Beta-centraktin jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ACTR1B sa hromosoma 2.[5][6][7]

ACTR1B
Identifikatori
AliasiACTR1B
Vanjski ID-jeviOMIM: 605144 MGI: 1917446 HomoloGene: 101541 GeneCards: ACTR1B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za ACTR1B
Genomska lokacija za ACTR1B
Bend2q11.2Početak97,655,939 bp[1]
Kraj97,664,044 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za ACTR1B
Genomska lokacija za ACTR1B
Bend1|1 BPočetak36,737,195 bp[2]
Kraj36,753,503 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
ATP binding
cytoskeletal protein-membrane anchor activity
Ćelijska komponenta citoplazma
microtubule cytoskeleton
citosol
centrosom
Egzosom
citoskelet
membrana
dynactin complex
centar organizacije mikrotubula
extracellular region
secretory granule lumen
ficolin-1-rich granule lumen
cell cortex region
Biološki proces antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
neutrophil degranulation
establishment of mitotic spindle orientation
nuclear migration along microtubule
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005735

NM_146107

RefSeq (bjelančevina)

NP_005726

NP_666219

Lokacija (UCSC)Chr 2: 97.66 – 97.66 MbChr 1: 36.74 – 36.75 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 376 aminokiselina, a molekulska težina 42.293 Da.[8]

1020304050
MESYDIIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHMRVMAG
ALEGDLFIGPKAEEHRGLLTIRYPMEHGVVRDWNDMERIWQYVYSKDQLQ
TFSEEHPVLLTEAPLNPSKNREKAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYAT
GRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRVDIAGRDVSRYLRLLLRK
EGVDFHTSAEFEVVRTIKERACYLSINPQKDEALETEKVQYTLPDGSTLD
VGPARFRAPELLFQPDLVGDESEGLHEVVAFAIHKSDMDLRRTLFANIVL
SGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDIKIKISAPQERLYSTWIGGSILASL
DTFKKMWVSKKEYEEDGSRAIHRKTF

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira podjedinicu dinaktina od 42,3 kD, makromolekulski kompleks koji se sastoji od 10 podjedinica veličine od 22 do 150 kD. Dinaktin se vezuje za mikrotubule i citoplazmatski dinein. Uključen je u različite ćelijske funkcije, uključujući transport na relaciji ERGolgijev aparat, centripetalnim pokretom lizosoma i endosoma, formiranja vretena, kretanja hromosoma, iedarnog pozicioniranja i aksonogeneze. Ova podjedinica, poput ACTR1A, je protein vezan za aktin. Ova dva proteina su jednake dužine i dijele 90% aminokiselinskog identiteta. Prisutni su u kompleksu dinaktina, u konstantnom omjeru od približno 1:15.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115073 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037351 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Clark SW, Staub O, Clark IB, Holzbaur EL, Paschal BM, Vallee RB, Meyer DI (maj 1995). "Beta-centractin: characterization and distribution of a new member of the centractin family of actin-related proteins". Mol Biol Cell. 5 (12): 1301–10. doi:10.1091/mbc.5.12.1301. PMC 301159. PMID 7696711.
  6. ^ Elsea SH, Clark IB, Juyal RC, Meyer DJ, Meyer DI, Patel PI (Jun 1999). "Assignment of beta-centractin (CTRN2) to human chromosome 2 bands q11.1→q11.2 with somatic cell hybrids and in situ hybridization". Cytogenet Cell Genet. 84 (1–2): 48–9. doi:10.1159/000015211. PMID 10343100. S2CID 83665096.
  7. ^ a b "Entrez Gene: ACTR1B ARP1 actin-related protein 1 homolog B, centractin beta (yeast)".
  8. ^ "UniProt, P42025" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 11. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi

ACTR1B detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.