Neuronski navigator 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NAV1 sa hromosoma 1.[5][6][7]

NAV1
Identifikatori
AliasiNAV1
Vanjski ID-jeviOMIM: 611628 MGI: 2183683 HomoloGene: 10719 GeneCards: NAV1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za NAV1
Genomska lokacija za NAV1
Bend1q32.1Početak201,622,885 bp[1]
Kraj201,826,969 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za NAV1
Genomska lokacija za NAV1
Bend1|1 E4Početak135,362,318 bp[2]
Kraj135,615,843 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
microtubule cytoskeleton
Mikrotubula
citoskelet
axon initial segment
Biološki proces multicellular organism development
Ćelijska diferencijacija
neuron migration
microtubule bundle formation
nervous system development
neurogenesis
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001167738
NM_020443

NM_173437

RefSeq (bjelančevina)

NP_001161210
NP_065176

NP_775613

Lokacija (UCSC)Chr 1: 201.62 – 201.83 MbChr 1: 135.36 – 135.62 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.877 aminokiselina, a molekulska težina 202.472 Da.[8]

1020304050
MLGSSVKSVQPEVELSSGGGDEGADEPRGAGRKAAAADGRGMLPKRAKAP
GGGGGMAKASAAELKVFKSGSVDSRVPGGPPASNLRKQKSLTNLSFLTDS
EKKLQLYEPEWSDDMAKAPKGLGKVGSKGREAPLMSKTLSKSEHSLFQAK
GSPAGGAKTPLAPLAPNLGKPSRIPRGPYAEVKPLSKAPEAAVSEDGKSD
DELLSSKAKAQKSSGPVPSAKGQEERAFLKVDPELVVTVLGDLEQLLFSQ
MLDPESQRKRTVQNVLDLRQNLEETMSSLRGSQVTHSSLEMTCYDSDDAN
PRSVSSLSNRSSPLSWRYGQSSPRLQAGDAPSVGGSCRSEGTPAWYMHGE
RAHYSHTMPMRSPSKLSHISRLELVESLDSDEVDLKSGYMSDSDLMGKTM
TEDDDITTGWDESSSISSGLSDASDNLSSEEFNASSSLNSLPSTPTASRR
NSTIVLRTDSEKRSLAESGLSWFSESEEKAPKKLEYDSGSLKMEPGTSKW
RRERPESCDDSSKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSA
LKVAGKPEGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPS
TSGSFGYKKPPPATGTATVMQTGGSATLSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLD
VSNSAEPGFLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGGRGGPRPVSSSIDP
SLLSTKQGGLTPSRLKEPTKVASGRTTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDS
DNISLKSIGSPESTPKNQASHPTATKLAELPPTPLRATAKSFVKPPSLAN
LDKVNSNSLDLPSSSDTTHASKVPDLHATSSASGGPLPSCFTPSPAPILN
INSASFSQGLELMSGFSVPKETRMYPKLSGLHRSMESLQMPMSLPSAFPS
STPVPTPPAPPAAPTEEETEELTWSGSPRAGQLDSNQRDRNTLPKKGLRY
QLQSQEETKERRHSHTIGGLPESDDQSELPSPPALPMSLSAKGQLTNIVS
PTAATTPRITRSNSIPTHEAAFELYSGSQMGSTLSLAERPKGMIRSGSFR
DPTDDVHGSVLSLASSASSTYSSAEERMQSEQIRKLRRELESSQEKVATL
TSQLSANANLVAAFEQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLK
KKNSEAQAVIQGALNASETTPKELRIKRQNSSDSISSLNSITSHSSIGSS
KDADAKKKKKKSWVYELRSSFNKAFSIKKGPKSASSYSDIEEIATPDSSA
PSSPKLQHGSTETASPSIKSSTSSSVGTDVTEGPAHPAPHTRLFHANEEE
EPEKKEVSELRSELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQLRETMHNMQLEVD
LLKAENDRLKVAPGPSSGSTPGQVPGSSALSSPRRSLGLALTHSFGPSLA
DTDLSPMDGISTCGPKEEVTLRVVVRMPPQHIIKGDLKQQEFFLGCSKVS
GKVDWKMLDEAVFQVFKDYISKMDPASTLGLSTESIHGYSISHVKRVLDA
EPPEMPPCRRGVNNISVSLKGLKEKCVDSLVFETLIPKPMMQHYISLLLK
HRRLVLSGPSGTGKTYLTNRLAEYLVERSGREVTEGIVSTFNMHQQSCKD
LQLYLSNLANQIDRETGIGDVPLVILLDDLSEAGSISELVNGALTCKYHK
CPYIIGTTNQPVKMTPNHGLHLSFRMLTFSNNVEPANGFLVRYLRRKLVE
SDSDINANKEELLRVLDWVPKLWYHLHTFLEKHSTSDFLIGPCFFLSCPI
GIEDFRTWFIDLWNNSIIPYLQEGAKDGIKVHGQKAAWEDPVEWVRDTLP
WPSAQQDQSKLYHLPPPTVGPHSIASPPEDRTVKDSTPSSLDSDPLMAML
LKLQEAANYIESPDRETILDPNLQATL

Funkcija

uredi

Ovaj gen pripada porodici neuronskih navigatora i eksprimiran je pretežno u nervnom sistemu. Kodirani protein sadrži upredene domene i konzervirasni domen AAA, karakterističan za ATPaze povezane sa različitim ćelijskim aktivnostima. Ovaj gen sličan je unc-53, genu Caenorhabditis elegans, koji je uključen u navigaciju aksona. Tačna funkcija ovog gena nije poznata.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134369 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009418 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Maes T, Barcelo A, Buesa C (Jun 2002). "Neuron navigator: a human gene family with homology to unc-53, a cell guidance gene from Caenorhabditis elegans". Genomics. 80 (1): 21–30. doi:10.1006/geno.2002.6799. PMID 12079279.
  6. ^ Coy JF, Wiemann S, Bechmann I, Bachner D, Nitsch R, Kretz O, Christiansen H, Poustka A (Jun 2002). "Pore membrane and/or filament interacting like protein 1 (POMFIL1) is predominantly expressed in the nervous system and encodes different protein isoforms". Gene. 290 (1–2): 73–94. doi:10.1016/S0378-1119(02)00567-X. PMID 12062803.
  7. ^ a b "Entrez Gene: NAV1 neuron navigator 1".
  8. ^ "UniProt, Q8NEY1" (jezik: engleski). Pristupljeno 14. 12. 2021.

Dopunska literatura

uredi