Ets varijanta trankripcijskog faktora 2
Ets varijanta transkripcijskog faktora 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ETV2.[5] To je faktor transkripcije i također ima ulogu u razvoju vaskularnih endotelnih ćelija.[6]
Aminokiselinska sekvenca
uredi- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDLWNWDEAS | PQEVPPGNKL | AGLEGAKLGF | CFPDLALQGD | TPTATAETCW | ||||
KGTSSSLASF | PQLDWGSALL | HPEVPWGAEP | DSQALPWSGD | WTDMACTAWD | ||||
SWSGASQTLG | PAPLGPGPIP | AAGSEGAAGQ | NCVPVAGEAT | SWSRAQAAGS | ||||
NTSWDCSVGP | DGDTYWGSGL | GGEPRTDCTI | SWGGPAGPDC | TTSWNPGLHA | ||||
GGTTSLKRYQ | SSALTVCSEP | SPQSDRASLA | RCPKTNHRGP | IQLWQFLLEL | ||||
LHDGARSSCI | RWTGNSREFQ | LCDPKEVARL | WGERKRKPGM | NYEKLSRGLR | ||||
YYYRRDIVRK | SGGRKYTYRF | GGRVPSLAYP | DCAGGGRGAE | TQ |
Kloniranje i ekspresija
urediBrown and McKnight (1992) klonirali su miša Etv2, kojeg su označili kao Er71. Izvedeni protein sadrži 335 aminokiselina i može predstavljati djelimičnu sekvencu. Northern blot analizom nekoliko mišjih tkiva otkriven je transkript od 1,7 kb u testisu odrasle osobe i transkript od 1,2 kb u 8,5 kb mišjim embrionima. Nijedna ekspresija nije otkrivena ni u jednom drugom ispitivanom tkivu.
De Haro and Janknecht (2005) utvrdili su je miš Etv2 ima dva alternativna mjesta za početak translacije, što rezultira proteinima od 336 ili 358 aminokiselina. Northern blot analizom otkriven je glavni transkript od 1,7 kb i manji od 1,5 kb u testisu miša. RT-PCR analiza otkrila je najsnažniju ekspresiju Etv2 u Sertolijevim ćelijama. Analizom baze podataka, identificirali su cDNK za ljudski ETV2. Izvedeni protein sadrži 370 aminokiselina. Također su identificirali ljudsku cDNK ETV2, izoliranu iz medule odraslih, kojoj nedostaje egzon 2 i kodira krnji protein sa samo posljednjih 249 aminokiselina pune dužine ETV2.
Funkcija gena
urediBrown i McKnight (1992) otkrili su da su mišji Er71, poput Gabpe i Er81 (ETV1), prepoznali sekvencu pentanukleotidne DNK 5-prime-CGGAA/T-3-prime. Analizom pomaka elektroforetske pokretljivosti, De Haro i Janknecht (2005) otkrili su da su se dvije izoforme mišjeg Etv2 vezale za promotor MMP1, s jednakim afinitetom i pokazale uporedivu aktivaciju reporter-gena koji je pokretao promotor MMP1.[7][8]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105672 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000006311 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Ets variant 2".
- ^ Oh SY, Kim JY, Park C (decembar 2015). "The ETS Factor, ETV2: a Master Regulator for Vascular Endothelial Cell Development". Molecules and Cells. 38 (12): 1029–36. doi:10.14348/molcells.2015.0331. PMC 4696993. PMID 26694034.
- ^ Brown, T. A., McKnight, S. L. Specificities of protein-protein and protein-DNA interaction of GABP-alpha and two newly defined ets-related proteins. Genes Dev. 6: 2502-2512, 1992. [PubMed]: 1340465
- ^ De Haro, L., Janknecht, R. Cloning of the murine ER71 gene (Etsrp71) and initial characterization of its promoter. Genomics 85: 493-502, 2005. [PubMed]: 15780752