ARGLU1

ARGLU1
Identifikatori
Aliasi	ARGLU1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 614046 MGI: 2442985 HomoloGene: 9960 GeneCards: ARGLU1
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 13 (čovjek)
Kraj	106,568,137 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 8 (miš)
Kraj	8,740,521 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • cadherin binding;
Ćelijska komponenta	• mitohondrija; • jedro; • nukleoplazma;
Biološki proces	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	55082
	234023
	ENSG00000134884
	ENSMUSG00000040459
	Q9NWB6
	Q3UL36
	NM_018011
	NM_176849
	NP_060481
	NP_789819
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Argininom i glutamatom bogati protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ARGLU1, lociranom na poziciji13q33.3.^[5]

Proteinski proizvod ovog gena predložen je kao MED1-interakcijski protein potreban za estrogen-ovisnu transkripciju gena i rast ćelija raka dojke.^[6]

Gen ARGLU1 eksprimira najmanje tri različite izoforme prerade RNK – potpuno prerađena izoforma koja kodira protein, izoforma koja sadrži zadržani intron, u jedru i izoforma koja sadrži alternativni egzon koji cilja transkript za nonsens propadanje. Nadalje, ARGLU1 sadrži dugu, evolucijski visoko konzerviranu sekvencu poznatu kao ultrakonzervirani element (UCE) koja se nalazi unutar zadržnog introna i preklapa alternativni egzon.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 273 aminokiseline, a molekulska težina 33.216 Da.^[8]

10	20	30	40	50
MGRSRSRSSS	RSKHTKSSKH	NKKRSRSRSR	SRDKERVRKR	SKSRESKRNR
RRESRSRSRS	TNTAVSRRER	DRERASSPPD	RIDIFGRTVS	KRSSLDEKQK
REEEEKKAEF	ERQRKIRQQE	IEEKLIEEET	ARRVEELVAK	RVEEELEKRK
DEIEREVLRR	VEEAKRIMEK	QLLEELERQR	QAELAAQKAR	EEEERAKREE
LERILEENNR	KIAEAQAKLA	EEQLRIVEEQ	RKIHEERMKL	EQERQRQQKE
EQKIILGKGK	SRPKLSFSLK	TQD

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Zhang et al. (2011) klonirano ljudsko ARGLU1. Izvedeni protein od 273 aminokiseline ima pozitivno nabijeni N-terminalni domen bogat argininom i negativno nabijen C-terminaln domen bogat glutamatom. Također ima nekoliko signala za jedarnu lokalizaciju. Imunohistohemijska analiza otkrila je da je ARGLU1 pretežno lokaliziran u jedru ćelija raka dojke MCF-7, gdje se kolokalizirao s podjedinicom kompleksa medijator-1 (MED1). Analiza baze podataka otkrila je ortologe ARGLU1 u rodu Drosophila i miševima, ali ne i u kvascu.^[9]

Funkcija gena

Kompleks medijator je veliki proteinski kompleks, koji prenosi signale od transkripcijskih aktivatora do RNK- polimeraze II i općeg mehanizma za transkripciju. Kompleksi posrednika koji uključuju MED1 komuniciraju s estrogenim receptorima (ER ili ESR1) i posreduju u funkcijama ovisnim o estrogenu. Koristeći masenu spektrometriju, Zhang et al (2011) otkrili su da je ARGLU1 bio u interakciji s MED1, ali ne i s drugim podjedinicama medijatora. Analize imunoprecipitacije i povlačenja proteina potvrdile su njihovu direktnu interakciju. Analiza mutacije otkrila je da je za interakciju potrebna C-terminalna regija MED1 i N-terminalna regija ARGLU1. Ektopiijska ekspresija samog ARGLU1 povećala je aktivnost reportera ovisnu o estrogenu u ćelijama MCF-7, a koekspresija MED1 s ARGLU1 dodatno je povećala aktivnost reportera ovisnu o estrogenu. RNK kratke ukosnice usmjerena protiv ARGLU1 oslabila je estrogeno ovisnu indukciju ER ciljnih gena. Analiza imunoprecipitacije hromatina pokazala je da su i ARGLU1 i MED1 regrutirani kao kompleks za promotore ER ciljnih gena. Nokdaun studije pokazale su da je ARGLU1 potreban i za ovisnost o sidrištu i o nezavisnom rastu ćelija MCF-7. Pretpostavili su da ARGLU1 može imati regulatornu ulogu preko interakcije s kompleksima posrednika MED1.^[9]

Magomedova et al. (2019) identificirali su evolucijski konzervirani gen ARGLU1 tokom pregleda za modulatore signalizacije glukokortikoida u CNS -u. Inhibicija ARGLU1 u neuronskim čelijama miša rezultirala je velikim promjenama u ekspresiji ili preradom drugih gena uključenih u neurogenezu. Nokaut kod zebrice uzrokovao je neurorazvoj i srčane greške, a homozigotnost za nokaut Arglu1 cijelog tijela bila je letalna za mišje embrione. Autori su zaključili da je ARGLU1 potreban za moduliranje bazne transkripcije i oreradu tokom embrionskog razvoja u neuronskim ćelijama.^[10]

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134884 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040459 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: ARGLU1 arginine and glutamate rich 1".
^ Zhang D, Jiang P, Xu Q, Zhang X (maj 2011). "Arginine and glutamate-rich 1 (ARGLU1) interacts with mediator subunit 1 (MED1) and is required for estrogen receptor-mediated gene transcription and breast cancer cell growth". J. Biol. Chem. 286 (20): 17746–54. doi:10.1074/jbc.M110.206029. PMC 3093850. PMID 21454576.
^ Pirnie SP, Osman A, Zhu Y, Carmichael GG (april 2017). "An Ultraconserved Element (UCE) controls homeostatic splicing of ARGLU1 mRNA". Nucleic Acids Res. 45 (6): 3473–3486. doi:10.1093/nar/gkw1140. PMC 5389617. PMID 27899669.
^ "UniProt, Q9NWB6". Pristupljeno 11. 9. 2017.
^ ^a ^b Zhang, D., Jiang, P., Xu, Q., Zhang, X. Arginine and glutamate-rich 1 (ARGLU1) interacts with Mediator subunit 1 (MED1) and is required for estrogen receptor-mediated gene transcription and breast cancer cell growth. J. Biol. Chem. 286: 17746-17754, 2011. PubMed: 21454576
^ Magomedova, L., Tiefenbach, J., Zilberman, E., Le Billan, F., Voisin, V., Saikali, M., Boivin, V., Robitaille, M., Gueroussov, S., Irimia, M., Ray, D., Patel, R., and 10 others. ARGLU1 is a transcriptional coactivator and splicing regulator important for stress hormone signaling and development. Nucleic Acids Res. 47: 2856-2870, 2019. PubMed: 30698747

Vanjski linkovi

Lokacija ljudskog genoma ARGLU1 i stranica sa detaljima o genu ARGLU1 u UCSC Genome Browseru.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134884 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040459 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: ARGLU1 arginine and glutamate rich 1".

[pmid21454576-6] Zhang D, Jiang P, Xu Q, Zhang X (maj 2011). "Arginine and glutamate-rich 1 (ARGLU1) interacts with mediator subunit 1 (MED1) and is required for estrogen receptor-mediated gene transcription and breast cancer cell growth". J. Biol. Chem. 286 (20): 17746–54. doi:10.1074/jbc.M110.206029. PMC 3093850. PMID 21454576.

[pmid27899669-7] Pirnie SP, Osman A, Zhu Y, Carmichael GG (april 2017). "An Ultraconserved Element (UCE) controls homeostatic splicing of ARGLU1 mRNA". Nucleic Acids Res. 45 (6): 3473–3486. doi:10.1093/nar/gkw1140. PMC 5389617. PMID 27899669.

[UniProt-8] "UniProt, Q9NWB6". Pristupljeno 11. 9. 2017.

[<Zhang-9] Zhang, D., Jiang, P., Xu, Q., Zhang, X. Arginine and glutamate-rich 1 (ARGLU1) interacts with Mediator subunit 1 (MED1) and is required for estrogen receptor-mediated gene transcription and breast cancer cell growth. J. Biol. Chem. 286: 17746-17754, 2011. PubMed: 21454576

[10] Magomedova, L., Tiefenbach, J., Zilberman, E., Le Billan, F., Voisin, V., Saikali, M., Boivin, V., Robitaille, M., Gueroussov, S., Irimia, M., Ray, D., Patel, R., and 10 others. ARGLU1 is a transcriptional coactivator and splicing regulator important for stress hormone signaling and development. Nucleic Acids Res. 47: 2856-2870, 2019. PubMed: 30698747

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]