Ets varijanta trankripcijskog faktora 2

(Preusmjereno sa ER71)

Ets varijanta transkripcijskog faktora 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ETV2.[5] To je faktor transkripcije i također ima ulogu u razvoju vaskularnih endotelnih ćelija.[6]

Ets varijanta trankripcijskog faktora 2
Identifikatori
AliasiETV2
Vanjski ID-jeviOMIM: 609358 MGI: 99253 HomoloGene: 7308 GeneCards: ETV2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za Ets varijanta trankripcijskog faktora 2
Genomska lokacija za Ets varijanta trankripcijskog faktora 2
Bend19q13.12Početak35,641,745 bp[1]
Kraj35,644,871 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za Ets varijanta trankripcijskog faktora 2
Genomska lokacija za Ets varijanta trankripcijskog faktora 2
Bend7|7 B1Početak30,333,041 bp[2]
Kraj30,335,277 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta jedro
Biološki proces Notch signaling pathway
Ćelijska diferencijacija
positive regulation of endothelial cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
blood vessel morphogenesis
Placentacija
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
mesoderm formation
in utero embryonic development
Wnt-signalni put
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of mesoderm development
GO:1901313 positive regulation of gene expression
BMP signaling pathway involved in mesodermal cell fate specification
erythrocyte differentiation
blastocyst development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Hematopoeza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001300974
NM_001304549
NM_014209

NM_007959

RefSeq (bjelančevina)

NP_001287903
NP_001291478
NP_055024

NP_031985

Lokacija (UCSC)Chr 19: 35.64 – 35.64 MbChr 7: 30.33 – 30.34 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi
Simboli
1020304050
MDLWNWDEASPQEVPPGNKLAGLEGAKLGFCFPDLALQGDTPTATAETCW
KGTSSSLASFPQLDWGSALLHPEVPWGAEPDSQALPWSGDWTDMACTAWD
SWSGASQTLGPAPLGPGPIPAAGSEGAAGQNCVPVAGEATSWSRAQAAGS
NTSWDCSVGPDGDTYWGSGLGGEPRTDCTISWGGPAGPDCTTSWNPGLHA
GGTTSLKRYQSSALTVCSEPSPQSDRASLARCPKTNHRGPIQLWQFLLEL
LHDGARSSCIRWTGNSREFQLCDPKEVARLWGERKRKPGMNYEKLSRGLR
YYYRRDIVRKSGGRKYTYRFGGRVPSLAYPDCAGGGRGAETQ

Kloniranje i ekspresija

uredi

Brown and McKnight (1992) klonirali su miša Etv2, kojeg su označili kao Er71. Izvedeni protein sadrži 335 aminokiselina i može predstavljati djelimičnu sekvencu. Northern blot analizom nekoliko mišjih tkiva otkriven je transkript od 1,7 kb u testisu odrasle osobe i transkript od 1,2 kb u 8,5 kb mišjim embrionima. Nijedna ekspresija nije otkrivena ni u jednom drugom ispitivanom tkivu.

De Haro and Janknecht (2005) utvrdili su je miš Etv2 ima dva alternativna mjesta za početak translacije, što rezultira proteinima od 336 ili 358 aminokiselina. Northern blot analizom otkriven je glavni transkript od 1,7 kb i manji od 1,5 kb u testisu miša. RT-PCR analiza otkrila je najsnažniju ekspresiju Etv2 u Sertolijevim ćelijama. Analizom baze podataka, identificirali su cDNK za ljudski ETV2. Izvedeni protein sadrži 370 aminokiselina. Također su identificirali ljudsku cDNK ETV2, izoliranu iz medule odraslih, kojoj nedostaje egzon 2 i kodira krnji protein sa samo posljednjih 249 aminokiselina pune dužine ETV2.

Funkcija gena

uredi

Brown i McKnight (1992) otkrili su da su mišji Er71, poput Gabpe i Er81 (ETV1), prepoznali sekvencu pentanukleotidne DNK 5-prime-CGGAA/T-3-prime. Analizom pomaka elektroforetske pokretljivosti, De Haro i Janknecht (2005) otkrili su da su se dvije izoforme mišjeg Etv2 vezale za promotor MMP1, s jednakim afinitetom i pokazale uporedivu aktivaciju reporter-gena koji je pokretao promotor MMP1.[7][8]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105672 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000006311 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Ets variant 2".
  6. ^ Oh SY, Kim JY, Park C (decembar 2015). "The ETS Factor, ETV2: a Master Regulator for Vascular Endothelial Cell Development". Molecules and Cells. 38 (12): 1029–36. doi:10.14348/molcells.2015.0331. PMC 4696993. PMID 26694034.
  7. ^ Brown, T. A., McKnight, S. L. Specificities of protein-protein and protein-DNA interaction of GABP-alpha and two newly defined ets-related proteins. Genes Dev. 6: 2502-2512, 1992. [PubMed]: 1340465
  8. ^ De Haro, L., Janknecht, R. Cloning of the murine ER71 gene (Etsrp71) and initial characterization of its promoter. Genomics 85: 493-502, 2005. [PubMed]: 15780752