TGIF2LY

Y-vezani transformirajući faktor rasta-beta-inducirani faktor 2 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TGIFLY sa hromosoma Y. [[citogenetika|Citogenetička lokacija je: Yp11.2, a genomske koordinate (GRCh38): Y:3,579,066–3,580,040 (prema NCBI, OMIM: 400025)

Yp11.2/Xq21.3 je homologni blok specifičan za ljude koji čini najveću zajedničku regiju među spolnim hromosomima, koji se proteže na oko 3,5 Mb. U ovom segmentu mapirane su dvije transkribovane sekvence: protokadherinski geni PCDHX (300246) i PCDHY (400022) i X-vezani poli(A)-vezujući protein PABPC5 gen (300407), čiji je Y-homolog izgubljen tokom ljudske evolucije . Blanco-Arias et al. (2002) izvijestili su o genomskoj strukturi, ekspresiji i evolucijskoj konzervaciji treće (X-Y homologne) transkribirane sekvence mapirane na ovoj regiji i označili je TGIFLX (300411)/TGIFLY za X/Y sličan TGIF-u. Geni sadrže homeodomene koji se odnose na porodicu gena superklase TALE (ekstenzija petlje od tri aminokiseline).

U jednoj studiji iz 2011., polazi se od konstatacije da TG-interakcioni faktori (TGIFs) pripadaju porodici proteina homeodomena TALE, uključujući i ljudske TGIF1, TGIF2 i TGIFLX/Y. I TGIF1 i TGIF2 djeluju kao faktori transkripcije koji potiskuju signalizaciju TGF-β. Ljudski TGIFLX i njegov ortolog, Tex1 kod miša, su X-vezani geni koji se eksprimiraju samo u testisima odraslih. TGIF2 je nastao duplikacijom iz TGIF1, dok je TGIFLX nastao retrotranspozicijom na hromosom X. Ovi geni nisu okarakterisani ni kod jednog neeuterijskog sisara. Stoga su proučavali porodicu TGIF u tamarskog valabija (torbarski sisar), kako bi istražili njihovu ulogu u reprodukciji i kako i kada su ovi geni mogli evoluirati svoje funkcije i hromosomske lokacije.

Dobijeni rezultati pokazuju da su i TGIF1 i TGIF2 bili prisutni u tamarskom genomu na autosomima, ali TGIFLX je bio odsutan. Tamarski TGIF1 dijeli sličan obrazac ekspresije tokom ebembriogeneze, seksualne diferencijacije i u tkivima odraslih kao i TGIF1 kod euterijskih sisara, što sugerira da je funkcionalno konzerviran. Torbarski TGIF2 bio je sveprisutno eksprimiran tokom ranog razvoja, kao kod ljudi i miša, ali kod odraslih, eksprimiran je samo u gonadama i slezeni, više kao obrazac ekspresije ljudskog TGIFLX-a i mišjeg Tex1. Tammar TGIF2 mRNA je specifično otkrivena u okruglim i izduženim spermatidama. U zrelim spermatozoidima nije otkrivena iRNK. TGIF2 protein bio je specifično lociran u citoplazmi spermatida, te u zaostalom tijelu i središnjem dijelu repa zrelih spermatozoida. Ovi podaci sugeriraju da torbarski TGIF2 može sudjelovati u spermiogenezi, kao što TGIFLX djeluje kod Eutheria. TGIF2 je prvi put otkriven u jajniku sa iRNK proizvedenom u granulastim i tekinim ćelijama, što sugerira da može također imati ulogu u folikulogenezi.

Autori izvode zaključak da ograničena i vrlo slična ekspresija torbarskog TGIF2 sa X-vezanim paralozima kod euterija sugerira da je evolucija TGIF1, TGIF2 i TGIFLX kod njih bila praćena promjenom od sveprisutne prema tkivno-specifičnoj ekspresiji. Distribucija i lokalizacija TGIF2 u proučavanim gonadama odraslih sugerira da je postojala ultra-konzervirana funkcija za porodicu TGIF u plodnosti i da je TGIF2 već funkcionirao u spermatogenezi i potencijalno folikulogenezi mnogo prije retrotranspozicije u hromosom X euterijskih sisara. Ovi rezultati također pružaju dodatne dokaze da je euterijski X-hromosom aktivno regrutovao gene povezane sa spolom i razmnožavanjem tokom evolucije sisara.^[1]

Kloniranje i ekspresija

RT-PCR analizom, Blanco-Arias et al. (2002) otkrili su da su i X– i Y-vezani geni slični TGIF-u specifično eksprimirani u testisima odraslih. Kloniranjem i sekvenciranjem homologa TGIFLX kod hominoida i majmuna Starog svijeta, pronašli su dokaze za otvoreni okvir čitanja u osam proučavanih vrsta. Delecija jednog baznog para u ljudskom TGIFLY (u poređenju sa TGIFLX) stvorila je drugačiji okvir čitanja, gdje su nedostajali ostaci C-terminala koje dijele TGIFLX i drugi TGIF proteini. U cjelini, nalazi sugeriraju da u testisima TGIFLX/Y ima transkripcijsku ulogu.^[2]

Struktura gena

Blanco-Arias et al. (2002) otkrili su da gen TGIFLX/Y ima iRNK od 2,666 bp koju kodiraju dva egzona razdvojena intronom od 96 bp.

Mapiranje

Amplifikacijama iz X-vezanih YAC-a, Blanco-Arias et al. (2002) mapirali su gen TGIFLY na hromosomskoj regiji Yp11.2.

Reference

^ Yanqiu Hu 1, Hongshi Yu, Geoff Shaw, Marilyn B Renfree, Andrew J Pask (2011): Differential roles of TGIF family genes in mammalian reproduction. BMC Dev Biol, 11:58: pmid: 21958027; pmcid: pmc3204290; doi: 10.1186/1471-213x-11-58.
^ Blanco-Arias, P., Sargent, C. A., Affara, N. A. The human-specific Yp11.2/Xq21.3 homology block encodes a potentially functional testis-specific TGIF-like retroposon. Mammalian Genome 13: 463-468, 2002. PubMed: 12226713

[1] Yanqiu Hu 1, Hongshi Yu, Geoff Shaw, Marilyn B Renfree, Andrew J Pask (2011): Differential roles of TGIF family genes in mammalian reproduction. BMC Dev Biol, 11:58: pmid: 21958027; pmcid: pmc3204290; doi: 10.1186/1471-213x-11-58.

[2] Blanco-Arias, P., Sargent, C. A., Affara, N. A. The human-specific Yp11.2/Xq21.3 homology block encodes a potentially functional testis-specific TGIF-like retroposon. Mammalian Genome 13: 463-468, 2002. PubMed: 12226713

[1]

[2]