Čvorovski modulator 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NOMO1.[5][6][7]

NOMO1
Identifikatori
AliasiNOMO1
Vanjski ID-jeviOMIM: 609157 MGI: 2385850 HomoloGene: 13810 GeneCards: NOMO1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za NOMO1
Genomska lokacija za NOMO1
Bend16p13.11Početak14,833,721 bp[1]
Kraj14,896,157 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za NOMO1
Genomska lokacija za NOMO1
Bend7 B3|7 29.66 cMPočetak45,683,122 bp[2]
Kraj45,733,636 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija carbohydrate binding
molecular function
Ćelijska komponenta membrana
integral component of membrane
endoplasmic reticulum membrane
Biološki proces GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_014287

NM_153057

RefSeq (bjelančevina)

NP_055102

NP_694697

Lokacija (UCSC)Chr 16: 14.83 – 14.9 MbChr 7: 45.68 – 45.73 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira protein za koji se prvobitno mislilo da je povezan sa porodicom gena kolagenaza. Jedan je od tri vrlo slična gena u regiji duplikacije na p kraku hromosoma 16. Ova tri gena kodiraju blisko povezane proteine koji mogu imati istu funkciju. Protein kodiran jednim od ovih gena identificiran je kao dio proteinskog kompleksa koji učestvuje u signalnom putu čvorova tokom razvoja kičmenjaka. Mutacije u ABCC6, koje se nalazi u blizini, umjesto mutacije ovog gena povezane su sa pseudoxanthoma elasticum (PXE).[7]

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.222 aminokiseline, a molekulska težina 134.324 Da [8].

Simboli
1020304050
MLVGQGAGPLGPAVVTAAVVLLLSGVGPAHGSEDIVVGCGGFVKSDVEIN
YSLIEIKLYTKHGTLKYQTDCAPNNGYFMIPLYDKGDFILKIEPPLGWSF
EPTTVELHVDGVSDICTKGGDINFVFTGFSVNGKVLSKGQPLGPAGVQVS
LRNTGTEAKIQSTVTQPGGKFAFFKVLPGDYEILATHPTWALKEASTTVR
VTNSNANAASPLIVAGYNVSGSVRSDGEPMKGVKFLLFSSLVTKEDVLGC
NVSPVPGFQPQDESLVYLCYTVSREDGSFSFYSLPSGGYTVIPFYRGERI
TFDVAPSRLDFTVEHDSLKIEPVFHVMGFSVTGRVLNGPEGDGVPEAVVT
LNNQIKVKTKADGSFRLENITTGTYTIHAQKEHLYFETVTIKIAPNTPQL
ADIIATGFSVCGQISIIRFPDTVKQMNKYKVVLSSQDKDKSLVTVETDAH
GSFCFKAKPGTYKVQVMVPEAETRAGLTLKPQTFPLTVTNRPMMDVAFVQ
FLASVSGKVSCLDTCGDLLVTLQSLSRQGEKRSLQLSGKVNAMTFTFDNV
LPGKYKISIMHEDWCWKNKSLEVEVLEDDMSAVEFRQTGYMLRCSLSHAI
TLEFYQDGNGRENVGIYNLSKGVNRFCLSKPGVYKVTPRSCHRFEQAFYT
YDTSSPSILTLTAIRHHVLGTITTDKMMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLK
SVQELRREQQLAEIEARRQEREKNGNEEGEERMTKPPVQEMVDELQGPFS
YDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVSGESCPGKLIEIHGKAG
LFLEGQIHPELEGVEIVISEKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYT
VTSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGG
LFRSNLLTQDNGILTFSNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSSQMIEVQEGQNL
KITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGVAMEAVGQNDCSIYGEDTVTDEE
GKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIV
FRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWVKLYKSENLDNPIQTVSLGQSLFFHF
PPLLRDGENYVVLLDSTLPRSQYDYILPQVSFTAVGYHKHITLIFNPTRK
LPEQDIAQGSYIALPLTLLVLLAGYNHDKLIPLLLQLTSRLQGVRALGQA
ASDNSGPEDAKRQAKKQKTRRT

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000103512 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030835 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Templeton NS, Rodgers LA, Levy AT, Ting KL, Krutzsch HC, Liotta LA, Stetler-Stevenson WG (Mar 1992). "Cloning and characterization of a novel human cDNA that has DNA similarity to the conserved region of the collagenase gene family". Genomics. 12 (1): 175–6. doi:10.1016/0888-7543(92)90425-R. PMID 1310294.
  6. ^ Haffner C, Frauli M, Topp S, Irmler M, Hofmann K, Regula JT, Bally-Cuif L, Haass C (Aug 2004). "Nicalin and its binding partner Nomo are novel Nodal signaling antagonists". EMBO J. 23 (15): 3041–50. doi:10.1038/sj.emboj.7600307. PMC 514924. PMID 15257293.
  7. ^ a b "Entrez Gene: NOMO1 NODAL modulator 1".
  8. ^ "UniProt, Q15155". Pristupljeno 8. 7. 2021.

Dopunska literatura uredi