Protein 2 sa FERM i PDZ domenom je protein koji je kod ljudi kodiran genom FRMPD2.[5]

FRMPD2
Identifikatori
AliasiFRMPD2
Vanjski ID-jeviOMIM: 613323 MGI: 2685472 HomoloGene: 51854 GeneCards: FRMPD2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 10 (čovjek)
Hrom.Hromosom 10 (čovjek)[1]
Hromosom 10 (čovjek)
Genomska lokacija za FRMPD2
Genomska lokacija za FRMPD2
Bend10q11.22Početak48,153,088 bp[1]
Kraj48,274,696 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za FRMPD2
Genomska lokacija za FRMPD2
Bend14|14 BPočetak33,193,653 bp[2]
Kraj33,297,226 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
1-phosphatidylinositol binding
Ćelijska komponenta membrana
međućelijske veze
citoskelet
citoplazma
ćelijska membrana
basolateral plasma membrane
bicellular tight junction
Biološki proces bicellular tight junction assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001017929
NM_001018071
NM_001042512
NM_152428
NM_001318191

XM_017316244
XM_036158980
XM_036158982

RefSeq (bjelančevina)

NP_001018081
NP_001035977
NP_001305120

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 10: 48.15 – 48.27 MbChr 14: 33.19 – 33.3 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.309 aminokiselina, а molekulska težina 144.282 Da.[6]

1020304050
MQPLTKDAGMSLSSVTLASALQVRGEALSEEEIWSLLFLAAEQLLEDLRN
DSSDYVVCPWSALLSAAGSLSFQGRVSHIEAAPFKAPELLQGQSEDEQPD
ASQMHVYSLGMTLYWSAGFHVPPHQPLQLCEPLHSILLTMCEDQPHRRCT
LQSVLEACRVHEKEVSVYPAPAGLHIRRLVGLVLGTISEVEKRVVEESSS
VQQNRSYLLRKRLRGTSSESPAAQAPECLHPCRVSERSTETQSSPEPHWS
TLTHSHCSLLVNRALPGADPQDQQAGRRLSSGSVHSAADSSWPTTPSQRG
FLQRRSKFSRPEFILLAGEAPMTLHLPGSVVTKKGKSYLALRDLCVVLLN
GQHLEVKCDVESTVGAVFNAVTSFANLEELTYFGLAYMKSKEFFFLDSET
RLCKIAPEGWREQPQKTSMNTFTLFLRIKFFVSHYGLLQHSLTRHQFYLQ
LRKDILEERLYCNEEILLQLGVLALQAEFGNYPKEQVESKPYFHVEDYIP
ASLIERMTALRVQVEVSEMHRLSSALWGEDAELKFLRVTQQLPEYGVLVH
QVFSEKRRPEEEMALGICAKGVIVYEVKNNSRIAMLRFQWRETGKISTYQ
KKFTITSSVTGKKHTFVTDSAKTSKYLLDLCSAQHGFNAQMGSGQPSHVL
FDHDKFVQMANLSPAHQARSKPLIWIQRLSCSENELFVSRLQGAAGGLLS
TSMDNFNVDGSKEAGAEGIGRSPCTGREQLKSACVIQKPMTWDSLSGPPV
QSMHAGSKNNRRKSFIAEPGREIVRVTLKRDPHRGFGFVINEGEYSGQAD
PGIFISSIIPGGPAEKAKTIKPGGQILALNHISLEGFTFNMAVRMIQNSP
DNIELIISQSKGVGGNNPDEEKNSTANSGVSSTDILSFGYQGSLLSHTQD
QDRNTEELDMAGVQSLVPRLRHQLSFLPLKGAGSSCPPSPPEISAGEIYF
VELVKEDGTLGFSVTGGINTSVPYGGIYVKSIVPGGPAAKEGQILQGDRL
LQVDGVILCGLTHKQAVQCLTGPGQVARLVLERRVPRSTQQCPSANDSMG
DERTAVSLVTALPGRPSSCVSVTDGPKFEVKLKKNANGLGFSFVQMEKES
CSHLKSDLVRIKRLFPGQPAEENGAIAAGDIILAVNGRSTEGLIFQEVLH
LLRGAPQEVTLLLCRPPPGALPELEQEWQTPELSADKEFTRATCTDSCTS
PILDQEDSWRDSASPDAGEGLGLRPESSQKAIREAQWGQNRERPWASSLT
HSPESHPHLCKLHQERDESTLATSLEKDVRQNCYSVCDIMRLGRYSFSSP
LTRLSTDIF

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira periferni membranski protein i nalazi se u području 10q hromosoma 10 koje sadrži segmentnu duplikaciju. Ova kopija gena je cijele dužine i nalazi se u duplikacijskoj regiji. Dvije druge centromerno proksimalne kopije gena su djelimične i mogu predstavljati pseudogene. Ovaj gen u punoj dužini funkcionira u uspostavljanju i održavanju polarnosti ćelija. Protein se regrutira u ćelijske spojeve na E-kadherin-zavisan način i selektivno je lokaliziran na bazolateralnoj membrani u polariziranim epitelnim ćelijama. Alternativna prerada rezultira s više varijanti transkripta.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000170324 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000108841 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: FERM and PDZ domain containing 2". Pristupljeno 5. 9. 2017.
  6. ^ "UniProt, Q68DX3". Pristupljeno 2. 9. 2021.

Dopunska literatura

uredi