TNFSF12-TNFSF13

Superporodični faktor tumorske nekroze, ligandni članovi 12 i 13, znan i kao TNFSF12-TNFSF13, je ljudski gen.[5]

TNFSF12-TNFSF13
Dostupne strukture
PDBPretraga Human UniProta: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4HT1

Identifikatori
AliasiTNFSF12-TNFSF13
Vanjski ID-jeviMGI: 3845075 HomoloGene: 123930 GeneCards: TNFSF12-TNFSF13
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 17 (čovjek)
Hrom.Hromosom 17 (čovjek)[1]
Hromosom 17 (čovjek)
Genomska lokacija za TNFSF12-TNFSF13
Genomska lokacija za TNFSF12-TNFSF13
Bend17p13.1Početak7,549,099 bp[1]
Kraj7,561,601 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za TNFSF12-TNFSF13
Genomska lokacija za TNFSF12-TNFSF13
Bend11|11 B3Početak69,573,403 bp[2]
Kraj69,586,924 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija cytokine activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
tumor necrosis factor receptor binding
signaling receptor binding
Ćelijska komponenta integral component of membrane
membrana
ćelijska membrana
integral component of plasma membrane
extracellular region
perinuklearno područje citoplazme
Vanćelijsko
Biološki proces Ćelijska diferencijacija
positive regulation of endothelial cell proliferation
GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process
extrinsic apoptotic signaling pathway
tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
positive regulation of angiogenesis
multicellular organism development
Angiogeneza
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor
apoptotic signaling pathway
positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway
endothelial cell migration
GO:0072468 Transdukcija signala
GO:0097285 apoptoza
regulation of signaling receptor activity
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_172089

NM_001034097
NM_001034098
NM_001159503

RefSeq (bjelančevina)

NP_003800

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 17: 7.55 – 7.56 MbChr 11: 69.57 – 69.59 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen pripada superporodici faktora tumorskih nekroza (TNFSF). Kodira hibridni protein sastavljen od citoplazmatskog i transmembranskog domena člana porodice 12, koji je spojen sa C-terminalnim domenom člana porodice 13. Hibridni protein je membranski protein i predstavlja receptor-vezujući domen člana porodice 13 na ćelijskoj površini. Podstiče cikluse ćelijskih linija T-limfoma i B-limfoma. Transkript iRNK translatiran je i eksprimiran u primarnim T-ćelijama i monocitima.[5]

Dužina polipeptidnog lanca je 249 aminokiselina, a molekulska težina 27.216.[6]

Aminokiselinska sekvenca

Simboli
1020304050
MAARRSQRRRGRRGEPGTALLVPLALGLGLALACLGLLLAVVSLGSRASL
SAQEPAQEELVAEEDQDPSELNPQTEESQDPAPFLNRLVRPRRSAPKGRK
TRARRAIAAHYEVHPRPGQDGAQAGVDGTVSGWEEARINSSSPLRYNRQI
GEFIVTRAGLYYLYCQVHFDEGKAVYLKLDLLVDGVLALRCLEEFSATAA
SSLGPQLRLCQVSGLLALRPGSSLRIRTLPWAHLKAAPFLTYFGLFQVH

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000248871 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000018752 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: TNFSF12-TNFSF13 tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 12-member 13".
  6. ^ "UniProt, O43508". Pristupljeno 12. 6. 2021.

Dopunska literatura uredi