ERAP1

Aminopeptidazni regulator tipa 1 receptorskog faktora tumorske necroze, znan i kao endoplazmatskoretikulumska aminopeptidaza 1 (ARTS-1), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ARTS-1.

ERAP1
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2YD0, 3MDJ, 3QNF, 3RJO
Identifikatori
Aliasi	ERAP1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 606832 MGI: 1933403 HomoloGene: 140581 GeneCards: ERAP1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 5 (čovjek) Bend 5q15 Početak 96,760,810 bp Kraj 96,808,100 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 13 (miš) Bend 13|13 C1 Početak 74,787,687 bp Kraj 74,841,320 bp
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • interleukin-6 receptor binding • peptide binding • vezivanje iona cinka • vezivanje iona metala • interleukin-1, type II receptor binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • aminopeptidase activity • metalloexopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • endopeptidase activity • metalloaminopeptidase activity Ćelijska komponenta • citoplazma • integral component of membrane • citosol • endoplasmic reticulum membrane • membrana • extracellular region • Endoplazmatski retikulum • Egzosom • Vanćelijsko • endoplasmic reticulum lumen • ćelijska membrana Biološki proces • regulation of innate immune response • adaptive immune response • response to bacterium • immune system process • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • Proteoliza • positive regulation of angiogenesis • membrane protein ectodomain proteolysis • Angiogeneza • fat cell differentiation • peptide catabolic process • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I • regulation of blood pressure • GO:0072468 Transdukcija signala • cell-cell signaling Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	51752	80898
Ensembl	ENSG00000164307	ENSMUSG00000021583
UniProt	Q9NZ08	Q9EQH2
RefSeq (mRNK)	NM_001040458 NM_001198541 NM_016442 NM_001349244	NM_030711
RefSeq (bjelančevina)	NP_001035548 NP_001185470 NP_057526 NP_001336173	NP_109636
Lokacija (UCSC)	Chr 5: 96.76 – 96.81 Mb	Chr 13: 74.79 – 74.84 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Endoplazmatskoretikulumska aminopeptidaza 1 je aktivna u endoplazmatskom retikulumu, koji je uključen u obradu i transport proteina. Ovaj protein je aminopeptidaza, enzim koji cijepa peptide na N-terminalu na manje fragmente koji se nazivaju aminokiseline.

Nomenklatura

ARTS1 je takođe poznat kao:

• ER aminopeptidaza 1 (ERAP1), naziv gena koji je prihvatio Odbor za nomenklaturu Hugo
• ER aminopeptidaza povezana s obradom antigena (ERAAP) kod miševa
• Leucin-aminopeptidaza izvedena iz adipocita (ALAP)
• Puromicin neosjetljiva leucin-aminopeptidaza (PILS-AP)

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 941 aminokiselina, а molekulska težina 107.235 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MVFLPLKWSL		ATMSFLLSSL		LALLTVSTPS		WCQSTEASPK		RSDGTPFPWN
KIRLPEYVIP		VHYDLLIHAN		LTTLTFWGTT		KVEITASQPT		STIILHSHHL
QISRATLRKG		AGERLSEEPL		QVLEHPRQEQ		IALLAPEPLL		VGLPYTVVIH
YAGNLSETFH		GFYKSTYRTK		EGELRILAST		QFEPTAARMA		FPCFDEPAFK
ASFSIKIRRE		PRHLAISNMP		LVKSVTVAEG		LIEDHFDVTV		KMSTYLVAFI
ISDFESVSKI		TKSGVKVSVY		AVPDKINQAD		YALDAAVTLL		EFYEDYFSIP
YPLPKQDLAA		IPDFQSGAME		NWGLTTYRES		ALLFDAEKSS		ASSKLGITMT
VAHELAHQWF		GNLVTMEWWN		DLWLNEGFAK		FMEFVSVSVT		HPELKVGDYF
FGKCFDAMEV		DALNSSHPVS		TPVENPAQIR		EMFDDVSYDK		GACILNMLRE
YLSADAFKSG		IVQYLQKHSY		KNTKNEDLWD		SMASICPTDG		VKGMDGFCSR
SQHSSSSSHW		HQEGVDVKTM		MNTWTLQKGF		PLITITVRGR		NVHMKQEHYM
KGSDGAPDTG		YLWHVPLTFI		TSKSDMVHRF		LLKTKTDVLI		LPEEVEWIKF
NVGMNGYYIV		HYEDDGWDSL		TGLLKGTHTA		VSSNDRASLI		NNAFQLVSIG
KLSIEKALDL		SLYLKHETEI		MPVFQGLNEL		IPMYKLMEKR		DMNEVETQFK
AFLIRLLRDL		IDKQTWTDEG		SVSERMLRSQ		LLLLACVHNY		QPCVQRAEGY
FRKWKESNGN		LSLPVDVTLA		VFAVGAQSTE		GWDFLYSKYQ		FSLSSTEKSQ
IEFALCRTQN		KEKLQWLLDE		SFKGDKIKTQ		EFPQILTLIG		RNPVGYPLAW
QFLRKNWNKL		VQKFELGSSS		IAHMVMGTTN		QFSTRTRLEE		VKGFFSSLKE
NGSQLRCVQQ		TIETIEENIG		WMDKNFDKIR		VWLQSEKLER		M

Funkcija

ERAP1 ima dvije glavne funkcije u imunskom sistemu:

• Prvo, ERAP1 cijepa nekoliko proteina koji se nazivaju citokinskim receptorima na površini ćelija. Cijepanje ovih receptora smanjuje njihovu sposobnost da prenose hemijske signale u ćeliju, što utiče na proces upale.
• Drugo, ERAP1 skračuje peptide unutar endoplazmatskog retikuluma, tako da se mogu učitati u glavni kompleks histokompatibilnosti (MHC) klase I. Ovi peptidi su vezani za MHC klasu I u endoplazmatskom retikulumu i eksportirani na ćelijsku površinu, gdje se prezentiraju u imunskom sistemu. Ako imunski sistem prepozna peptide kao strane (kao što su virusni ili bakterijski peptidi), reagira aktiviranjem zaražene ćelije na samouništenje.

ARTS-1 je član M1 cinkove porodice metaloproteinaza koji djeluje kao aminopeptidaza za razgradnju oligopeptida, cijepanjem počevši od N-terminala. Jedna od funkcija aminopeptidaza je razgradnja potencijalno toksičnih peptida u citosolu.

ARTS-1 je transmembranski protein koji je lokaliziran na endoplazmatski retikulum. Bio je uključen u sljedeće funkcije:

• Izbacivanje različitih receptora citokina i receptora mamaca
• Skraćivanje antigenih peptida prije vezivanja za MHC klasa I, što utiče na prezentaciju antigena u citotoksičnim T-limfocitima
• Stimulacija fagocitoza nakon oslobađanja od strane makrofaga

Klinički značaj

Aminopeptidaze imaju ulogu u metabolizmu nekoliko peptida koji mogu biti uključeni u krvni pritisak i patopatogenezu esencijalne hipertenzije. Mutacije u ARTS-1 povezane su s povećanim rizikom od ankilozantnog spondilitisa, ali samo u HLA-B27 pozitivnih pacijenata.

Protein kodiran ovim genom je aminopeptidaza uključena u podrezivanje prekursora za vezivanje HLA klase I, tako da se mogu prezentirati na molekulama MHC klase I. Kodirani protein djeluje kao monomer ili kao heterodimer ERAP2. Ovaj protein također može biti uključen u regulaciju krvnog pritiska, inaktivacijom angiotenzina II. Za ovaj gen su pronađene tri varijante transkripta koje kodiraju dvije različite izoforme.

Dopunska literatura

• Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2002). "Construction of Expression-ready cDNA Clones for KIAA Genes: Manual Curation of 330 KIAA cDNA Clones". DNA Research. 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923. doi:10.1093/dnares/9.3.99. PMID 12168954.
• Tsujimoto M, Hattori A (2005). "The oxytocinase subfamily of M1 aminopeptidases". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics. 1751 (1): 9–18. doi:10.1016/j.bbapap.2004.09.011. PMID 16054015.
• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5′-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
• Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998). "Prediction of the Coding Sequences of Unidentified Human Genes. IX. The Complete Sequences of 100 New cDNA Clones from Brain Which Can Code for Large Proteins in vitro". DNA Research. 5 (1): 31–9. doi:10.1093/dnares/5.1.31. PMID 9628581.
• Hattori A, Matsumoto H, Mizutani S, Tsujimoto M (1999). "Molecular cloning of adipocyte-derived leucine aminopeptidase highly related to placental leucine aminopeptidase/oxytocinase". Journal of Biochemistry. 125 (5): 931–8. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022371. PMID 10220586.
• Hattori A, Kitatani K, Matsumoto H, Miyazawa S, Rogi T, Tsuruoka N, Mizutani S, Natori Y, Tsujimoto M (2000). "Characterization of recombinant human adipocyte-derived leucine aminopeptidase expressed in Chinese hamster ovary cells". Journal of Biochemistry. 128 (5): 755–62. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022812. PMID 11056387.
• Hattori A, Matsumoto K, Mizutani S, Tsujimoto M (2001). "Genomic organization of the human adipocyte-derived leucine aminopeptidase gene and its relationship to the placental leucine aminopeptidase/oxytocinase gene". Journal of Biochemistry. 130 (2): 235–41. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002977. PMID 11481040.
• Yamamoto N, Nakayama J, Yamakawa-Kobayashi K, Hamaguchi H, Miyazaki R, Arinami T (2002). "Identification of 33 polymorphisms in the adipocyte-derived leucine aminopeptidase (ALAP) gene and possible association with hypertension". Human Mutation. 19 (3): 251–7. doi:10.1002/humu.10047. PMID 11857741. S2CID 23459237.
• Cui X, Hawari F, Alsaaty S, Lawrence M, Combs CA, Geng W, Rouhani FN, Miskinis D, Levine SJ (2002). "Identification of ARTS-1 as a novel TNFR1-binding protein that promotes TNFR1 ectodomain shedding". Journal of Clinical Investigation. 110 (4): 515–26. doi:10.1172/JCI13847. PMC 150410. PMID 12189246.
• Serwold T, Gonzalez F, Kim J, Jacob R, Shastri N (2002). "ERAAP customizes peptides for MHC class I molecules in the endoplasmic reticulum". Nature. 419 (6906): 480–3. doi:10.1038/nature01074. PMID 12368856. S2CID 4379291.
• Saric T, Chang SC, Hattori A, York IA, Markant S, Rock KL, Tsujimoto M, Goldberg AL (2002). "An IFN-γ–induced aminopeptidase in the ER, ERAP1, trims precursors to MHC class I–presented peptides". Nature Immunology. 3 (12): 1169–76. doi:10.1038/ni859. PMID 12436109. S2CID 21648629.
• York IA, Chang SC, Saric T, Keys JA, Favreau JM, Goldberg AL, Rock KL (2002). "The ER aminopeptidase ERAP1 enhances or limits antigen presentation by trimming epitopes to 8–9 residues". Nature Immunology. 3 (12): 1177–84. doi:10.1038/ni860. PMID 12436110. S2CID 21337369.
• Cui X, Rouhani FN, Hawari F, Levine SJ (2003). "An Aminopeptidase, ARTS-1, Is Required for Interleukin-6 Receptor Shedding". Journal of Biological Chemistry. 278 (31): 28677–85. doi:10.1074/jbc.M300456200. PMID 12748171.
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q, Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (2003). "The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment". Genome Research. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
• Cui X, Rouhani FN, Hawari F, Levine SJ (2003). "Shedding of the Type II IL-1 Decoy Receptor Requires a Multifunctional Aminopeptidase, Aminopeptidase Regulator of TNF Receptor Type 1 Shedding". The Journal of Immunology. 171 (12): 6814–9. doi:10.4049/jimmunol.171.12.6814. PMID 14662887.
• Shibata D, Ando H, Iwase A, Nagasaka T, Hattori A, Tsujimoto M, Mizutani S (2004). "Distribution of Adipocyte-derived Leucine Aminopeptidase (A-LAP)/ER-aminopeptidase (ERAP)-1 in Human Uterine Endometrium". Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 52 (9): 1169–75. doi:10.1369/jhc.3A6216.2004. PMID 15314084.

Vanjski linkovi

• Lokacija ljudskog genoma ERAP1 i stranica sa detaljima o genu ERAP1 u UCSC Genome Browseru.