LIM-homeoboks 9 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom LHX9 sa hromosoma 1.[5]

LHX9
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2DMQ

Identifikatori
AliasiLHX9
Vanjski ID-jeviOMIM: 606066 MGI: 1316721 HomoloGene: 7816 GeneCards: LHX9
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za LHX9
Genomska lokacija za LHX9
Bend1q31.3Početak197,911,902 bp[1]
Kraj197,935,478 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za LHX9
Genomska lokacija za LHX9
Bend1|1 E4Početak138,825,186 bp[2]
Kraj138,848,577 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija sequence-specific DNA binding
vezivanje sa DNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0001106 transcription corepressor activity
vezivanje iona metala
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Ćelijska komponenta jedro
Biološki proces Ćelijska proliferacija
male gonad development
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
female gonad development
gonad morphogenesis
dorsal spinal cord interneuron anterior axon guidance
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
neuron differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001014434
NM_020204
NM_001370213

NM_001025565
NM_001042577
NM_010714

RefSeq (bjelančevina)

NP_001014434
NP_064589
NP_001357142

NP_001020736
NP_001036042
NP_034844

Lokacija (UCSC)Chr 1: 197.91 – 197.94 MbChr 1: 138.83 – 138.85 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 397 aminokiselina, a molekulska težina 43.976 Da.[6]

1020304050
MEIVGCRAEDNSCPFRPPAMLFHGISGGHIQGIMEEMERRSKTEARLAKG
AQLNGRDAGMPPLSPEKPALCAGCGGKISDRYYLLAVDKQWHLRCLKCCE
CKLALESELTCFAKDGSIYCKEDYYRRFSVQRCARCHLGISASEMVMRAR
DSVYHLSCFTCSTCNKTLTTGDHFGMKDSLVYCRAHFETLLQGEYPPQLS
YTELAAKSGGLALPYFNGTGTVQKGRPRKRKSPALGVDIVNYNSGCNENE
ADHLDRDQQPYPPSQKTKRMRTSFKHHQLRTMKSYFAINHNPDAKDLKQL
AQKTGLTKRVLQVWFQNARAKFRRNLLRQENGGVDKADGTSLPAPPSADS
GALTPPGTATTLTDLTNPTITVVTSVTSNMDSHESGSPSQTTLTNLF

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira člana porodice gena LIM-homeoboksa razvojno eksprimiranih transkripcijskih faktoraa. Kodirani protein sadrži homeodomen i dva LIM-domena koji se vezuju za cistein, uključene u interakcije protein-protein. Protein je vrlo sličan proteinu miša koji uzrokuje agenezu gonada kada je inaktiviran, što ukazuje na ulogu u razvoju gonada. Alternativna prerada rezultira višestrukim varijantama transkripta.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143355 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019230 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: LIM homeobox 9".
  6. ^ "UniProt, Q9NQ69" (jezik: engleski). Pristupljeno 13. 12. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.