Leucinski bogati protein 23 sa ponavljanjem je protein koji je kod ljudi kodiran genom LRRC23.[5][6][7]

LRRC23
Identifikatori
AliasiLRRC23
Vanjski ID-jeviMGI: 1315192 HomoloGene: 5082 GeneCards: LRRC23
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za LRRC23
Genomska lokacija za LRRC23
Bend12p13.31Početak6,873,569 bp[1]
Kraj6,914,241 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za LRRC23
Genomska lokacija za LRRC23
Bend6 F2|6 59.17 cMPočetak124,746,826 bp[2]
Kraj124,756,690 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija molekularna funkcija
Ćelijska komponenta ćelijska komponenta
citoplazma
citosol
Biološki proces GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_201650
NM_001135217
NM_006992
NM_181613

NM_013588
NM_001302555

RefSeq (bjelančevina)

NP_001128689
NP_008923
NP_964013

NP_001289484

Lokacija (UCSC)Chr 12: 6.87 – 6.91 MbChr 6: 124.75 – 124.76 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 343 aminokiseline, a molekulska težina 39.761 Da.[8]

1020304050
MSDEDDLEDSEPDQDDSEKEEDEKETEEGEDYRKEGEEFPEEWLPTPLTE
DMMKEGLSLLCKTGNGLAHAYVKLEVKERDLTDIYLLRSYIHLRYVDISE
NHLTDLSPLNYLTHLLWLKADGNRLRSAQMNELPYLQIASFAYNQITDTE
GISHPRLETLNLKGNSIHMVTGLDPEKLISLHTVELRGNQLESTLGINLP
KLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLSGFSREMKSLQYL
NLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYLE
RLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI
Simboli

Protein uredi

 
Trodimenzijska struktura LRRC23, prema BLAST-u

Iako je stvarna struktura LRRC23 nepoznata, usporedba sa kristalnim strukturama različitih sličnih proteina, poput 2OMW A (e-vrijednost 1,00e-17) otkriva strukturu tipsku za druge proteine bogate leucinom. Naizmjenični beta-listovi i zavojnice stvaraju spiralni peptidni lanac koji tvori lučni oblik s beta-listovima koji zauzimaju konkavnu površinu.[9]

Poravnata struktura 2OMW_A s LRRC23 obuhvata aminokiseline 72-272 proteina LRRC23. Konzervirane sekvence označeni su žutom bojom, pokazujući pravilnost razmaka i unutar ponovljajuće strukture. Ovaj model je nastao korišćenjem softvera Cn3D koji je obezbedio Nacionalni centar za biotehnološke informacije (NCBI).

 

Funkcija uredi

Funkcija LRRC23 je nepoznata. Član je proteinskih ponavljanja bogatog leucinom, koji su poznati po učešću u interakcijama protein-protein. Eksperimentalni dokazi ukazuju na to da LRRC23 stupa u interakciju s proteinom CD28, na putu koji je povezan sa imunskim sistemom i razvojem regulatornih T-ćelija koje kontroliraju spontanu autoimunsku bolest.[10]

Ljudski genom proizvodi tri poznate varijante LRRC23.[7] Najveća prerađena varijanta, varijanta 3, sadrži osam egzona. Varijante 1 i 2 koriste alternativne prve egzone, a varijanta 2 isključuje sedmi egzon, dajući mu ukupno sedam egzona koji čine iRNK.

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000010626 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030125 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Tzachanis D, Berezovskaya A, Nadler LM, Boussiotis VA (Feb 2002). "Blockade of B7/CD28 in mixed lymphocyte reaction cultures results in the generation of alternatively activated macrophages, which suppress T-cell responses". Blood. 99 (4): 1465–73. doi:10.1182/blood.V99.4.1465. PMID 11830501.
  6. ^ Chang TT, Kuchroo VK, Sharpe AH (Feb 2002). "Role of the B7-CD28/CTLA-4 pathway in autoimmune disease". Signal Transduction Pathways in Autoimmunity. Current Directions in Autoimmunity. 5. str. 113–30. doi:10.1159/000060550. ISBN 3-8055-7308-1. PMID 11826754.
  7. ^ a b "Entrez Gene: LRRC23 leucine rich repeat containing 23".
  8. ^ "UniProt, Q53EV4". Pristupljeno 11. 8. 2021.
  9. ^ NCBI Structure CBlast https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cblast/cblast.cgi?client=entrez&query_gi=206725447&hit=149242643&hsp=1&output=html&pagenum=1&epp=20&sort=evalue&view=graphic&subset=allmmdb
  10. ^ Salomon B, Lenschow DJ, Rhee L, Ashourian N, Singh B, Sharpe A, Bluestone JA (Apr 2000). "B7/CD28 costimulation is essential for the homeostasis of the CD4+CD25+ immunoregulatory T cells that control autoimmune diabetes". Immunity. 12 (4): 431–40. doi:10.1016/S1074-7613(00)80195-8. PMID 10795741.

Dopunska literatura uredi

Vanjski linkovi uredi