Lin-28 homolog B jest protein koji je kod ljudi kodiran genom LIN28B. [5]

LIN28B
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4A4I

Identifikatori
AliasiLIN28B
Vanjski ID-jeviOMIM: 611044 MGI: 3584032 HomoloGene: 47607 GeneCards: LIN28B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za LIN28B
Genomska lokacija za LIN28B
Bend6q16.3-q21Početak104,936,616 bp[1]
Kraj105,083,332 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za LIN28B
Genomska lokacija za LIN28B
Bend10|10 B2Početak45,252,716 bp[2]
Kraj45,362,491 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
vezivanje iona cinka
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje iona metala
vezivanje sa RNK
nucleic acid binding
Ćelijska komponenta citoplazma
jedro
Jedarce
citosol
Biološki proces pre-miRNA processing
miRNA catabolic process
Utišavanje gena
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
RNA 3'-end processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001004317

NM_001031772
NM_001033152

RefSeq (bjelančevina)

NP_001004317

NP_001026942

Lokacija (UCSC)Chr 6: 104.94 – 105.08 MbChr 10: 45.25 – 45.36 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 250 aminokiselina, а molekulska težina 27.084 Da.[6]

1020304050
MAEGGASKGGGEEPGKLPEPAEEESQVLRGTGHCKWFNVRMGFGFISMIN
REGSPLDIPVDVFVHQSKLFMEGFRSLKEGEPVEFTFKKSSKGLESIRVT
GPGGSPCLGSERRPKGKTLQKRKPKGDRCYNCGGLDHHAKECSLPPQPKK
CHYCQSIMHMVANCPHKNVAQPPASSQGRQEAESQPCTSTLPREVGGGHG
CTSPPFPQEARAEISERSGRSPQEASSTKSSIAPEEQSKKGPSVQKRKKT

Funkcija

uredi

Protein kodiran ovim genom pripada porodici lin-28, koju karakterizira domen hladnog šoka i para CCHC domen cinkovog prsta. Ovaj gen je visoko eksprimiran u sjemenicima, fetusnoj jetri, posteljici, te u primarnim ljudskim tumorima i linijama ćelija raka. Negativno je reguliran preko miRNK koje cilja na mjesta u 3'UTR, a prekomjerna ekspresija ovog gena u primarnim tumorima povezana je s potiskivanjem porodičn ih let-7 mikroRNK i uklanjanje depresije ciljeva let-7, što olakšava ćelijsku transformaciju.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187772 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000063804 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Lin-28 homolog B". Pristupljeno 6. 3. 2016.
  6. ^ "UniProt, Q6ZN17" (jezik: engleski). Pristupljeno 8. 10. 2021.

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.