PLVAP

gen koji kodira protein u vrsti Homo sapiens

Protein plazmalemske vezikule je protein koji je kod ljudi kodiran genom PLVAP.[5][6]

PLVAP
Identifikatori
AliasiPLVAP, FELS, PV-1, PV1, gp68, protein povezan s veziklom plazmaleme, DIAR10
Vanjski ID-jeviOMIM: 607647 MGI: 1890497 HomoloGene: 10578 GeneCards: PLVAP
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za PLVAP
Genomska lokacija za PLVAP
Bend19p13.11Početak17,351,450 bp[1]
Kraj17,377,342 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za PLVAP
Genomska lokacija za PLVAP
Bend8 B3.3|8 34.43 cMPočetak71,950,409 bp[2]
Kraj71,964,396 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
protein homodimerization activity
Ćelijska komponenta citoplazma
perinuklearno područje citoplazme
Kaveole
integral component of membrane
cell surface
ćelijska membrana
Egzosom
membrana
Biološki proces tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
protein kinase C signaling
MAPK cascade
positive regulation of cellular extravasation
GO:0007571 developmental process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_031310

NM_032398

RefSeq (bjelančevina)

NP_112600

NP_115774

Lokacija (UCSC)Chr 19: 17.35 – 17.38 MbChr 8: 71.95 – 71.96 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Tkivna specifičnost

uredi

Gen PLVAP eksprimira se u plućima, bubrezima, srcu, aorti, posteljici, mišićima, hipofizi, nadbubrežnim i mliječnim žlijezdama, bešici, limfnim čvorovima, koštanoj srži, dušniku, gastrointestinalnom traktu, jetri i tumorskom endotelu.

Struktura

uredi

Ovaj glikoprotein sastoji se od 442 aminokiseline, uključujuči malu N-terminalnu regiju, jedan transmembranski fragment i C-terminalni vanćelijski domen. Vanćelijski domen sadrži četiri N-glikozilacijska mjesta i dva velika super namotana alfa-heliksna domena, što ukazuje na štapičastu strukturu proteina. Veličina proteina je, ovisno o nivou glikozilacije, od 50 do 60 kDa.

Aminokiselinska sekvenca
Simboli
1020304050
MGLAMEHGGSYARAGGSSRGCWYYLRYFFLFVSLIQFLIILGLVLFMVYG
NVHVSTESNLQATERRAEGLYSQLLGLTASQSNLTKELNFTTRAKDAIMQ
MWLNARRDLDRINASFRQCQGDRVIYTNNQRYMAAIILSEKQCRDQFKDM
NKSCDALLFMLNQKVKTLEVEIAKEKTICTKDKESVLLNKRVAEEQLVEC
VKTRELQHQERQLAKEQLQKVQALCLPLDKDKFEMDLRNLWRDSIIPRSL
DNLGYNLYHPLGSELASIRRACDHMPSLMSSKVEELARSLRADIERVARE
NSDLQRQKLEAQQGLRASQEAKQKVEKEAQAREAKLQAECSRQTQLALEE
KAVLRKERDNLAKELEEKKREAEQLRMELAIRNSALDTCIKTKSQPMMPV
SRPMGPVPNPQPIDPASLEEFKRKILESQRPPAGIPVAPSSG

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130300 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034845 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Stan RV, Arden KC, Palade GE (Jun 2001). "cDNA and protein sequence, genomic organization, and analysis of cis regulatory elements of mouse and human PLVAP genes". Genomics. 72 (3): 304–13. doi:10.1006/geno.2000.6489. PMID 11401446.
  6. ^ "Entrez Gene: PLVAP plasmalemma vesicle associated protein".

Dopunska literatura

uredi