Ćelijskopovršinski antigen A33 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GPA33 sa hromosoma 1.[5][6][7]

GPA33
Identifikatori
AliasiGPA33
Vanjski ID-jeviOMIM: 602171 MGI: 1891703 HomoloGene: 4245 GeneCards: GPA33
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za GPA33
Genomska lokacija za GPA33
Bend1q24.1Početak167,052,836 bp[1]
Kraj167,166,479 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za GPA33
Genomska lokacija za GPA33
Bend1 H2.3|1 73.49 cMPočetak165,957,807 bp[2]
Kraj165,994,079 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005814

NM_021610
NM_001360925
NM_001360926

RefSeq (bjelančevina)

NP_005805

NP_067623
NP_001347854
NP_001347855

Lokacija (UCSC)Chr 1: 167.05 – 167.17 MbChr 1: 165.96 – 165.99 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 319 aminokiselina, a molekulska težina 35.632 Da.[8]

1020304050
MVGKMWPVLWTLCAVRVTVDAISVETPQDVLRASQGKSVTLPCTYHTSTS
SREGLIQWDKLLLTHTERVVIWPFSNKNYIHGELYKNRVSISNNAEQSDA
SITIDQLTMADNGTYECSVSLMSDLEGNTKSRVRLLVLVPPSKPECGIEG
ETIIGNNIQLTCQSKEGSPTPQYSWKRYNILNQEQPLAQPASGQPVSLKN
ISTDTSGYYICTSSNEEGTQFCNITVAVRSPSMNVALYVGIAVGVVAALI
IIGIIIYCCCCRGKDDNTEDKEDARPNREAYEEPPEQLRELSREREEEDD
YRQEEQRSTGRESPDHLDQ

Funkcija

uredi

Glikoprotein kodiran ovim genom je antigen ćelijske površine koji je eksprimiran u više od 95% ljudskih karcinom debelog crijeva. Otvoreni okvir čitanja kodira polipeptid od 319 aminokiselina koji ima navodnu sekretornu signalnu sekvencu i tri potencijalna mjesta glikozilacije. Predviđeni zreli protein ima vanćelijsku regiju od 213 aminokiselina, jedan transmembranski domen i unutarćelijski rep od 62 aminokiseline. Sekvenca vanćelijskog regiona sadrži dva domena karakteristična za CD2 podgrupu natporodice imunoglobulina (Ig).[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143167 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000544 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Heath JK, White SJ, Johnstone CN, Catimel B, Simpson RJ, Moritz RL, Tu GF, Ji H, Whitehead RH, Groenen LC, Scott AM, Ritter G, Cohen L, Welt S, Old LJ, Nice EC, Burgess AW (Mar 1997). "The human A33 antigen is a transmembrane glycoprotein and a novel member of the immunoglobulin superfamily". Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (2): 469–74. Bibcode:1997PNAS...94..469H. doi:10.1073/pnas.94.2.469. PMC 19536. PMID 9012807.
  6. ^ Ritter G, Cohen LS, Nice EC, Catimel B, Burgess AW, Moritz RL, Ji H, Heath JK, White SJ, Welt S, Old LJ, Simpson RJ (Sep 1997). "Characterization of posttranslational modifications of human A33 antigen, a novel palmitoylated surface glycoprotein of human gastrointestinal epithelium". Biochem Biophys Res Commun. 236 (3): 682–6. doi:10.1006/bbrc.1997.6966. PMID 9245713.
  7. ^ a b "Entrez Gene: GPA33 glycoprotein A33 (transmembrane)".
  8. ^ "UniProt, Q99795" (jezik: en.). Pristupljeno 11. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi

GPA33 detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.