BTBD14B

Jedarni akumbens-vezani protein 1 ili nukleusni akumbensni protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NACC1.

BTBD14B
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 3GA1, 4U2N
Identifikatori
Aliasi	NACC1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 610672 MGI: 1914080 HomoloGene: 12042 GeneCards: NACC1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 19 (čovjek) Bend 19p13.13 Početak 13,116,862 bp Kraj 13,141,147 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 8 (miš) Bend 8 C3|8 41.02 cM Početak 85,397,108 bp Kraj 85,414,531 bp
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	112939	66830
Ensembl	ENSG00000160877	ENSMUSG00000001910
UniProt	Q96RE7	Q7TSZ8
RefSeq (mRNK)	NM_052876	NM_025788
RefSeq (bjelančevina)	NP_443108	NP_080064
Lokacija (UCSC)	Chr 19: 13.12 – 13.14 Mb	Chr 8: 85.4 – 85.41 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Članovi BTB / POZ porodice transkripcijskih regulatora, uključujući BTBD14B, sadrže konzervirani motiv u N-terminalnom području kritičnom za interakcije protein-protein i sklop kompleksa visoke molekulske mase.

Kloniranje i ekspresija

Pregledom biblioteke cDNK cijelog mozga pacova, s transkriptom koji je pokazao povećanu ekspresiju u jedrima pacova, nakon primjene kokaina, nakon čega slijedi RT-PCR, Cha et al. (1997) klonirani pacovski Btbd14b, kojeg su nazvali nucleus accumbens-1 (Nac1). Izvedeni protein od 514 aminokiselina sadrži domen POZ u prvih 120 aminokiselina.

Korutla et al. (2002) identificirali su prerađenu varijantu pacova Btbd14b, kojoj je nedostajalo 27 aminokiselina iz srednje regije Btbd14b. I izvedene 514-aminokiselinske (lNac1) i 487-aminokiselinske (sNac1) izoforme sadrže N-terminalni POZ domen. RT-PCR analiza otkrila je iRNK obje izoforme u svim ispitivanim regijama mozga odraslih pacova, kao i u slezeni, skeletnim mišićima, srcu, bubrezima, timusu, sa mNNA lNac1 2,5 puta obilnijim od iRNK sNac1. Western blot analiza otkrila je i lNac1 i sNac1 u više regija zrelog CNS-a zrelih pacova, uključujući moždana jezgra, kaudatni putamen, mali mozak, olfaktornu kvržicu i prefrontalni korteks, s izoformom lNac1, koji je bio obilniji. Ekspresija lNac1 otkrivena je u srcu odraslom pacova, jetri, bubregu, slezeni, testisu i skeletnim mišićima, dok je sNac1 otkriven samo u jetri. Imunohistokemijska svojstva lNac1 i sNac1 pacova eksprimirana u ćelijama H293T obuhvataju obje izoforme u jezgru u tačkastoj distribuciji karakterističnoj za transkripcijske faktore BTB/POZ.

Funkcija gena

Koristeći Nac1 mutante pacova izražene u ćelijama H293T, Korutla et al. (2002) utvrdili su da i lNac1 i sNac1 potiskuju transkripciju reporter gena, pri čemu lNac1 pokazuje veću transkripcijsku represivnu aktivnost od sNac1. Korutla et al. (2005) otkrili su da je transkripcijska represija posredovana Nac1 u kulturama neuronskih ćelija i u primarnim hipokampusnim neuronima djelimično poništena inhibitorima histonskih deacetilaza. Međutim, nije primijećena promjena na glijinim ćelijama. Dvohibridna analiza sisara, in vitro koimunoprecipitacija i GST testovi padajućeg postupka pokazali su da su i Nac1 izoforme u interakciji s HDAC3 i HDAC4 u NNA i PC12 ćelijama sličnim neuronima, ali ne i u neuronskim ćelijama H293T. Koristeći Nac1 izoforme i mutantne konstrukcije, pokazali su da se vezanje Nac1 za HDAC3 (605166) i HDAC4 dogodilo i preko POZ i izvan POZ domena. Korutla et al. (2005) sugeriraju da Nac1 regrutuje histonske deacetilaze i djeluje kao transkripcijski korektor u neuronskim ćelijama.

Koristeći serijsku analizu ekspresije gena, Nakayama et al. (2006) otkrili su da je NAC1 značajno prekomjerno eksprimiran u seroznim karcinomima jajnika i nekoliko drugih tipova karcinoma. Imunohistokemijska analiza seroznih karcinoma jajnika lokalizirala je NAC1 u diskretnim jedarnim tijelima, što su autori nazvali NAC1 tijelima, a nivo ekspresije NAC1 korelirao s recidivom tumora. Intenzivna imunoreaktivnost NAC1 u primarnim tumorima predvidjela je rani recidiv u karcinomima jajnika. I imunoprecipitacija i dvostruko imunofluorescentno bojenje pokazali su da se NAC1 homodimerizuje preko BTB/POZ domena. Inducirana ekspresija domena NAC1 BTB/POZ poremetila je tijela NAC1, spriječila stvaranje tumora i promovirala apoptozu tumorskih ćelija u utvrđenim tumorima u modelu ksenotransplanta na mišu. Prekomjerna ekspresija NAC1 pune dužine povećala je tumorogenost epitelnih ćelija i fibroblasta na površini jajnika kod atipskih nu/nu miševa.

Nakayama et al. (2007) pokazali su da je NAC1 smanjio ekspresiju supresora tumora GADD45GIP1 u nekoliko ćelijskih linija ljudskog karcinoma. U tumorskim ćelijamama koje eksprimiraju NAC1, ekspresija dominantno negativnog NAC1 mutanta, koji sadrži samo BTB/POZ domen, inhibirala je rast ćelija, a taj je efekt djelimično poništen nokdaunom GADD45GIP1.

Molekulska genetika

U sedam nepovezanih pacijenata s neurorazvojnim poremećajem s epilepsijom, kataraktom, poteškoćama u hranjenju i odgođenom mijelinizacijom mozga, Schoch et al. (2017) identificirali su ponovnu de novo heterozigotnu misens mutaciju u genu NACC1 (R298W). Jedan od pacijenata imao je mozaičnu mutaciju. Mutacija je pronađena sekvenciranjem cijelog egzoma, a potvrđena Sangerovim sekvenciranjem. Funkcionalne studije varijanti i studije ćelija pacijenta nisu potvrđene.

Aminokiselinska sekvenca

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAQTLQMEIP		NFGNSILECL		NEQRLQGLYC		DVSVVVKGHA		FKAHRAVLAA
SSSYFRDLFN		NSRSAVVELP		AAVQPQSFQQ		ILSFCYTGRL		SMNVGDQFLL
MYTAGFLQIQ		EIMEKGTEFF		LKVSSPSCDS		QGLHAEEAPS		SEPQSPVAQT
SGWPACSTPL		PLVSRVKTEQ		QESDSVQCMP		VAKRLWDSGQ		KEAGGGGNGS
RKMAKFSTPD		LAANRPHQPP		PPQQAPVVAA		AQPAVAAGAG		QPAGGVAAAG
GVVSGPSTSE		RTSPGTSSAY		TSDSPGSYHN		EEDEEEDGGE		EGMDEQYRQI
CNMYTMYSMM		NVGQTAEKVE		ALPEQVAPES		RNRIRVRQDL		ASLPAELINQ
IGNRCHPKLY		DEGDPSEKLE		LVTGTNVYIT		RAQLMNCHVS		AGTRHKVLLR
RLLASFFDRN		TLANSCGTGI		RSSTNDPRRK		PLDSRVLHAV		KYYCQNFAPN
FKESEMNAIA		ADMCTNARRV		VRKSWMPKVK		VLKAEDDAYT		TFISETGKIE
PDMMGVEHGF		ETASHEGEAG		PSAEALQ

Vanjski linkovi

• Lokacija ljudskog genoma NACC1 i stranica sa detaljima o genu NACC1 u UCSC Genome Browseru.
• PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Nucleus accumbens-associated protein 1 (BTBD14B)

Dopunska literatura

• Nakayama K, Nakayama N, Wang TL, Shih IeM (2007). "NAC-1 controls cell growth and survival by repressing transcription of Gadd45GIP1, a candidate tumor suppressor". Cancer Res. 67 (17): 8058–64. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-1357. PMID 17804717.
• Davidson B, Berner A, Trope' CG, et al. (2007). "Expression and clinical role of the bric-a-brac tramtrack broad complex/poxvirus and zinc protein NAC-1 in ovarian carcinoma effusions". Hum. Pathol. 38 (7): 1030–6. doi:10.1016/j.humpath.2006.12.009. PMID 17391728.
• Nakayama K, Nakayama N, Davidson B, et al. (2007). "A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (49): 18739–44. doi:10.1073/pnas.0604083103. PMC 1693732. PMID 17130457.
• Korutla L, Wang PJ, Mackler SA (2005). "The POZ/BTB protein NAC1 interacts with two different histone deacetylases in neuronal-like cultures". J. Neurochem. 94 (3): 786–93. doi:10.1111/j.1471-4159.2005.03206.x. PMID 16033423. S2CID 42787411.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073/pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Korutla L, Wang PJ, Lewis DM, et al. (2002). "Differences in expression, actions and cocaine regulation of two isoforms for the brain transcriptional regulator NAC1". Neuroscience. 110 (3): 421–9. doi:10.1016/S0306-4522(01)00518-8. PMID 11906783. S2CID 13388723.