Ubikvitinska specifična peptidaza 38 jest protein/enzim koji je kod ljudi kodiran genom USP38 sa hromosoma 4.[5]

USP38
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4RXX

Identifikatori
AliasiUSP38
Vanjski ID-jeviOMIM: 618322 MGI: 1922091 HomoloGene: 12367 GeneCards: USP38
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 4 (čovjek)
Hrom.Hromosom 4 (čovjek)[1]
Hromosom 4 (čovjek)
Genomska lokacija za USP38
Genomska lokacija za USP38
Bend4q31.21Početak143,184,917 bp[1]
Kraj143,223,874 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za USP38
Genomska lokacija za USP38
Bend8 C2|8 38.68 cMPočetak81,707,362 bp[2]
Kraj81,741,557 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001290325
NM_001290326
NM_032557

NM_027554

RefSeq (bjelančevina)

NP_001277254
NP_001277255
NP_115946

NP_081830

Lokacija (UCSC)Chr 4: 143.18 – 143.22 MbChr 8: 81.71 – 81.74 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.042 aminokiseline, а molekulska težina 116.546 Da[6]

1020304050
MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLIL
EGQDPFQRQVGHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKD
VAILDYIHNGLKLIMSCPSVLDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDL
LTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQCVSTQERELREYVSQVTKVSN
LLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASLVQHIPLQMIT
VLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHL
IVPHVVNLVHSFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILE
AIKDFPKPSEEKIKLILNQSAWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINL
GNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNGCNSLMKKLQHLFAFLAHTQR
EAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEEKILKVQASHK
PSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASV
PGPSEEPVVYNPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKI
LVNKDVPQKPGGETTPSVTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEK
TMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLVLELPVKRITSF
SSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPYLLSSVVVHSG
ISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVF
EQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQH
STNGLSGNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARAL
QAASASCSFRPNGFDDNDPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000170185 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038250 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Ubiquitin specific peptidase 38". Pristupljeno 22. 8. 2016.
  6. ^ "UniProt, Q8NB14" (jezik: engleski). Pristupljeno 27. 10. 2021.

Vanjski linkovi

uredi