ERAP1

(Preusmjereno sa ARTS-1)

Aminopeptidazni regulator tipa 1 receptorskog faktora tumorske necroze, znan i kao endoplazmatskoretikulumska aminopeptidaza 1 (ARTS-1), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ARTS-1.[5]

ERAP1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2YD0, 3MDJ, 3QNF, 3RJO

Identifikatori
AliasiERAP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 606832 MGI: 1933403 HomoloGene: 140581 GeneCards: ERAP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za ERAP1
Genomska lokacija za ERAP1
Bend5q15Početak96,760,810 bp[1]
Kraj96,808,100 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za ERAP1
Genomska lokacija za ERAP1
Bend13|13 C1Početak74,787,687 bp[2]
Kraj74,841,320 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija interleukin-6 receptor binding
peptide binding
zinc ion binding
metal ion binding
interleukin-1, type II receptor binding
GO:0070122 peptidase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
aminopeptidase activity
metalloexopeptidase activity
hydrolase activity
metallopeptidase activity
endopeptidase activity
metalloaminopeptidase activity
Ćelijska komponenta citoplazma
integral component of membrane
citosol
endoplasmic reticulum membrane
membrana
extracellular region
Endoplazmatski retikulum
Egzosom
Vanćelijsko
endoplasmic reticulum lumen
Ćelijska membrana
Biološki proces regulation of innate immune response
adaptive immune response
response to bacterium
immune system process
antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
Proteoliza
positive regulation of angiogenesis
membrane protein ectodomain proteolysis
Angiogeneza
fat cell differentiation
peptide catabolic process
antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I
regulation of blood pressure
GO:0072468 Transdukcija signala
cell-cell signaling
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001040458
NM_001198541
NM_016442
NM_001349244

NM_030711

RefSeq (bjelančevina)

NP_001035548
NP_001185470
NP_057526
NP_001336173

NP_109636

Lokacija (UCSC)Chr 5: 96.76 – 96.81 MbChr 13: 74.79 – 74.84 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Endoplazmatskoretikulumska aminopeptidaza 1 je aktivna u endoplazmatskom retikulumu, koji je uključen u obradu i transport proteina. Ovaj protein je aminopeptidaza, enzim koji cijepa peptide na N-terminalu na manje fragmente koji se nazivaju aminokiseline.

Nomenklatura uredi

ARTS1 je takođe poznat kao:

  • ER aminopeptidaza 1 (ERAP1), naziv gena koji je prihvatio Odbor za nomenklaturu Hugo[6]
  • ER aminopeptidaza povezana s obradom antigena (ERAAP) kod miševa [7]
  • Leucin-aminopeptidaza izvedena iz adipocita (ALAP)
  • Puromicin neosjetljiva leucin-aminopeptidaza (PILS-AP)

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 941 aminokiselina, а molekulska težina 107.235 Da.[8]

1020304050
MVFLPLKWSLATMSFLLSSLLALLTVSTPSWCQSTEASPKRSDGTPFPWN
KIRLPEYVIPVHYDLLIHANLTTLTFWGTTKVEITASQPTSTIILHSHHL
QISRATLRKGAGERLSEEPLQVLEHPRQEQIALLAPEPLLVGLPYTVVIH
YAGNLSETFHGFYKSTYRTKEGELRILASTQFEPTAARMAFPCFDEPAFK
ASFSIKIRREPRHLAISNMPLVKSVTVAEGLIEDHFDVTVKMSTYLVAFI
ISDFESVSKITKSGVKVSVYAVPDKINQADYALDAAVTLLEFYEDYFSIP
YPLPKQDLAAIPDFQSGAMENWGLTTYRESALLFDAEKSSASSKLGITMT
VAHELAHQWFGNLVTMEWWNDLWLNEGFAKFMEFVSVSVTHPELKVGDYF
FGKCFDAMEVDALNSSHPVSTPVENPAQIREMFDDVSYDKGACILNMLRE
YLSADAFKSGIVQYLQKHSYKNTKNEDLWDSMASICPTDGVKGMDGFCSR
SQHSSSSSHWHQEGVDVKTMMNTWTLQKGFPLITITVRGRNVHMKQEHYM
KGSDGAPDTGYLWHVPLTFITSKSDMVHRFLLKTKTDVLILPEEVEWIKF
NVGMNGYYIVHYEDDGWDSLTGLLKGTHTAVSSNDRASLINNAFQLVSIG
KLSIEKALDLSLYLKHETEIMPVFQGLNELIPMYKLMEKRDMNEVETQFK
AFLIRLLRDLIDKQTWTDEGSVSERMLRSQLLLLACVHNYQPCVQRAEGY
FRKWKESNGNLSLPVDVTLAVFAVGAQSTEGWDFLYSKYQFSLSSTEKSQ
IEFALCRTQNKEKLQWLLDESFKGDKIKTQEFPQILTLIGRNPVGYPLAW
QFLRKNWNKLVQKFELGSSSIAHMVMGTTNQFSTRTRLEEVKGFFSSLKE
NGSQLRCVQQTIETIEENIGWMDKNFDKIRVWLQSEKLERM

Funkcija uredi

ERAP1 ima dvije glavne funkcije u imunskom sistemu:

  • Prvo, ERAP1 cijepa nekoliko proteina koji se nazivaju citokinskim receptorima na površini ćelija. Cijepanje ovih receptora smanjuje njihovu sposobnost da prenose hemijske signale u ćeliju, što utiče na proces upale.
  • Drugo, ERAP1 skračuje peptide unutar endoplazmatskog retikuluma, tako da se mogu učitati u glavni kompleks histokompatibilnosti (MHC) klase I. Ovi peptidi su vezani za MHC klasu I u endoplazmatskom retikulumu i eksportirani na ćelijsku površinu, gdje se prezentiraju u imunskom sistemu. Ako imunski sistem prepozna peptide kao strane (kao što su virusni ili bakterijski peptidi), reagira aktiviranjem zaražene ćelije na samouništenje.[9]

ARTS-1 je član M1 cinkove porodice metaloproteinaza koji djeluje kao aminopeptidaza za razgradnju oligopeptida, cijepanjem počevši od N-terminala. Jedna od funkcija aminopeptidaza je razgradnja potencijalno toksičnih peptida u citosolu.[5]

ARTS-1 je transmembranski protein koji je lokaliziran na endoplazmatski retikulum. Bio je uključen u sljedeće funkcije:

Klinički značaj uredi

Aminopeptidaze imaju ulogu u metabolizmu nekoliko peptida koji mogu biti uključeni u krvni pritisak i patopatogenezu esencijalne hipertenzije.[5] Mutacije u ARTS-1 povezane su s povećanim rizikom od ankilozantnog spondilitisa, ali samo u HLA-B27 pozitivnih pacijenata.[11]

Protein kodiran ovim genom je aminopeptidaza uključena u podrezivanje prekursora za vezivanje HLA klase I, tako da se mogu prezentirati na molekulama MHC klase I. Kodirani protein djeluje kao monomer ili kao heterodimer ERAP2. Ovaj protein također može biti uključen u regulaciju krvnog pritiska, inaktivacijom angiotenzina II. Za ovaj gen su pronađene tri varijante transkripta koje kodiraju dvije različite izoforme.[5]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164307 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021583 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d EntrezGene 51752
  6. ^ "HGNC". HGNC. Arhivirano s originala, 11. 4. 2015. Pristupljeno 27. 3. 2014.
  7. ^ Serwold T, Gonzalez F, Kim J, Jacob R, Shastri N (2002). "ERAAP customizes peptides for MHC class I molecules in the endoplasmic reticulum". Nature. 419 (6906): 480–3. doi:10.1038/nature01074. PMID 12368856. S2CID 4379291.
  8. ^ "UniProt, Q9NZ08" (jezik: engleski). Pristupljeno 14. 10. 2021.
  9. ^ "ERAP1 - endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 - Genetics Home Reference".
  10. ^ Goto Y, Ogawa K, Hattori A, Tsujimoto M (juni 2011). "Secretion of endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 is involved in the activation of macrophages induced by lipopolysaccharide and interferon-gamma". The Journal of Biological Chemistry. 286 (24): 21906–14. doi:10.1074/jbc.M111.239111. PMC 3122245. PMID 21531727.
  11. ^ Brionez TF, Reveille JD (2008). "The contribution of genes outside the major histocompatibility complex to susceptibility to ankylosing spondylitis". Current Opinion in Rheumatology. 20 (4): 384–91. doi:10.1097/BOR.0b013e32830460fe. PMID 18525349. S2CID 205485848.

Dopunska literatura uredi

Vanjski linkovi uredi