Wikipedia

TMEM205

Transmembranski protein 205 (TMEM205) je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM205.

TMEM205
Identifikatori
AliasiTMEM205
Vanjski ID-jeviOMIM: 613771 MGI: 3045495 HomoloGene: 43895 GeneCards: TMEM205
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za TMEM205
Genomska lokacija za TMEM205
Bend19p13.2Početak11,342,776 bp[1]
Kraj11,346,518 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za TMEM205
Genomska lokacija za TMEM205
Bend9|9 A3Početak21,832,304 bp[2]
Kraj21,838,852 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

374882

235043

Ensembl

ENSG00000105518

ENSMUSG00000040883

UniProt

Q6UW68

Q91XE8

RefSeq (mRNK)
NM_001145416
NM_033408
NM_198536
NM_001321112
NM_001321113

NM_001321114

NM_001253867
NM_001253868
NM_001253869
NM_001253870
NM_178577

RefSeq (bjelančevina)
NP_001138888
NP_001308041
NP_001308042
NP_001308043
NP_212133

NP_940938

NP_001240796
NP_001240797
NP_001240798
NP_001240799
NP_848692

Lokacija (UCSC)Chr 19: 11.34 – 11.35 MbChr 9: 21.83 – 21.84 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Gen

uredi

TMEM205 nalazi se na minus lancu hromosoma 19 od baznog para 11,453.452 do 11,456.981. U neposrednoj blizini TMEM205, malo uzvodno, nalazi se CCDC159, a RAB3D je malo niže od genomske sekvence.

Protein

uredi

Ljudski homolog TMEM205 dug je 189 aminokiselina i ima molekulsku težinu od 21,2 kDa. Sadrži četiri hidrofobna spiralna domena za koje se predviđa da su transmembranski domeni.

Aminokiselinska sekvenca
Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

1020304050
MEEGGNLGGLIKMVHLLVLSGAWGMQMWVTFVSGFLLFRSLPRHTFGLVQ
SKLFPFYFHISMGCAFINLCILASQHAWAQLTFWEASQLYLLFLSLTLAT
VNARWLEPRTTAAMWALQTVEKERGLGGEVPGSHQGPDPYRQLREKDPKY
SALRQNFFRYHGLSSLCNLGCVLSNGLCLAGLALEIRSL

Ekspresija

uredi

Pokazalo se da se TMEM205 eksprimira u većim količinama u tkivima koja imaju sekretornu funkciju. Ta tkiva uključuju tkiva štitnjače, nadbubrežnih žlijezda, gušterače i mliječnih tkiva.[5] Također se pokazalo da protein ispoljava pojačanu ekspresiju u tkivu tumora, koje je postalo otporno na hemoterapijske lijekove na bazi platine.

Funkcija

uredi

Smatra se da je TMEM205 višeprolazni transmembranski protein. Pokazalo se da se u ljudskim tkivima nalazi na plazemamembrani i translocira se u jedarnu ovojnicu kad ćelije postanu otporne na cisplatin.[[5] Sadrži četiri domena za koje je TMHMM analizom predviđeno da će biti transmembranski domeni.

Homologija

uredi

TMEM205 nema poznate paraloge u ljudskom genomu. Korištenje UCSC pretraživača genoma BLA[6] prema sekvenci ljudskog proteina, utvrđeno je da je rod primata Galago najbliži čovjeku a koji sadrži paralog gena TMEM205 u svom genomu. TMEM205, međutim, ima širok raspon ortolognih sekvenci

Rod – Vrsta Uobičajeno ime Divergencija sa ljudima (milioni godina)[7] Pristup proteinu u bazi NCBI Sličnost sekvenci[8] Dužina proteina
Homo sapiens[9] Ljudi 0 AAH91472.1 100% 189
Pan troglodytes[10] Obični čimpanza 6,4 XP_003316117.1 100% 189
Pongo abelii[11] Orangutan 15,8 NP 001124814.1 99% 189
Gorilla gorilla[12] Gorila 8,8 XP_004060075.1 99% 189
Callithrix jacchus[13] Obični marmozet 43,9 XP_002761800.1 96% 189
Mus musculus[14] Miš 94,1 BAA92792764.1 88% 189
Sarcophilus harrisii[15] Tasmanijski đavo 162,6 XP_003760487.1 77% 193
Crotalus adamanteus[16] Zmija zvečarka 296 AFJ51753.1 85% 188
Xenopus[17] Kandžasta žaba 371 NP_001037942.1 68% 189

Klinički značaj

uredi

Pokazalo se da je TMEM205 uključen u rezistenciju na cisplatin. Cisplatin je hemoterapijski lijek, koji se obično koristi za liječenje solidnih malignih bolesti, kao što su karcinom, sarkom i limfom. Osim što je uključen u rezistenciju na cisplatin, sve je više dokaza da je protein također uključen u bolesti tiroiditis i prostatitis

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105518 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040883 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Shen DW, Ma J, Okabe M, Zhang G, Xia D, Gottesman MM (novembar 2010). "Elevated expression of TMEM205, a hypothetical membrane protein, is associated with cisplatin resistance". Journal of Cellular Physiology. 225 (3): 822–8. doi:10.1002/jcp.22287. PMC 2971691. PMID 20589834.
  6. ^ Kent WJ (april 2002). "BLAT--the BLAST-like alignment tool". Genome Research. 12 (4): 656–64. doi:10.1101/gr.229202. PMC 187518. PMID 11932250.
  7. ^ "Time Tree".
  8. ^ "NCBI BLAST".
  9. ^ "NCBI Protein: AAH91472.1".
  10. ^ "NCBI Protein: XP_003316117.1".
  11. ^ "NCBI Protein: NP_001124814.1".
  12. ^ "NCBI Protein: XP_004060075.1".
  13. ^ "NCBI Protein: XP_002761800.1".
  14. ^ "NCBI Protein: BAA92792764.1".
  15. ^ "NCBI Nucleotide: XP_003760487.1".
  16. ^ "NCBI Nucleotide: AFJ51753.1".
  17. ^ "NCBI Nucleotide: NP_001037942.1".
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=TMEM205&oldid=3321846"