Podjedinica alfa mitohondrijsko-preradne peptidaze je enzim koji je kod ljudi kodiran genom PMPCA.[5][6][7] Gen PMPCA kodira protein koji je član porodice peptidaza M16. Ovaj protein se nalazi u mitohondrijskom matriksu i katalizira cijepanje vodećih peptida prekursorskih proteina koji su tek uneseni u mitohondrije, iako funkcionira samo kao dio heterodimernog kompleksa.

PMPCA
Identifikatori
AliasiPMPCA
Vanjski ID-jeviOMIM: 613036 MGI: 1918568 HomoloGene: 6078 GeneCards: PMPCA
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za PMPCA
Genomska lokacija za PMPCA
Bend9q34.3Početak136,410,641 bp[1]
Kraj136,423,761 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za PMPCA
Genomska lokacija za PMPCA
Bend2|2 A3Početak26,279,351 bp[2]
Kraj26,287,134 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0070122 peptidase activity
hydrolase activity
metallopeptidase activity
metalloendopeptidase activity
vezivanje iona cinka
vezivanje iona metala
catalytic activity
endopeptidase activity
Ćelijska komponenta mitochondrial matrix
mitohondrija
membrana
mitochondrial inner membrane
Vanćelijsko
mitochondrial processing peptidase complex
Biološki proces Proteoliza
protein processing involved in protein targeting to mitochondrion
mitochondrial calcium ion transmembrane transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001282944
NM_001282946
NM_015160

NM_173180

RefSeq (bjelančevina)

NP_001269873
NP_001269875
NP_055975

NP_775272

Lokacija (UCSC)Chr 9: 136.41 – 136.42 MbChr 2: 26.28 – 26.29 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 525 aminokiselina, а molekulska težina 58.253 Da.[8]

1020304050
MAAVVLAATRLLRGSGSWGCSRLRFGPPAYRRFSSGGAYPNIPLSSPLPG
VPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILINSGSRY
EAKYLSGIAHFLEKLAFSSTARFDSKDEILLTLEKHGGICDCQTSRDTTM
YAVSADSKGLDTVVALLADVVLQPRLTDEEVEMTRMAVQFELEDLNLRPD
PEPLLTEMIHEAAYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDR
MVLAGVGVEHEHLVDCARKYLLGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGIAKL
ERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSF
SAGGPGKGMFSRLYLNVLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPRQ
VREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVG
RQVLATRSRKLPHELCTLIRNVKPEDVKRVASKMLRGKPAVAALGDLTDL
PTYEHIQTALSSKDGRLPRTYRLFR

Struktura

uredi

Podjedinica alfa prekursorskog peptidaznog proteina je podjedinica za mitohondrijsku preradu veličine 58,2 KDa i sastavljena je od 525 aminokiselina. Proteinski prekursor sadrži 33-aminokiselinski N-terminalni fragment kao sekvencu za ciljanje mitohondrija. Nakon cijepanja, zreli protein PMPCA je veličine 54,6 KDa i ima teorijsku pI od 5,88.

Funkcija

uredi

Peptidaza za preradu mitohondrija (MPP) je metaloendopeptidaza koja sadrži dvije strukturno povezane podjedinice, podjedinicu alfa i peptidaznu podjedinicu beta za preradu mitohondrija, koje u predviđenoj katalitskoj funkciji djeluju zajedno.[9] Sadrži katalitsko mjesto, PMPCB protein podjedinice beta koji cijepa predsekvence (tranzitne peptide) iz prekursora mitohondrijskih proteina i oslobađa tranzitne peptide N-terminala iz proteinskog prekursora unesenih u mitohondrije, obično s argom u položaju P2.

Interakcije

uredi

Kao podjedinica alfa peptidaze za preradu mitohondrija, PMPCA tvori heterodimer sa podjedinicom PMPCB.

Klinički značaj

uredi

Većina mitohondrijskih proteina je jedarno kodirana, što zahtijeva pravilnu translokaciju proteina koji ciljaju na mitohondrije. Mnogi mitohondrijski proteini sintetizirani su u obliku prekursora koji sadrži sekvence usmjerene na mitohondrije. Ove prekursore obično cijepaju peptidaze i proteaze, prije nego što stignu na svoja podorganelna mjesta.

Vjerojatno je da je promijenjena aktivnost mitohondrijskih preradmih peptidaza bitna za osiguravanje pravilnog sazrijevanja mitohondrijskih proteina i da promijenjena aktivnosti ovih proteaza ima dramatične učinke na aktivnost, stabilnost i sastavljanje mitohondrijskih proteina. Dokazi su pokazali da je MPP uključen u proteolitsko sazrijevanje frataksina, proteina odgovornog za homeostazu gvožđa.[10] U skladu s tim, pokazalo se da je nedostatak MPP uključen u Friedreichovu ataksiju, autosomni recesivni neurodegenerativni poremećaj.[11][12]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165688 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026926 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (Mar 1996). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1". DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093/dnares/2.4.167. PMID 8590280.
  6. ^ Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, Tabata S, Ishikawa K, Kawarabayasi Y, Kotani H, et al. (Jul 1995). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. III. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0081-KIAA0120) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1". DNA Res. 2 (1): 37–43. doi:10.1093/dnares/2.1.37. PMID 7788527.
  7. ^ "Entrez Gene: PMPCA peptidase (mitochondrial processing) alpha".
  8. ^ "UniProt, Q10713". Pristupljeno 11. 9. 2021.
  9. ^ Teixeira PF, Glaser E (Feb 2013). "Processing peptidases in mitochondria and chloroplasts". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 1833 (2): 360–70. doi:10.1016/j.bbamcr.2012.03.012. PMID 22495024.
  10. ^ Branda SS, Yang ZY, Chew A, Isaya G (Jun 1999). "Mitochondrial intermediate peptidase and the yeast frataxin homolog together maintain mitochondrial iron homeostasis in Saccharomyces cerevisiae". Human Molecular Genetics. 8 (6): 1099–110. doi:10.1093/hmg/8.6.1099. PMID 10332043.
  11. ^ Cavadini P, Adamec J, Taroni F, Gakh O, Isaya G (Dec 2000). "Two-step processing of human frataxin by mitochondrial processing peptidase. Precursor and intermediate forms are cleaved at different rates". The Journal of Biological Chemistry. 275 (52): 41469–75. doi:10.1074/jbc.M006539200. PMID 11020385.
  12. ^ Patel PI, Isaya G (Jul 2001). "Friedreich ataxia: from GAA triplet-repeat expansion to frataxin deficiency". American Journal of Human Genetics. 69 (1): 15–24. doi:10.1086/321283. PMC 1226030. PMID 11391483.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi