Alfa-tektorin je protein koji je kod ljudi kodiran genom TECTA.[5][6][7]

TECTA
Identifikatori
AliasiTECTA
Vanjski ID-jeviOMIM: 602574 MGI: 109575 HomoloGene: 3955 GeneCards: TECTA
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za TECTA
Genomska lokacija za TECTA
Bend11q23.3Početak121,101,243 bp[1]
Kraj121,191,490 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za TECTA
Genomska lokacija za TECTA
Bend9 A5.1|9 23.63 cMPočetak42,240,915 bp[2]
Kraj42,311,225 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija extracellular matrix structural constituent
Ćelijska komponenta anchored component of membrane
Egzosom
membrana
extracellular region
ćelijska membrana
GO:0005578 Vanćelijski matriks
collagen-containing extracellular matrix
Biološki proces cell-matrix adhesion
sluh
C-terminal protein lipidation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005422

NM_009347
NM_001324548
NM_001378602

RefSeq (bjelančevina)

NP_005413

NP_001311477
NP_033373
NP_001365531

Lokacija (UCSC)Chr 11: 121.1 – 121.19 MbChr 9: 42.24 – 42.31 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 2.155 aminokiselina, а molekulska težina 239.527 Da.[8]

1020304050
MNYSSFLRIWVSFIFALVQHQAQPRELMYPFWQNDTKTPKVDDGSSSEIK
LAIPVFFFGVPYRTVYVNNNGVVSFNVLVSQFTPESFPLTDGRAFVAPFW
ADVHNGIRGEIYYRETMEPAILKRATKDIRKYFKDMATFSATWVFIVTWE
EVTFYGGSSTTPVNTFQAVLVSDGSYTFTLFNYYEINWTTGTASGGDPLT
GLGGVMAQAGFNGGNLTNFFSLPGSRTPEIVNIQETTNVNVPGRWAFKVD
GKEIDPANGCTSRGQFLRRGEVFWDDLNCTVKCRCLDFNNEIYCQEASCS
PYEVCEPKGKFFYCSAVETSTCVVFGEPHYHTFDGFLFHFQGSCAYLLAR
QCLQTSSLPFFSVEAKNEHRRGSAVSWVKELSVEVNGYKILIPKGSYGRV
KVNDLVTSLPVTLDLGTVKIYQSGISTAVETDFGLLVTFDGQHYASISVP
GSYINSTCGLCGNYNKNPLDDFLRPDGRPAMSVLDLGESWRVYHADWKCD
SGCVDNCTQCDAATEALYFGSDYCGFLNKTDGPLWECGTVVDPTAFVHSC
VYDLCSVRDNGTLLCQAIQAYALVCQALGIPIGDWRTQTGCVSTVQCPSF
SHYSVCTSSCPDTCSDLTASRNCATPCTEGCECNQGFVLSTSQCVPLHKC
GCDFDGHYYTMGEFFWATANCTVQCLCEEGGDVYCFNKTCGSGEVCAVED
GYQGCFPKRETVCLLSQNQVLHTFDGASYAFPSEFSYTLLKTCPERPEYL
EIDINKKKPDAGPAWLRGLRILVADQEVKIGGIGASEVKLNGQEVELPFF
HPSGKLEIYRNKNSTTVESKGVVTVQYSDIGLLYIRLSTTYFNCTGGLCG
FYNANASDEFCLPNGKCTDNLAVFLESWTTFEEICNGECGDLLKACNNDS
ELLKFYRSRSRCGIINDPSNSSFLECHGVVNVTAYYRTCLFRLCQSGGNE
SELCDSVARYASACKNADVEVGPWRTYDFCPLECPENSHFEECITCTETC
ETLTLGPICVDSCSEGCQCDEGYALLGSQCVTRSECGCNFEGHQLATNET
FWVDLDCQIFCYCSGTDNRVHCETIPCKDDEYCMEEGGLYYCQARTDASC
IVSGYGHYLTFDGFPFDFQTSCPLILCTTGSRPSSDSFPKFVVTAKNEDR
DPSLALWVKQVDVTVFGYSIVIHRAYKHTVLVNSERLYLPLKLGQGKINI
FSFGFHVVVETDFGLKVVYDWKTFLSITVPRSMQNSTYGLCGRYNGNPDD
DLEMPMGLLASSVNEFGQSWVKRDTFCQVGCGDRCPSCAKVEGFSKVQQL
CSLIPNQNAAFSKCHSKVNPTFFYKNCLFDSCIDGGAVQTACSWLQNYAS
TCQTQGITVTGWRNYTSCTVTCPPNSHYESCVSVCQPRCAAIRLKSDCSH
YCVEGCHCDAGYVLNGKSCILPHSCGCYSDGKYYEPKQLFWNSDCTRRCR
CFRRNVIQCDPRQCKSDEECALRNGVRGCFSTKTSYCLAAGGGVFRTFDG
AFLRFPANCAFVLSTICQKLPDISFQLIINFDKWSAPNLTIISPVYFYIN
EEQILINDRNTVKVNGTQVNVPFITGLATKIYSSEGFLVIDTSPDIQIYY
NGFNVIKISISERLQNKVCGLCGNFNGDLTDDYVTLRGKPVVSSVVLAQS
WKTNGMQKRPLAPSCNELQFSQYAAMCDNVHIQKMQGDGYCLKLTDMKGF
FQPCYGLLDPLPFYESCYLDGCYSHKKFQLCGSLAAYGEACRSFGILSTE
WIEKENCSGVVEDPCVGADCPNRTCELGNGRELCGCIEPPPYGNNSHDII
DAEVTCKAAQMEVSISKCKLFQLGFEREGVRINDRQCTGIEGEDFISFQI
NNTKGNCGNIVQSNGTHIMYKNTLWIESANNTGNIITRDRTINVEFSCAY
ELDIKISLDSVVKPMLSVINLTVPTQEGSFITKMALYKNASYKHPYRQGE
VVLTTRDVLYVGVFVVGADATHLILTLNKCYATPTRDSNDKLRYFIIEGG
CQNLKDNTIGIEENAVSLTCRFHVTVFKFIGDYDEVHLHCAVSLCDSEKY
SCKITCPHNSRIATDYTKEPKEQIISVGPIRRKRLDWCEDNGGCEQICTS
RVDGPLCSCVTGTLQEDGKSCRASNSSMELQVWTLLLIMIQISLWHFVYK
SGTTS

Funkcija

uredi

Tektorska membrana je apikalni vanćelijski matriks (aECM) unutrašnjeg uha, koji kontaktira stereocilijske snopove specijalizovane senzorne trepljaste ćelije. Zvuk inducira kretanje ovih ćelija u odnosu na membranu tektora, odbija od stereocilija i dovodi do fluktuacija u potencijalu membrane trepljaste ćelije, pretvarajući zvuk u električne signale. Alfa-tektorin je jedna od glavnih nekolagenskih komponenti tektorske membrane. Pokazalo se da su mutacije u TECTA genu odgovorne za autosomno dominantno nesindromsko oštećenje sluha i recesivni oblik senzorinervnu predjezičnu nesindromsku gluhoću.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109927 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037705 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Hughes DC, Legan PK, Steel KP, Richardson GP (Apr 1998). "Mapping of the alpha-tectorin gene (TECTA) to mouse chromosome 9 and human chromosome 11: a candidate for human autosomal dominant nonsyndromic deafness". Genomics. 48 (1): 46–51. doi:10.1006/geno.1997.5159. PMID 9503015.
  6. ^ Verhoeven K, Van Laer L, Kirschhofer K, Legan PK, Hughes DC, Schatteman I, Verstreken M, Van Hauwe P, Coucke P, Chen A, Smith RJ, Somers T, Offeciers FE, Van de Heyning P, Richardson GP, Wachtler F, Kimberling WJ, Willems PJ, Govaerts PJ, Van Camp G (maj 1998). "Mutations in the human alpha-tectorin gene cause autosomal dominant non-syndromic hearing impairment". Nat Genet. 19 (1): 60–2. doi:10.1038/ng0598-60. PMID 9590290. S2CID 24814696.
  7. ^ a b "Entrez Gene: TECTA tectorin alpha".
  8. ^ "UniProt, O75443". Pristupljeno 27. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi