Lizofosfolipid-aciltransferaza 5 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom LPCAT3.[5][6][7][8]

MBOAT5
Identifikatori
AliasiLPCAT3
Vanjski ID-jeviOMIM: 611950 MGI: 1315211 HomoloGene: 14678 GeneCards: LPCAT3
EC broj2.3.1.23
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za MBOAT5
Genomska lokacija za MBOAT5
Bend12p13.31Početak6,976,185 bp[1]
Kraj7,018,477 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za MBOAT5
Genomska lokacija za MBOAT5
Bend6 F2|6 59.17 cMPočetak124,639,990 bp[2]
Kraj124,681,381 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
1-acylglycerophosphocholine O-acyltransferase activity
acyltransferase activity
2-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity
1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endoplasmic reticulum membrane
membrana
Endoplazmatski retikulum
Biološki proces phosphatidylserine acyl-chain remodeling
phosphatidylethanolamine acyl-chain remodeling
phosphatidylcholine acyl-chain remodeling
regulation of plasma lipoprotein particle levels
lipid metabolism
phospholipid biosynthetic process
phospholipid metabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005768

NM_145130

RefSeq (bjelančevina)

NP_005759

NP_660112

Lokacija (UCSC)Chr 12: 6.98 – 7.02 MbChr 6: 124.64 – 124.68 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Homologan je sa drugim O-aciltransferazama vezanim za membranu.

Pregled

uredi

Ljudski hromosom 12 sadrži više od 1.400 kodirajućih gena i 487 lokusa koji su direktno uključeni u ljudske bolese. Dugi (q) krak hromooma 12 sadrži jedan od najvećih blokova neravnoteže povezivanja koji se nalazi u ljudskom genomu. Gotova sekvencu ljudskog hromosoma 12, koja je dovršena do visokog kvaliteta i obuhvata približno 132 megabaze, što predstavlja približno 4,5% ljudskog genoma. Poravnavanje sekvence ljudskog hromosoma 12 sa kičmenjacima otkriva porijeklo pojedinačnih segmenata kod kokoši i jedinstvenu historiju preuređivanja putem loza glodara i primata. Stopa zamjena nukleotida u novijoj evolucijskoj povijesti pokazuje opće usporavanje u hominida u odnosu na primate i glodare.

Nakon završetka nacrta sekvence ljudsog genoma, Međunarodni konzorcij za sekvenciranje ljudskog genoma nastavio je s dovršavanjem i označavanjem svakog od 23 hromosoma koji čine ljudski genom.

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 487 aminokiselina, a molekulska težina 56.035 Da.[9]

1020304050
MASSAEGDEGTVVALAGVLQSGFQELSLNKLATSLGASEQALRLIISIFL
GYPFALFYRHYLFYKETYLIHLFHTFTGLSIAYFNFGNQLYHSLLCIVLQ
FLILRLMGRTITAVLTTFCFQMAYLLAGYYYTATGNYDIKWTMPHCVLTL
KLIGLAVDYFDGGKDQNSLSSEQQKYAIRGVPSLLEVAGFSYFYGAFLVG
PQFSMNHYMKLVQGELIDIPGKIPNSIIPALKRLSLGLFYLVGYTLLSPH
ITEDYLLTEDYDNHPFWFRCMYMLIWGKFVLYKYVTCWLVTEGVCILTGL
GFNGFEEKGKAKWDACANMKVWLFETNPRFTGTIASFNINTNAWVARYIF
KRLKFLGNKELSQGLSLLFLALWHGLHSGYLVCFQMEFLIVIVERQAARL
IQESPTLSKLAAITVLQPFYYLVQQTIHWLFMGYSMTAFCLFTWDKWLKV
YKSIYFLGHIFFLSLLFILPYIHKAMVPRKEKLKKME
Simboli

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111684 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000004270 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ansari-Lari MA, Muzny DM, Lu J, Lu F, Lilley CE, Spanos S, Malley T, Gibbs RA (Sep 1996). "A gene-rich cluster between the CD4 and triosephosphate isomerase genes at human chromosome 12p13". Genome Res. 6 (4): 314–26. doi:10.1101/gr.6.4.314. PMID 8723724.
  6. ^ Ansari-Lari MA, Shen Y, Muzny DM, Lee W, Gibbs RA (maj 1997). "Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination". Genome Res. 7 (3): 268–80. doi:10.1101/gr.7.3.268. PMID 9074930.
  7. ^ Zhao Y, Chen YQ, Bonacci TM, Bredt DS, Li S, Bensch WR, Moller DE, Kowala M, Konrad RJ, Cao G (Mar 2008). "Identification and characterization of a major liver lysophosphatidylcholine acyltransferase". J Biol Chem. 283 (13): 8258–65. doi:10.1074/jbc.M710422200. PMID 18195019.
  8. ^ "Entrez Gene: MBOAT5 membrane bound O-acyltransferase domain containing 5".
  9. ^ "UniProt, Q6P1A2". Pristupljeno 11. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi
  • LPCAT3 lokacija ljudskog genoma UCSC Genome Browser.

LPCAT3 human gene details in the UCSC Genome Browser.