports linkage to chromosome 3p21. Europ. J. Hum. Genet. 9: 328-334, 2001. PubMed: 11378820

[1]

[2]

[3]

[4]